Istilah-Istilah Biokimia [PDF]

Citation preview

Hal 1 (10604040, M. Fajar G.) (10605090, Devry Andry 1-18) acetyl CoA carboxylase. Merupakan enzim yang mengkatalisis proses sintesis (yang membutuhkan ATP) malonil Ko-A dari asetil Ko-A dan karbon dioksida, dimana berperan dalam menjalankan beberapa tahapan dalam sintesis asam lemak. acetylcholine receptor. Sebuah saluran gerbang ligan yang memungkinkan masuknya ion sodium dalam jumlah besar dan menggerakkan potensial aksi; terdiri dari pentamer subunit polipeptida, saluran terbuka untuk memungkinkan lintasan ion potasium dan sodium dimana dua molekul asetilkolin mengakibatkan terbukanya saluran untuk sementara waktu acetylcholinesterase. Sebuah enzim pada pembelahan sinaptis yang mengubah asetilkolin menjadi kolin dan asetat; kerja dari enzim ini mengakibatkan tertutupnya membran reseptor asetilkolin dengan secara cepat mengurangi konsentrasi dari asetilkolin pada daerah antara membran pre-sinaptik dan post-sinaptik. acetyllysine-binding domain. Sebuah domain yang terdiri dari ikatan tetra heliks yang mengikat peptide-peptida yang mengandung asetillisin. Disebut juga bromodomain. actin. Merupakan protein yang banyak ditemukan pada eukariot; pada otot lurik, membentuk filamen dari sarkomer dan mengaktifkan ATPase dari miosin. actinomycin. Merupakan antibiotik polipeptida dari Streptomyces yang memcegah pemanjangan fase sintesis RNA dengan mengikat DNA heliks ganda melalui interkalasi, sehingga mencegah DNA sebagai templat. action potential. Merupakan bentuk peningkatan potensial membran dan perubahan konduktivitas sodium dan potassium yang dihasilkan dari perubahan permeabilitas ion dari membran akson. Disebut juga impuls saraf. activated carriers. Adalah molekul-molekul kecil yang membawa gugus fungsi teraktivasi yang dapat didonasikan ke molekul lain; sebagai contoh, ATP membawa gugus fosfat teraktivasi dan KoA membawa gugus asil teraktivasi. activated methyl cycle. Adalah sebuah rangkaian reaksi dimana gugus S-metil dari metionin dirubah menjadi bentuk biokimiawi reaktif melalui penyisipan ke dalam gugus adenosil; sebuah gugus S-metil aktif dapat dipindahkan dari S-adenosilmetionin ke molekul akseptor seperti norepinefrin. Tahapan terakhir dari siklus tersebut adalah regenerasi metionin dari homosistein dan N5-metiltetrahidrofolat. activation domain. Merupakan daerah structural dari factor transkripsi yang memfasilitasi transkripsi dalam beberapa bentuk. Lihat juga DNA-binding domain. active site. Merupakan daerah spesifik dari enzim yang mengikat dan mengkatalisis substrat. Hal 2 (10604075 Arliend Widagandini) active transport, Transpor aktif transpor dari ion atau molekul melawan gradient konsentrasi,dimana DG untuk spesies yang berpindah positif;proses ini harus berpasangan dengan input dari energi bebas yang berasal dari sumber seperti ATP, gradient elektrokimia dari Na+ atau K+, atau cahaya



Actomyosin Bentukkompleks in vitro antar myosin dan aktin yang memperlihatkan sifat pasti dari otot,seperti kontraksi pada kehadiran ATP. Acyl adenylate Campuran anhydridedimana kelompok molekul carboxyl terhubung pada kelompok phosphoryl AMP;bentuk dari acyl adenylates berfungsi untuk mengaktifasi kelompok carboxyl dalam reaksi biokimia, seperti pembentukan molekul dari lemak acyl CoA dari asam lemak bebas dan koenzim A. acyl carrier protein, protein pembawa Acyl Bakteri polipeptida yang terhubung pada phosphopantetheine dan bertindak sebagai carrier dari rantai lemak acyl yang sedang tumbuh selama biosintesis dari asam lemak. adaptation, adaptasi Pengaturan ulang level sensitivitas dari reseptor-reseptor dikarenakan kehadiran terusmenerus dari ligand. Dapat disebut juga desentisasi. addition to or formation of double bond, penambahan atau pembentukan ikatan ganda Reaksi dimana suatu kelompok fungsional ditambahkan padaikatan ganda atau kelompok yang dipindahkan dari suatu molekul untuk membentuk ikatan ganda. Adeninylate cyclase Suatu enzim yang membentuk cAMP, pemberi pesan keduadari ATP. Adenylate cyclase cascade Jalur transduksi sinyal yang mempekerjakan cAMP dan serangkaian enzim untuk mengubah (mengkonversikan) sinyal ekstraseluler kepada sinyal intraseluler. adipocytes, adiposit sel mamalia yang merupakan penyimpanan utama untuk triacylglycerols. A-DNA helix Bagian sebelah kanan dari helix ganda terbuat dari untaiantiparalel disatukan oleh pasangan basa A-T dan G-C;lebih lebar dan pendek dari DNA-B dan dapat dilihat padaDNA dehidrasi jugapada bagian untai ganda dari RNA didalam RNA-DNA helix. aerobic, aerob Terdapat oksigen didalamnya. affinity chromatography, kromatografi afinitas Sebuah teknik pemurnian dari protein berdasarkan ketinggian afinitas dari banyak protein untuk kelompokkimia yang spesifik. Kelompok ini terikatpada matriks inest;dan sampel protein diajukan,hanya proteinprotein dengan afinitas untuk kelompok tersebut yang terikat. affinity labeling, pelabelan afinitas Pemetaan sisiaktif dari enzim dengan menggunakan substrat analog yang terikat pada sisi aktif dan membentuk ikatan kovalen dengan asam amino terdekat. Agonists Molekul yang terikat pada protein reseptor dan pemicu jalur sinyal. Alcaptonuria Kelainan penyakit menurun yang tidak berbahaya diakibatkan oleh hasil pemecahan dari tyrosine dan phenylalanine. Hal 3 (10604085, Yenny Indriati B) alcoholic fermentation, fermentasi alkohol. Peristiwa perubahan secara anaerobik dari glukosa menjadi etanol, seiring dengan pembentukan ATP.



aldol condensation, kondensasi aldol. Kombinasi dari dua buah senyawa-senyawa karbomil (aldehid dan keton) menjadi bentuk α -hydroxycarbonyl atau aldol aldose, aldosa. Monosakarida dengan atomkarbon C-1 yang berisi kelompok aldedhid alleles Bentuk lain dari gen pada tempat khusus dari kromosom. allosteric interaction, interaksi alosterik Interaksi antara molekul kecil (ligan) dan sisi dari protein yang mungkin berada jauh dari sisi aktifnya; interaksi ini menyebabkan perubahan penyesuaian dan alterasi yang konsekuen pada aktifitas katalitik protein. α helix Struktur motif bersama pada protein-protein dengan polipeptida sebagai rantai utama yang membentuk bagian dalam dari delapan tangan heliks, dengan sisi rantairantai perpanjangan kearah luar; heliks distabilkan dengan ikatan rantai dalam hydrogen antara NH dan grup CO oleh rantai utama. α-ketoglutarate dehydrogenase Siklus enzim asam sitrat yang mengkatalisis oksidatif dekarboksilasi dari α ketoglutarat menjadi succinil CoA. Enzim ini membantu untuk meregulasi dasar dari siklus asam citric, yang secara sturktural dan mekanis mirip dengan kompleks piruvat dehidrogenase. alternative splicing Generasi yang unik namun berhubungan dengan molekul-molekul oleh sambungan yang berbeda dari pre-mRNA transkrip,sambungan alternatif dapat meningkatkan potensial dalam mengkode genom. Amanitin. Peredaran oktapeptida dari jamur Amanita phalloides (the destroying angel) yang berpotensi untuk menghalangi fase elongasi dari sintesis RNA yang dikatalisis oleh RNA polymerase II. Ames test Merupakan tes sederhana, cara cepat untuk mendeteksi karsinogen dengan mengukur kemampuan kimia untuk mengakibatkan mutasi pada bakteri Salmonella amiloride-sensitive sodium channel, channel sodium sensitif-amiloride Saluran sodium yang berfungsi untuk mendeteksi rasa garam. Beberapa saluran tertutup oleh amiloride, yang juga dapat mematikan rasa garam. amino acid, asam amino. Asam yang berasal dari bahan organic dengan atom α karbon yang dihubungkan dengan asam karboksilat, grup amino, atom hydrogen dan sisi rantai (grup R). Dua puluh asam amino yang berbeda, dibangun oleh kompleks protein. amino sugar, gula amino. Gula yang mengandung grup amino daripada grup hidroksil dengan C-2 sebagai posisi; gula amino yang paling umum adalah glukosamin dan galaktodsamin. Aminoacyl-tRNA. Asam amino golongan ester untuk transfer RNA. Hal 4 (10604109, Yusup Hamidudin) aminoacyl-tRNA synthetase Suau enzim yang mengaktifkan sejenis asam amino dan kemudian bekerjasam dengannya unuk mentransfer RNA. Juga dikenal sebagai enzim pengaktif, setiap aminosil-tRNA dibuat spesifik untuk asam amino tertentu. aminotransferase Suatu kelas enzim yang mentransfer suatu grup α -amino dari asam α -amino menjadi asam α -keto. Dikenal dengan nama transaminase.



ammoniotelic makhluk hidup yang menggeluarkan ammonia secera langsung, biasanya dikeluarkan oleh hewan air. AMP-dependent protein kinase protein kinase, terdapat pada eukariot, yang akan aktif jika berikatan dengan AMP dan dihambat oleh ATP; mengakibatkan, ini berfungsi sebagai pengukur bahan bakar seluler, terhambatnya proses tertentu dengan cara phosphorylaything enzim kunci saat energi rendah. ampere satuan energi listrik, bernilai: 6.24 × 1018 per second. amphibolic reactions proses metabolisme yang bisa menjadi katabolisme ataupun anabolisme, tergantung pada kondisi energi dalam sel. amphipathic molecule Molekul, seperti lemak membran,yang menggandung bagian hidropobik dan hidrofilik. Amylopectin suatu bentuk pati yang bercabang, yang mengandung residu glukosa disekitar satu α -1,6 per 30 α -1,4 sambungan. amylose Bentuk pati yang tidak bercabang, mengandung residu glukosa pada rantai α -1,4. amytal suatu barbiturate yang menghalangi rantai respirasi dengan menghambat transfer electron pada kompleks reduktase NADH-Q. anabolic steroid Suatu steroid, seperti testosteron, yang bekerja melewati resepor androgen untuk menstimulus gen yang mempertinggi perkembangan dari masa otot. anabolism Suatu set dari reaksi metabolic yang memerlukan energi untuk mensintesis molekul dari precursor yang simple anaerobic dalam keadaan tanpa oksigen. anapleurotic reaction Berasal dari kata yunani untuk “memenuhi”, menunjukkan reaksi yang menggantikan proses meabolisme intermediet yang hilang. Contoh yang umum adalah reaksi yang dibuat oleh piruvat karboksilase, dimana karboksilasi dari piruvat menghasilkan oksalat, komponen penting dari cicin asam sitrik. Andersen's disease Suatu penyakit yang menyebabkan kegagalan dalam membuat ikatan α -1,6-glykosidic pada saat sintesis dari glikogen. Glikogen ada dalam ambang normal tapi dengan cabang luar yang lebih panjang; secara klinis, penyakit yang mempunyai ciri cirrhosis pada liver. Hal 5 (10604101, Evah Luviah) androgens Merupakan salah satu kelompok hormone steroid, dibawah pengaruh hormon testosteron, yang bertanggungjawab atau berperan dalam perkembangan karakteristik seks sekunder pada pria; disintesis oleh testes. angstrom (Å) Suatu satuan panjang yang equal/setara dengan 10-10 meter. anomers Isomer-isomer dari hemiasetal siklis atau hemiketal, dengan perbedaan konfigurasi hanya pada atom karbon karbonil-nya; karbon tersebut dikenal sebagai karbon anomerik. antagonist Sebuah molekul yang berikatan dengan protein reseptor tetapi tidak memicu



jalur persinyalan. Sama hal-nya dengan molekul yang berperan sebagai zat kompetitif inhibitor pada enzim. antibody Suatu protein yang disintesis oleh hewan dalam merespon suatu substansi asing, atau suatu antigen; sering berikatan dengan antigen, menetralisir substansi asing tersebut atau menghancurkannya. anticodon Suatu rangkaian tiga buah nukleotida dari RNAt yang memiliki pasangan basa satu buah kodon dalam RNAm. antigen Suatu substansi asing yang dapat mendatangkan sintesis antibodi. antigenic determinant Bertempat di antigen di mana suatu antibody berikatan padanya. Disebut juga sebagai epitope. antimycin A Sebuah antibiotik dari bakteri Streptomyces yang menghambat system pernafasan dengan cara memblokir transfer elektron dalam reduktase kompleks sitokrom. antiporter Sebuah sistem transport di mana suatu molekul dibawa melewati membran yang arahnya berlawanan dengan ion, yang pada gilirannya dipompa kembali melewati membran selama transport aktif yang berkaitan dengan hidrolisis ATP. antiserum Serum diambil dari darah hewan yang terimunisasi berisi antibody terlarut yang khusus untuk antigen yang memiliki ke-khas-an tertentu. apoptosis Suatu peristiwa peluncuran enzim proteolitik yang berperaan dalam pengontrolan kematian sel dalam responnya terhadap kerusakan sel yang signifikan atau perkembangan yang yang terprogram secara spesifik. Disebut juga sebagai kematian sel yang terprogram. arachidonate Merupakan derivat dari linoleat, derived from linoleate, 20:4 asam lemak yang merupakan precursor utama terhadap beberapa sinyal molekul, termasuk prostaglandin. arrestin Suatu protein yang berperan dalam terminasi galur transduksi sinyal visual melalui pengikatan rhodopsin yang terfosforilasi serta pencegahan terjadinya interaksi dengan transducin. Arrestin mungkin memiliki peran yang sama dalam galur transduksi sinyal 7TsM-bebas lainnya. ascorbate (vitamin C) Merupakan vitamin yang larut dalam air yang berfungsi sebagai antioksidan dan dibutuhkan dalam hidroksilasi kolagen; dan sebagai obat defisiensi vitamin C (sariawan). Hal 6 (10604121, Dwi Ratnasari) aspartyl proteases, aspartil protease kelas enzim pendegradasi protein yang aktivitasnya tergantung kepada residu aspartat pada daerah aktif. Aspartil protease diperlukan untuk replikasi HIV. ATP (Adenosin 5’-trifosfat) nukleotida yang terdiri dari unit-unit adenin, ribosa, dan trifosfat yang berperan sebagai peredaran energi selular. ATP-ADP translocase, ATP-ADP translokase adenin nukleotida pembawa protein transport yang membawa ADP ke dalam mitokondria dan ATP keluar secara berpasangan.



ATP-binding cassette (ABC) domain karakteristik domain ikatan ATP dari protein transport membran yang spesifik, yang disebut transporter ABC; transporter ini juga mengandung wilayah membrane-spanning. ATP-grasp fold domain protein yang mengelilingi ATP dan mengorientasikannya untuk menyerang nukleofilik pada fosfat ã. Enzim yang mengandung domain ini mengkatalisis formasi ikatan karbon-nitrogen melewati asilfosfat intermediet. ATP synthase, ATP sintase penyusunan molekuler dari membran dalam mitokondria yang bertanggungjawab untuk sintesis penggerak-rantai-respirasi ATP. Juga disebut kompleks V, ATPase mitokondria, H+-ATPase, or F0F1-ATPase. atractylocide, atraktilosida glikosida dari tanaman yang menghambat translokasi ATPADP. attenuation, pelemahan pada bakteri, mekanisme untuk regulasi transkripsi yang akan menurunkan laju translasi dari operon mRNA mengurangi laju transkripsi operon tersebut. autoimmune disease, penyakit autoimun penyakit, seperti ketergantungan insulin pada penyakit diabetes dan multiple sclerosis, sebagai hasil dari kegagalan dalam menekan respon imun antigennya sendiri. autoradiography, autoradiografi istilah untuk molekul radioaktif pendeteksi yang tidak bergerak dalam medium pemisahan seperti poliakrilamida; radioaktifitas dari molekul akan menghitamkan film sinar-x. autotrophs, autotrof organisme fotosintetik yang mensintesis glukosa dari karbon dioksida dan air, dengan menggunakan cahaya matahari sebagai sumber energi; glukosa yang dihasilkan kemudian digunakan sebagai bahan baker untuk metabolisme selular. avidity, aviditas kekuatan dari ikatan yang terdiri dari banyak interaksi ikatan independen antapasangan, seperti antara antigen dan antibodi. axoneme, aksonema desain pokok dari silia dan flagella; mengandung berkas mikrotubul, ditutupi oleh membran, dimana setiap sembilan mikrotubul ganda melingkupi dua mikrotubul tunggal. B blymphocyte, blimfosit pelopor untuk sel plasma, yang merupakan pensekresi antibodi. Hal 7 (10604130, Selvy S. Y.) bacitracin suatu antibiotik yang menghambat transfer dari oligosakarida dari dolihol fosfa ke protein. bacteriorhodopsin suatu membran integral 26-kd yang menyerap cahaya dan merubah energinya menjadi enaga penggerak proton, yang kemudian digunakan untuk mensintesis ATP. base-excision repair Suatu metode perbaikkan DNA dimana bagian basa yang rusak digantikan oleh basa yang sama dan membuatnya seperti semula.



B-DNA helix suatu double helik kanan yang mempunyai karakteristik sebagai berikut; dua untai yang anti-paralel; basanya terdapat didalam untai sedangkan gugus fosfat dan gula deoksiribosanya berada diluar; adenin membentuk ikatan hidrogen dengan timin, dan guanin dengan sitosi; tiap pasangan basa berbentuk coplanar; dan terdapat 10.4 residues per turn, dan mempunyai puncak di 35 Å. Beer's law hubungan dari penyerapa cahaya (A) dengan suatu campuran, yang mempunyai koefisien tetap (å), konsentrasi (c) dan panjang (l) cahaya: A = åcl beriberi suatu penyimpangan neurologic dan kardiovascular yang disebabkan oleh kekurangan vitamin B1. β sheet struktur umum dalam protein, dimana dua atau lebih untai β yang berikatan sebagai tumpukkan dari suatu cincin, yang distabilkan oleh ikatan hydrogen di dalam cincin; sejumlah untai β mengarah pada arah yang sama membentuk lembaran lipatan β, dimana untai sejenis mengaran pada posisi yang berbeda dari betuk ani parallel lembaran lipatan. β-galactosidase enzim yang pentinga dalalm metabolisme laktosa yang menghidrolisi laktosa menjadi galaktosa dan glukosa. bifunctional enzyme enzim dengan 2 perbedaan, sering berentangan, proses katalis pada satu rantai polipepidanya. Sebagai contoh, fosfatfruktokinase 2 mensintesis sukrosa 2,6bisphosphate dan fruktosa 2,6-bisphosphatase menghidrolisis fosfatfruktokinase, dan keduanya berada pada sisi aktif rantai polipeptida yang sama. bile salt suatu turunan kolesterol yang dibuat dalam liver, dan dikumpulkan pada kantung kemih,dan dilepaskan ke intestine, dimana mereka berperan sebagai detergen untuk melarutkan lemak, memfasilitsi unuk pencernaan dan penyerapan. binding energy energi bebas yang dilepaskan pada saat formasi interaksi terlemah antara enzim dan substrat. biopterin suatu kofaktor yang diambil dari tetrahydrobiopterin pembawa electron. biotin vitamin yang memainkan peran penting dalam reaksi karboksilasi dan dekarboksilasi. Bohr effect observasi yang dibuat oleh Christian Bohr dengan menaikkan H+ dan CO2 untuk melepaskan oksigen dari oksihemoglobin. bongkrekic acid Suatu antibiotik yang menghambat kerja dari ATP-ADP translokase. Hal 8 (10605001, Lylyk Eka Suranny) branch migration Kemampuan untai pasangan DNA beserta untai komplemennya untuk bergerak, mengganti untaian homolog dan memperpanjang pasangannya. Bromodomain Domain yang termasuk dari empat heliks ganda peptide yang terdiri atas acetyllysin.Juga disebut dengan untai domain acetyllysin. C3 plant Tumbuhan yang tidak mempunyai jalur C4 C4 pathway Tumbuhan yang mempunyai empat komponen karbon, yaitu oxaloasetat dan malat, membawa karbondioksida dari sel mesofil dan bereaksi dengan udara kedalam



sel,yang merupakan tempat utama dari fotosintesis. Jalur ini mempercepat fotosintesis dengan konsentrasi karbondioksida pada sel fotosintesis. C4 plant Tanaman yang memanfaatkan jalur C4 CAAT box Komponen dari eukariotik yang mendukung ikatan 5’-GNCAATCT-3’ Calcium ATPase (Ca2+ ATPase) Bagian dari ATP yang mengendalikan dan memelihara gradient elektrokimia dari ion kalsium pada membrane plasma. Calmodulin Pada vertebrata protein ini terdapat di mana-mana,ketika berikatan dengan kalsium menstimulasi banyak enzim dan pengangkutan. calmodulin-dependent kinase Protein yang mempunyai aktivitas untuk mengikat kompleks Ca2+-calmodulin Calnexin Inti pada membran reticulum endoplasma,sebuah chaperon protein yang mencegah pengiriman glikoprotein yang belum matang atau glikoprotein yang tidak aktif dengan mengikat residu glukosa pada glikoprotein. caloric homeostasis Pemeliharaan keseimbangan berat badan dengan jaringan yang kompleks dari interaksi hormonal. calorie Jumlah panas yang diperlukan untuk meningkatkan temperature 1 gr air dari 14.5°C sampai 15.5°C. Calvin cycle Pada tanaman, merupakan metabolic siklik dimana karbondioksida merupakan campuran ribolus 1,5-bipospat yang digunakan untuk sintesis glukosa. 5' cap Struktur pada ujung 5’ dari mRNA eukariot yang menstabilkan mRNA,mempercepat translasi.Cap terdiri atas sebuah 7-methyl guanylate merupakan residu dari triphosphate yang berhubungan dengan gula pada ujung 5’ ,pada mRNA dengan jarak hubungan hubungan 5’-5’ capsaicin receptors Ion channel yang mengekspresikan espon stimulus yang berbahaya misalnya panas, keasaman kimia misalnya capsaicin, respon kimia”panas”pada saat mencoba makanan pedas.Juga disebut reseptor vanilloid 1(VR1). Hal 9 (10605002, Tazkiyah Izzati) capsid, kapsid. Protein yang menyelubungi DNA atau RNA pada virus. carbamoyl phosphate synthetase, karbamol fosfat sintetase. Merupakan enzim yang memulai siklus urea dengan cara mengkatalisis sintesis karbamoyl fosfat dari bikarbonat, ion ammonium dan ATP. Enzi mini juga mengkatalisis reaksi awal dari biosintesis pirimidin. carbohydrates, karbohidrat. Sakarida, yang memiliki gugus aldehid atau keton dan terdiri dari banyak gugus hidroksil. Juga didefinisikan sebagai materi organic dengan rumus empirik (CH2O)n. carbonium ion, ion karbonium. Merupakan komponen karbon yang terdapat atom karbon bermuatan positif; karbonium sangat penting untuk katalisis oleh lisozim. Carboxylase, karboksilase Merupakan enzim yang menkatalisis reaksi perpindahan karboksil; biasanya biotin diperlukan sebagai koenzim.



carcinoembryonic antigen (CEA), antigen karsinoembrionik. Merupakan membrane glikoprotein dari usus fetus yang tidak diekspresikan secara signifikan setelah lahir. Level serum yang tinggi dari CEA merupakan bukti bahwa banyak pasien dengan kanker colorectal. cardiotonic steroids, steroid kardiotonik. Molekul turunan dari kolesterol yang mencegah pompa Na+-K- dengan cara menutup defosforilasi konformasi E2 dari protein pompa. Penggangguan pompa ini pada sel-sel di jantung menyebabkan meningkatnya level sodium dalam sel, yang memperlambat ekstruksi ion kalsium dan meningkatkan kontraksi otot jantung. carnitine, karnitin Merupakan molekul zwitterionik yang dibentuk dari lisin yang bekerja sebagai pembawa dari siklus panjang asam lemak dari sitosol menuju matriks mitokondria. carotenoids, karotenoid. Polyenes yang diperpanjang, menyerap cahaya diantara 400500 nm dan berfungsi sebagai pigmen asesori pada fotosintesis dengan cara mengalirkan energi menuju pusat reaksi fotosintesis. cascade, enzymatic. Merupakan reaksi runut dimana setiap langkahnya, suatu produk menstimulasi reaksi berikutnya, meneruskan amplifikasi dari stimulus atau sinyal yang relative kecil. caspases. Protease sistein yang ikut dalam cascade proteolitik pada apoptosis. catabolism, katabolisme. Suatu rangkaian reaksi metabolik yang mengubah bahan baker menjadi energi seluler. catabolite activator protein (CAP), protein aktifator katabolis. Protein yang merespon cAMP, ketika CAP berikatan (menempel) pada sisi pengulangan lac operon, relative dekat posisi -61 dari tempat dimulainya transkripsi, untuk menstimulasi transkripsi. catabolite repression, represi katabolis. Merupakan represi oleh glukosa dari enzim katabolic yang diperlukan untuk katabolisme karbohidrat selain glukosa. Hal 10 (10605003, Febrina Anggrianto) catalase Suatu heme protein yang ada dimana - mana yang mengkatalis perubahan hydrogen peroksida menjadi hidrogen dan oksigen. catalysis by approximation peningkatan kerja dengan membawa berlipt - lipat substrat bersama - sama pada satu sisi ikat permukaan enzim. catalytic antibodies antibody yang disebabkan dengan menggunakan keadaan transisi analog dari suatu reaksi sebagai antigen. Antibody sering berfungsi sebagai katalisator. Yang biasa disebut sebagai abzymes. catalytic group suatu asam amino atau kofaktor pada suatu sisi aktif enzim yang secara langsung berpartisipasi dalam pembentukkan atau pemutusan ikatan kovalen. catalytic RNA satu kelas molekul RNA yang menunjukkan aktifitas enzim. catalytic triad kumpulan dari 3 residu, ditemukan pada banyak enzim proteolik, dimana dua dari residu membentuk residu yang lain, biasanya serine or cysteine, menjadi nukleofil yang keras.



CD4 suatu protein yang muncul dibagian permukaan dari helper yang, bersama dengan T sel reseptor, mengikat pada protein kelas II MHC proteins pada antigen sel. CD4 adalah sumber dari helper T sel yang spesifik untuk interaksi dengan kelas II MHC. CD8 permukaan protein dari suatu sel yang diekspresikan oleh sitotik T sel yang, berhubungan dengan in T sel reseptor, mengenali kompleks kelas I MHC-peptide. CD8 mengikat pada protein MHC itu sendiri. cDNA Komplemen DNA unuk susunan mRNA. CDP-alcohol bentuk aktif dari suatu alcohol yang digunakan dalam sintesis dari phosphoglycerides dengan mengombinasi diacylglycerol pada gugus hidroksil bebas dari gliserol; sebagai contoh, CDP-choline bisa bereaksi dengan diacylglycerol untuk membentuk phospholipid phosphatidylcholine. CDP-diacylglycerol (cytidine diphosphodiacylglycerol) Dibentuk dari phosphatidate dan cytidine triphosphate (CTP); mengaktifkan diacylglycerol, untuk dipergunakan dalam sintesis phosphoglycerides seperti phosphatidyl serine. cell type sel dalam organisme yang mempunyai genetic yang sama tapi mempunyai tanggung jawab yang berbeda untuk ekspresi gen yang berbeda. cellular immune response system untuk proses pengenalan seluler dari zat asing dengan menggunakan sel-pengikat T-sel reseptor untuk menghilangkan sel yang terinfeksi oleh suatu yang berbahaya atau untuk menstimulus reaksi antigen tertentu yang distimulasi oleh produksi antibodi B-limfosit. cellulose bentuk tidak bercabang dari homopolisakarida pada anaman, terdiri dari residu glukosa pada sambungan α-1,4; struktur utama polisakarida di tanaman. centromere tempat melekatnya benang spindle pada proses mitosis di krokosom. Hal 11 (10605005, Nova Virgiana) 11ceramide (N-acyl sphingosine) suatu sphingosine dengan rantai gugus asil yang panjang dan menempel pada gugus amino. cerebroside sphingolipid dimana glukosa atau galaktosa berikatan dengan terminal hidroksil dari gugus ceramide. cGMP phosphodiesterase enzim yang menghidrolisi cincin GMP menjadi GMP; dalam visualisasinya, hidrolysis ini mengarah pada generasi potensial aksi. cGMP-gated calcium channel suatu chanel pada sel rod yang membuka akibat dari cGMP untuk bertanggung jawab atas pemasukkan ion kalsium dan sodium ke dalam sel; menutupnya chanel merupakan akibat dari hidrolisis cGMP memulai proses visual dari transduksi sinyal. channel suatu jalur protein yang secara kontinyu dan cepat yang memungkinkan ion masuk melewati membran eukariot dari bagian dengan konsentrasi tinggi ke bagian dengan konsentrasi yang lebih rendah. Channels (juga dikenal sebagai pori pada bakteri) umumnya terdiri dari 4 sanpai 6 subunit, atau domain, dan di rintangi oleh potensial membran, efektor allosteric, atau modifikasi kovalen. chaperone proteins ATPase lambat yang mengikat protein yang baru disintesis dan



membantu dalam pelipatan yang benar. chemiosmotic hypothesis suatu ide dimana transfer electron pada rantai respirasi digunakan sebagai pompa proton pada bagian dalam dari membran mitokondria, mempertahankan gradient proton; gradient ini (gaya gerak proton) menjalankan sintesis ATP oleh ATP sintesa. chemoattractants Zat, seperti glukosa, yang, saat hadir dalam bentuk suatu gradien, menyebabkan bakteri berenang menuju sumber gradiennya. chemorepellants zat yang berpotensi merusak, seperti fenol, yang, yang, saat hadir dalam bentuk suatu gradien, menyebabkan bakteri berenang menjauhi sumber gradiennya. chemotrophs organisme yang mendapatkan energi dengan jalan mengoksidasi mekanan. Lihat juga phototrophs. CheY protein pada bakteri kemotksis yang menybabkan jalur sinyal kimiawai yang, pada saat phosphorylated, mengarah pada rotasi flagelum searah jarum jam, menyebabkan terguling, dan kemudian, pada saat dephosphorylated, mengarah pada rotasi yang berlawanan arah dengan jarum jam dan berenang dengan lancar. chimeric DNA molekul DNA rekombinan yang mengendung gen yang tidak berhubungan. chloramphenicol suatu antibiotik yang menghambat aktivitas peptidyl transferase dari prokaryotic 50S ribosomal subunit. chlorophyll pengganti dari tetrapyrrole yang merupakan bagian penting dari fotoreseptor pada tanaman. chloroplast organel tanam tempat berlangsungnya fotosintesis. Hal 12 (10605006, Yunita) Cholera toxin. Toksin yang terdiri dari dominant katalis dan dominant membrane penetrasi; sub unit katalis yaitu ADP-ribosylates yang merupakan stimulasi protein G, sktivitas tersebut membawa kepada aktivitas memompa ion dan memasukkan sejumlah besar ion Na+ dan air masuk kedalam usus Cholesterol.Sterol yang penting di membrane sel eukaryot seperti lipoprotein juga sebagai precursor dari hormone steroid Chromatin. Materi nukleuprotein kromosom yang tersusun atas DNA dan bagiannya Chromatin immunoprecipitation (ChIP). Teknik untuk mengidentifikasi tempat penempelan dari ikatan antara DNA dan protein. Protein yang mengalami cross linked dengan DNA yang dibangun oleh kromatin, dan DNA mengalami fragmentasi menjadi bagian-bagian kecil. Antibodi yang dibangun oleh protein digunakan untuk mengisolasi fragmentasi protein. Cross linknya terbalik sehingga DNA terisolasi dan terkarakterisasi Chromatin. Merupakan protein kompleks yang terdiri dari homolog domain yang menjadi berbentuk heliks dan menggunakan energi ATP dari hidrolisis untuk memposisikan nukleosom dan menginduksi perubahan kromatin komfornasional yang lain



Chromophore. Grup penyerap cahaya seperti 11-cis-retinal dalam rhodopsin Chromosome walking. Teknik untuk menganalisis peregangan dari DNA dengan cara subkloning sequwnsial dan menscreaning ulang segmen-segmen yang saling tumpang tindih Chylomicrons. Partikel lipoprotein mentranspot triacylglycerols dari usus ke jaringan yang lain; apolipoprotein B-48 merupakan komponen protein dari chylomicrons Cilia. Organel seperti rambut yeng berasal dari mikrotubul yang menonjol keluar dan bererak secara liquid ; merespon dari banyak pergerakan organisme sel Citrate synthase. Enzim yang mengkatalis kondensasi dari asetil CoA dengan oksaloasetat untuk menghasilkan sitrat, dimilai dengan siklus asam sitrat Citric acid cycle. Siklus dari reaksi metabolisme yang mengubah oxidize acetyl unit menjadi karbon dioksida. Harus diketahui juga sebagai siklus tricarboxylic acid atau daur krebs setelah hans krebs merupakan siklus elusidasi alami. Class I MHC. Membrane protein yang terikat kuat dengan fragmen proteolitik dari protein selular dan menghadiran mereka untuk penelitian dari T sel. Protein asing ditampilkan didalam class I MHC protein siperuntuntukkan untuk menyerang sebagai pembunuh T sel yang menginisiasi apoptosis delam sel target Class II MHC proteins. Protein yang hanya mengekspresikan antigen-presenting sel; Class II MHC proteins menampilkan pengambilan peptide dengan destruksi dari protein internal secara endositosis. Hal 13 (10605007, Leonita Swandjaja) class switching Langkah diferensiasi yang dilakukan oleh sel penghasil antibody dimana sel tersebut bergani dari memproduksi IgM antibody menjadi satu atau beberapa jenis antibody pada saat bersamaan menjaga antigen yang khusus tetap sama. clathrin Suatu protein yang melingkupi sisi systosolic dari suatu terowangan dan bisa membentuk lattice disekitar terowongan, mengeluarkannya dari membran untuk membentuk suatu vesicle membran. coated pits Suatu wilayah khusus dari plasma membran yang mengandung membran sel reseptor local. Bagian cytosolic yang melekuk ini ditutupi oleh clathrin protein. cobalamin (vitamin B12) Suatu kompleks yang banyak mengambil peran dalam beberapa reaksi termasuk dalam pembentukan deoxsyribosanukleosida dari ribonukleosida. coding strand Rantai dari DNA yang mempunyai urutan susunan yang sama dengan tRNA kecuali pada basa T (timin) diganti dengan U (urasl). codon Suatu triplet nukleotida pada mRNA yang mengkode asam amino yang spesifik. coenzyme Suatu molekul organic yang kecil yang dibutuhkan pada aktivitas beberapa enzim; vitamin biasanya komponen dari suatu coenzim. coenzyme A (CoA) Suatu coenzim yang mengandung adenin yang berhubungan dengan pantothenate, yang zat itu sendiri berhubungan dengan mercaptothylsmine; secara umum membwa gugus asil, yang terikat pada mercaptoethylamine unit.



coenzyme Q Suatu pembawa electron yang merupakan komponen dari respirasi chain; yang menggumpalkan oksida-ubiquinone untuk mengurangi pembentukan ubiquinol melalui cara semiquinone intermediate; kecuali electron dari NADH-Q NADH-Q reductase juga succinate-Q reductase. cohesive ends Pada rantai ganda suatu DNA molekul, In double-stranded DNA molecules, complement dari rantai tunggal yang diakhirnya diproduksi oleh staggered cuts. Cohesive ends yang spesific pada DNA bisa dibuat oleh sejenis enzim restriksi, seperti Ecori, dan bisa digunakan untuk menyambung DNA molekul yang tidak berhubungan dengan cara annealing dan menggabungkan dengan DNA ligase. colchicine Suatu alkaloid yang membentuk the autumn crocus yang mencegah polimerisasi dari tubulus untuk membentuk mikrotubulus; dan akibatnya, ini menghambat siklus sel pada fase metafase. combinatorial chemistry Proses yang memproduksi secara besar - besarn molekul yang kemudian akan dipilih untuk menjadi bagian dari suatu biokimia. combinatorial control Proses pengontrolan ekspresi pada sel eukariot dimana tiap factor transkripsi, tidak secara spontan memberi efek pada transkripsi, mengambil protein lain untuk membangun suatu kompleks yang menjalankan transkripsi. committed step Proses irreversible yang pertama kali dalam jalur metabolisme dibawah kondisi psikologis; proses ini dikatalis oleh suatu enzim allosteric dan menghasilkan produk yang penting untuk molekul kimia. Hal 14 (10605008, Nursiva Azlia) compartmentation Tempat lokasi metabolisme, enzim ataupun jalurnya pada membran organel yang berbeda pada sel eukariot. competitive inhibition Penurunan laju reaksi enzim yang diamai pada saat enzim bisa berikatan dengan substrat atau inhibitor tapi tidak sekaligus berikatan dengan keduanya. Inhibitor kompetitif mirip dengan substrat dan bersaing dengan substrat untuk berikatan pada sisi aktif suatu enzim. Pencegahan dari inhibitor dengan cara memenuhi dengan substra adalah suatu jenis peningkatan energi kinetik dari suatu inhibitor kompetitif. complementarity-determining region (CDR) Rantai L dan H pada suatu immunoglubin, segmen polipeptida yang mempunyai variasi urutan yang besar dan bertanggung jawab untuk menetapkan antigen apa yang cocok. concerted mechanism Suatu model yang menerangkan tentang energi kinetik dari enzim allosteric dimana perubahan semua sisi aktifnya antara keadaan T dan R berlangsung secara terus menerus. cone Sebuah sel fotoreseptor yang berfungsi untuk menangkap cahaya terang dan memberikan warna. consensus sequence Susunan basa ideal yang biasa terdapat pada sisi promotor. conservative substitutions Mutasi yang terjadi karena adanya perubahan pada salah satu asam amino digantikan dengan asam amino yang lain yang sma dalam ukuran dan kimiawainya.



constant region Terminal karboksil yang terdapat pada ujung light chain G dari suatu immunoglobulin G atau heavy chain Ig G. untuk kebanyakan antibodi, bagian ini merupakan salah satu susunan dari rantai polipeptida yang mempunyai asam amino yang sama antara yang satu dengan yang lainnya; light chain punya satu wilayan tetap, sedangkan heavy chain punya tiga wilayah, yang masing - masing saling menyusun wilayah untuk mengenali molekul immunoglogulin asing. constitutive genes gen yang tidak penting dalam regulasi dan secara tetap di transkrip. conventional kinesin Suatu motor protein, di bangun di sekitar inti p-loop NTPase,yang mempunyai beberapa struktur yang sesuai dengan myosin; suatu kinesin umum yang bergerak ke arah akhir miktotubulus yang positif. convergent evolution Proses dimana dengan cara yang berbeda berakhir pada satu solusi yang sama dalam masalah biokimia. cooperativity Bagian dari kebanyakan enzim allosteric dimana pada saat ada substrat yang terikat pada satu sisi aktifnya akan menginduksi terjadinya transisi semua sisi aktif dari keadaan T menjadi keadaan R, yang akan berdampak pada meningkatnya aktivitas kerja enzim. Hal 15 (10605010, Vanessa Letiza) core glycosylation Penambahan karbohidrat ke protein dan proses dari karbohidrat ini bertempat di reticulum endoplasma. core particles Partikel core yaitu partikel yang merupakan hasil dari pencernaan microccocal nuclease pada nukleosome, mengandung 140-bp DNA dan histone octamer pada nukleosome. corepressor Molekul kecil yang terikat dengan protein repressor, corepressor-repressor complex akan berikatan dengan DNA operator pada operon particular untuk menghambat proses transkripsi. Cori cycle Siklus Cori merupakan siklus metabolik dimana asam laktat dikonversi menjadi glukosa oleh hati pada otot yang aktif dan mensuplai hasil sintesa glukosa tersebut ke otot dan jaringan lainnya. Cori disease Penyaki Cori yaitu penyakit yang disebabkan karena struktur dari hati dan glikogen otot yang abnormal dan jumlahnya pun menurun. Hal itu disebabkan ketidakmampuan untuk menghidrolisis ikatan α-1,6-glycosidic pada glikogen, dan fungsi hati pun menjadi terpengaruh. coupled reaction Reaksi pasangan yaitu pasangan dari reaksi endergonic dengan reaksi exergonic, seperti hidrolisis pada ATP, maka pasangan reaksi tersebut akan berlangsung sesuai dengan kondisi sel. covalent catalysis Katalisis kovalen yaitu katalisis yang di sisi aktifnya mengandung kelompok reaktif yang menjadi kovalen secara temporer yang dibentuk di dalam proses katalisis. covalent intermediate Intermediate kovalen, pada mekanisme katalisis, intermediate mengandung komponen dari substrat yang terikat secara kovalen dengan enzim.



covalent modification Modifikasi kovalen yaitu penambahan dan pengurangan bahan kimia tertentu dari sebuah enzim dan perubahan yang sesuai unsure-unsur katalis enzim tersebut. Unsur-unsur katalis dari banyak enzim dirubah oleh penambahan dan pengurangan kovalen dari kelompok phosphoril dimana sejumlah kecil lainnya mengalami pengikatan unit AMP dari ATP. CpG islands Area kaya DNA pada CpG sequence, biasanya terletak di area 5’ pada gen, basa cytosine dari pulau ini dapat dimetilasi untuk menghambat transkripsi dari gen assosiasi. crassulacean acid metabolism Cara tumbuhan yang hidup di lingkungan kering beradaptasi adalah dengan cara jalur C4 mengkonsentrasikan karbondioksida pada malam hari dan pertukaran uap dengan lingkungan berkurang selama suhu panas di siang hari dengan penutupan stomata. creatine phosphate (phosphocreatine) Di otot, campuran dengan transfer phosphoryl berpotensi tinggi digunakan untuk meregenerasi ATP dari ADP selama detik-detik awal kontraksi otot. critical concentration Konsentrasi dari G-aktin monomer di atas jika polimerisasinya sedang berlangsung dan di bawah jika depolimerisasinya yang sedang berlangsung. Konsentrasi kritisnya sebanding dengan konstanta disosiasi (Kd) dari monomer aktin pada filament Hal 16 (10605011, Ruzka Radwamina) 16cumulative feedback inhibition strategi reguler dimana enzim mengkatalis langkah langkah umum dari beberapa jalur yang dihambat oleh produk hasil dari setiap jalur, jadi, setiap penghambat bisa mengurangi aktifitas dari suatu enzim meskipun inhibitor yang lain terikat pada level jenuh. cyclic AMP (cyclic 3', 5'-adenosine monophosphate) Suatu cincin nukleotida yang terbentuk dari ATP dan merupakan penyampai pesan terpenting kedua dalam berbagai macam system sinyal. cyclic AMP-response element binding protein (CREB) faktor transkripsi yang terikat ke elemen respone dari cincin AMP pada DNA dan, pada saat phosphorylated oleh protein kinase A, mengambil coactivator yang menghasilkan stimulus untuk transkripsi dari gen yang spesifik. cyclic GMP (cyclic 3', 5'-guanosine monophosphate) Cincin nukleotida yang terbentuk dari GTP dan penyampai pesan terpenting kedua dalam pandangan. cyclic photophosphorylation Dalam fotosintesis, pembenukan dari ATP tidak bersamaan dengan pembbentukan dari NADPH; siklus electron dari reaksi utama dari fotosistem I menjadi ferredoxin dan kemudian kembali lagi ke reaksi tengah melewati cytochrome bf dan plastoquinone menghasilkan gradien proton yang digunakan untuk membentuk formasi ATP. cycloheximide suatu antibiotik yang menghambat aktifitas transferase dari peptidyl dari 60S ribosomal subunit pada eukaryotes. cyclosporin suatu obat yang menekan keras sisitem immune dan menghambat rejection



pada pencangkokkan organ. cytidine diphosphodiacylglycerol (CDP-diacylglycerol) suatu substrat aktif untuk berbagai sintesis dari fosfolipid yang dibentuk berdasarkan reaksi dari phosphatidate dengan CTP. cytochrome suau proses transfer protein electron yang mengandung gugus heme prosthetic dimana bilangan kovalen besinya berada pada ferrous (+2) and ferric (+3) saat transfer electron. cytochrome bf suatu kompleks cytochrome yang berhubungan dengan photosystem II dan photosystem I pada tanaman hijau; cytochrome bf berkontribusi dalam membentuk gradien proton dengan cara mengoksidai plastoquinol menjadi plastoquinone. cytochrome c zat yang terlarut dalam air, highly conserved cytochrome component of the respiratory chain that accepts electrons from cytochrome reductase and is in turn oxidized by cytochrome oxidase. cytochrome c oxidase kompleks akhir dari rangkaian cincin respirasi, cytochrome c oxidase mentransfer electron dari cytochrome c ke molekul oksigen dan dengan bersamaan memompa proton melewati inti membran mitokondria untuk membangkitkan tenaga motivasi proton. Yang juga disebut kompleks IV. cytochrome P450 system ditemukan dalam adrenal mitokondria dan mikrosome hati, suatu rantai electron transfer daiman terminalnya adalah cytochrome P450; system ini memainkan peranan penting dalam detoksifikasi zat asing dengan mengubah mereka menjadi lebih larut dan bisa diekskresikan.. Hal 17 (10605012, Muthia Husnul Lisana) Cytoskeleton, sitoskeleton perancah didalam sel, terdiri dari mikrofolamen, filament intermediet,dan mikrotubulus, yang memungkinkan sel melakukan transport ke vesikula, mengubah bentuk sel, dan untuk migrasi sel. cytotoxic T lymphocytes, Limposit sitotoksik T sel T yang memacu kematian sel dengan apoptosis di dalam sel yang menyalurkan antigen asing kedalam kelas I MHC proteins. Juga disebut membunuh T sel. D Dalton satuan yang hampir sama beratnya dengan ion hydrogen dan sama persis dengan 1000 skala massa atom dark reactions, reaksi Gelap di kloroplas, reaksi dengan CO2 dicampur dengan komponen organic, dikendalikan oleh ATP dan NADPH decarboxylase, dekarboksilasi. enzim yang mengangkat atom karbon dari substrat dalam bentuk CO2. decorated filaments, filamen terdekorasi sebuah struktur yang dihasilkan ketika kepala S1 dicampur dengan filamen aktin. Masing-masing kepala S1 menempel pada filamen aktin dengan sumbu panjang yang berorientasi pada 45derajat dari filamen. Dengan semua unit S1 yang berorientasi sama, strukturnya terlihat seperti sebuah kumpulan mata panah menunjuk pada arah yang sama.



deletion, delesi tipe mutasi yang mana satu atau lebih pasangan basa keluar pada replikasi DNA; juga, ketidakhadiran satu atau lebih basa dari nukleotida sequen dalam sebuah gen denaturation, denaturasi gangguan dalam konformasi asli dari makromolekul yang menyebabkan kehilangan fungsi normalnya. de novo pathway, jalur de novo. jalan kecil pada biosynthetic pathway yang membangun produk akhir dari prekusor sederhana.lihat juga salvage pathway. density-gradient equilibrium sedimentation, sedimentasi gradient konsentrasi yang equilibrium. teknik sentrifuga untuk memisahkan molekul biologi berdasarkan pada berat jenisnya di dalam larutan air solution of a salt such as cesium chloride. Ketika beberapa larutan disentrifuga pada kecepatan yang tinggi, melawan gaya dari sedimentasi dan difusi membentuk gradient konsentrasi dari garam; molekul dalam gradient tersebut dikendalikan oleh gaya sentrifugasi kedalam wilayah dimana kekentalan larutan deoxyhemoglobin salah satu bentuk konformasi dari hemoglobin yang tidak mampu untuk mengikat oksigen. Disebut juga dengan T atau bentuk tense . deoxynucleotide nukleotida yang berisi basa purin dan pirimidin yang secara kovalen berkaitan dengan deoksiribosa, berkaitan juga dengan satu atau lebih grup. Hal 18 (10605013, Adinda Meutia Hapsari) deoxyribose monosakarida lima karbon (C5H9O5) yang mengandung korbohidrat dari deoksinukleotida; deoxyribose umumnya ditemukan dideoxynucleotides adalah 2deoxyribose. desensitization proses merestart level sensitivitas dari suatu reseptor dikarenakan kehadiran kligan yang terus menerus. Juga dikenal dengan proses adaptasi. diabetes suatu penyakit yang bercirikan produksi glukosa yang berlebih oleh hati dan dibawah kontrol organ lain. Diabetes tipe satu terjadi karena produksi insulin yang terlalu sedikit. Sedangkan tipe II terjadi akibat reseptor insulin tidak aktif untuk merespon pada suatu hormon. diacylglycerol menyampai pesan kedua pada phosphoinositide cascade, yang mengarah pada pengaktifan protein kinase C. diagonal electrophoresis suatu cara untuk menentukan ikatan disulfida pada suatu protein. Pencampuran suatu protein berlangsung saat elektroforesis pada satu jalur kecil dengan satu arah, ikatan disulfida merupakan ikatan yan irreversibly,dan suau smpel dielektroforesis dengan arah lurus dengan arah asal. Peptida bermigrasi sebagai satu ikatan pada arah yang pertama akan menjadi 2 grup pada arah yang kedua jika mengandung ikatan disulfida. diastereoisomers sepasang molekul, masing - masing mempunyai lebih dari 1 pusat yang asimetris, yang mempunyai konfigurasi yang berlawanan pada bagian pusatnya tapi tidak tumpang tindih jika dicerminkan; pada seri aldotetrose, Derythrose dan D-threose adalah diastereoisomers. dicoumarol Lawan dari vitamin K, dimana merupakan factor penting dalam karboksilasi



dari karbon atom ã di glutamate residu dan pada wilayah asam amino terminal dari prothrombin; prothrombin yang disintesis dengan kehadiran dari dicoumarol tidak bisa mengikat ion calcium dan juga tidak bisa menstimulus terjadinya blood-clotting. differential centrifugation Cara untuk memisahkan komponen sel dengan secara bertahap meningkatkan kekuatan sentrifugasi. Supernatant dari setiap proses kemudian disentrifugasi lagi dengan kekuatan yang lebih besar untuk memproduksi pellet dan supernatant yang lain, dimana yang berikutnya disenrifugasi kembali dengan kekuatan yang lebih besar. Material awal terdiri dari sel dengan plasma membran yang terganggu. diffusion coefficient dalam konteks membran, suatu cara untuk mengekspresikan pergerakan kesamping dari membran; untuk lemak, koefisien difusinya adalah 2 µm2 s-1. digitalis campuran dari cardiotonic steroids yang didapat dari daun kering tanaman foxglove; steroid ini menghambat pompa sodium-potassium pump. dihedral angle suatu ukuran untuk sudut rotasi dari suatu ikatan, biasanya diambil antara -180 dan +180 degrees. Juga disebut dengan torsion angles. dihydrofolate reductase enzim yang mengkatalis regenerasi tetrahydrofolate dari dihydrofolate dibentuk pada sintesis dari thymidylate. Hal 19 (10605016, Ayukireina Siskahaning P.) (10605091, Nur Mustaqim 19-36) diphtheria toxin suatu racun, diproduksi oleh Corynebacterium diphtheriae, yang mendapatkan jalan masuk ke dalam sel dengan bantuan endositosis media reseptor dan membunuh sel dengan ADP-ribosylation dari sintesi elongasi protein faktor 2, ini menghambat semua sintesis enzim. direct repair suatu cara memperbaiki DNA yang rusak dimana daerah yang rusak diperbaiki. Sebagai contoh, pirimidin dimmer sangat mudah dilipat untuk mengembalikan nukleotida aslinya. dismutase suatu enzim yang mengkatalis reaksi dismutation dimana satu reaktan diubah menjadi dua produk yang berbeda. distributive enzyme enzyme yang mengkatalis elongasi aau degradasi dari suatu polimer tapi terpisah dari polimer - polimer yang lain setelah tiap proses katalis. disulfide bond ikatan kovalent yang terbentuk hasil oksidasi dari dua gugus sulfidril; oksidasi dari residu sistein dalam polipeptida menghasilkan ikatan disulfida menghubungkan dua residu tersebut. divergent evolution proses evolusi dari suatu protein dimana suatu property protein dihasilkan dari nenek moyang yang sama. DNA gyrase suatu topoisomerase yang mengkatalis ATP-driven yang merupakan pengenalan yang bersifat negatif kepada DNA. Juga disebut sebagai topoisomerase II. DNA ligase suatu enzim yang mengkatalis formasi dari ikatan phosphodiester antara gugus 3'-OH group pada akhir dari salah satu rantai dan dari gugus 5'-phosphate pada akhir rantai yang satu lag; enzim ini mempunyai peran pada proses sintesis, perbaikan, dan pemotongan DNA. DNA polymerases Enzime yang mengkatalis template, unit tambahan dari



deoksinucleotida, dengan menggunakan deoksinukleotida triphosphates sebagai substrat, kearah akhir 3’ dari suatu rantai DNA; rantai tumbuh dengan arah dari 5'-ke 3'; contoh enzim yng mereplikasi dan memperbaiki DNA. DNA probe pelabelan radioaktif, untai tunggal dari urutan spesifik basa digunakan untuk menentukan lokasi dari untai pelengkap diantara fragmen DNA dilihat pada gel elektroforesis. DNA-binding domain struktur wilayah yang berfungsi dalam faktor transkripsi yang mengenali dan terika pada untai DNA tertentu. Lihat juga activation domain. dolichol phosphate lemak, yang terdapat pada membran RE, mengandung kira - kira 20 unit isoprene units yang berfungsi sebagai pembawa dari oligosaccharides yang nantinya akan menempel keprotein. domain suatu unit mandiri yang dilipat pada struktur tertier rantai polipeptida; mungkin mengandung beberapa struktur sekunder. Dalam multikompleks enzim, tiap domain bisa menjalankan satu atau lebih proses katalis. Pada protein, suatu unit globular yang mengandung 100 sampai 400 unit residue, memungkinkan terjadinya penggabungan domain yang satu dengan yang lain dengan bantuan segment polipeptida yang flexsible; biasanya dikode oleh spesifik exon pada daerah yang menghasilkan protein. Hal 20 (10605017, Adisty Sri Mulianty) double-displacement reaction, reaksi pergantian ganda Reaksi yang memiliki banyak substrat dimana satu atau lebih produknya dilepaskan sebelum semua substrat berikatan dengan enzim. Ciri yang menentukan/membedakan reaksi-reaksi ini adalah pembentukan enzim intermediet-pengganti yang juga disebut reaksi “ping-pong”. dynamic instability, ketidakstabilan dinamis sifat mikrotubula dimana beberapa mikrotubula dalam satu populasi memanjang sementara yang lain memendek secara bersamaan; hasil dari fluktuasi acak dalam jumlah subunit tubulin-GTP atau subunit tubulin-GDP pada ujung mikrotubula. Polimer tubulin-GTP lebih banyak dibaca. dynein protein berukuran besar dengan aktivitas ATPase yang merupakan komponen dari mikrotubula; aktivitas ATPase menyediakan energi untuk pergerakan silia dan flagella. Dalam sitoplasma, protein penggerak yang berhubungan dengan dynein pada flagella dan silia memberikan tenaga pada transport mundur. E Edman degradation, degradasi Edman Pemindahan sekuen asam amino N-terminal dari protein seperti derivatif feniltiohidantoin; digunakan dalam pengurutan protein. EF hand, Tangan EF Motif putaran helix yang membentuk tempat ikatan untuk kalsium; ditemukan pada banyak protein sensitive kalsium. eicosanoid senyawa karbon yang terdiri atas 20 atom karbon; contohnya adalah prostaglandins. Eicosanoid sering berperan sebagai hormon lokal. electrophoresis, elektroforesis Teknik yang digunakan untuk memisahkan molekulmolekul yang bermuatan, seperti protein dan asam nukleat, yang didasarkan pada fakta bahwa molekul seperti itu akan bergerak dengan kecepatan berbeda pada bidang elektrik,



bergantung pada faktor-faktor seperti muatan bersih, ukuran, dan bentuk molekul. electrospray ionization mass spectrometry Suatu cara untuk menentukan massa protein. Sampel protein disemprotkan ke dalam spektrometri massa, dan massa dari protein ditentukan oleh perbandingan massa dan muatan protein yang berbeda dalam jumlah proton yang terikat. ELISA (enzyme-linked immunoabsorbant assay) Uji untuk mengukur keberadaan antigen dengan menggunakan enzim yang dihubungkan pada antibodi dari antigen yang bersangkutan. elongation, elongasi Bagian kedua dari tiga tahap keseluruhan reaksi polimerisasi biologi. Pada tahap ini, polimerisasi diakibatkan oleh pengulangan karakteristik proses utama dari molekul spesifik yang disintesis. elongation factor, faktor elongasi : Satu dari kumpulan protein yang memfasilitasi fase elongasi dari sintesis protein. elongation factor G (EF-G) Anggota dari keluarga protein-G yang menyerupai kompleks EF-Tu dan tRNA. Hidrolisis GTP oleh EF-G menyebabkan tRNA dan mRNA bergerak melewati ribosom menyesuaikan jarak ke satu kodon. Hal 21 (10605018, Pramila Deva E.) elongation factor Ts (EF-Ts) protein yang terikat pada GDP membentuk EF-Tu dan memyebabkan lepasnya GDP, dan memungkinkan EF-Tu untuk berparisipasi dalam proses elongasi yang lain. elongation factor Tu (EF-Tu) anggota dari kelluarga G-protein yang mengantarkan aminoacyl-tRNAs ke sisi A dari suatu ribosome bersamaan dengan berlangsungnya proses hidrolisis dari GTP ke GDP. Embden-Meyerhof pathway glikolisis. enantiomers sepasang molekul, masing- masing mempunyai stu atau lebih atom C kiral, yang saling tumpang tindih jika keduanya dihadapkan. endocytosis proses membuat bagian eksternal membran menjadi bagian dalam dengan invaginasi dan melipat sel membran. endoplasmic reticulum (ER) perluasan dari system membran sitoplasmik yang terdiri dari setengah total sel membran. Wilayah dari RE yang berikatan dengan ribosom disebut RE kasar sedangkan yang tidak memiliki ribosom disebu RE halus. endosome komponen dari jalur endositosis mediate reseptor dimana keputusan untuk mensortir tentang perlu tidaknya material endositosis dibuat; endosomes diurunkan dari vesikula- vesikula yang kehilangan jubah clathrinnya. energy charge suatu car untuk menentukan status energi dari suatu sel, sama dengan konsentrasi ATP ditambah 1,5 konsentrasi dari ADP, dan semuanya dibagi dengan total konsentrasi adenin. enhancers untai DNA ynag tidak mempunyai promotor untuk beraktifitas, tapi bisa meningkatkan aktifitas promotor yang lain; yang menaikkan aktifitas bisa menghasilkan efek stimulatory dari jarak beberapa ribu nukleotida. enhancers can exert their



stimulatory effect over a distance of several thousand nucleotides. enol phosphate suatu campuran dengan kandungan potensial phosphoryl tinggi karena gugus phosphoryl menjebak molekul dalam keadaan enol yang tidak stabil. Pada saat transfer osfat, molekul berubah menjadi struktur keton yang lebih stabil. entropy suau ukuran derajat ketidak teraturan dlam sistem; dengan symbol S dalam termodinamika, perubahan pada entropy menjadi naik pada saat system menjadi tidak teratur dan menurun saat system sedikit teratur. enzymatic cascade suatu untai reaksi dimana, disetiap langkahnya, suatu produkmenstimulus terjadinya reaksi, menggenerae signal dan stimulus dalam kadar yang relatif kecil. enzymes makromolekul biologi yang bertindak sebagai katalis untuk proses reaksi biokimia; meskipun hampir semuanya tersusun dari suatu protein, baru - baru ini telah ditemukan proses katalis yang disebabkan oleh RNA yang aktif. Hal 22 (10605019, Rosmawanti Fadjrin K) Enzyme multiplicity Strategi pengaturan yang mana dilakukan langkah biasa kepada beberapa jalan adalah mengkatalisasi enzyme berbeda yang sama property katalisasinya, tetapi berbeda property regulatornya. Enzyme-substrat Kompleks produk dari ikatan spesifik diantara bagian aktif dari enzyme dan subtract. Epimers Pasangan-pasangan molekul, yang setiap molekulnya lebih dari satu pusat asimetris, yang berbeda susunan di satu pusat saja; glukosa dan galaktosa merupakan epimers, perbedaannya hanya terletak pada konfigurasi pada C-4. Epimerases Enzym yang mengkatalisasi perubahan pada epimers pada senyawa. Epinephrine Katekolamin dilepaskan oleh medulla adrenal dalam merespon terhadap aktivitas otot atau mengharapkan aktivitas otot agar dapat merangsang penghancuran dari glikogen otot. Disebut juga adrenalin. Epitope Bagian spesifik pada antigen yang dikenali sebagai antibody. Diketahui juga sebagai determinat antigenic. Erythromycin Antibiotik yang mengikat 50S ribosomal subunit dan menghalangi perpindahan tempat peptide dalam prokariot. Essential asam amino Asam amino yang tidak dapat disintesis de novo dan oleh karena itu harus didapatkan dari makanan; pada mamalia dewasa terdapat paling tidak 9 asam amino benar-benar dipertimbangkan intisarinya. Eubacteria Bentunk paling umumdari extant prokariot. Excinuclease Enzyme uvrABC yang memindahkan timidin dimmer dengan menghidrolisis bagian rantai DNA yang rusak di satu sisi dan di sisi lainnya dari bagian dimmer. Exons Bagian dari pre-mRNA yang tertahan di mRNA dewasa. Exon shuffling Sebuah hipotesis yang menganjurkan agar protein baru berdiri pada



evolusi dengan melakukan penataan ulang exon yang ditandai dengan struktur unsure yang mempunyai cirri-ciri sendiri. Exonuclease Enzyme yang mencernakan asam nukleat dari molekul akhir, dari pada pada bagian dalam; exonuclease dapat dispesifikkan untuk pencernaan dari 3’ atau 5’ akhir dari asam nukleat. Extinction coefficient (å) Ukuran kemampuan senyawa untuk menyerap cahaya, pemberian pada setiap unit, yang mana unit tersebut merupakan timbal balik molaritas dan jarak dalam sentimeter (M-1 cm-1 ). Extrinsic clotting pathway “Blood-cloting” mengalir pada aktivitas enzyme yang dikenali oleh aktivasi factor VII dan pelepasan factor jaringan lipoprotein, dimana keduanya digerakkan oleh jaringan trauma. Hal 23 (10605020, Ega Wisnu Adiguna) Fab fragment satu dari dua rantai polipeptida 50-kd yang diproduksi saat immunoglobulin G terlipat oleh protease papain; fragment Fab mengikat anigen tetapi tidak bisa menyatukan antar antigen, karena tiap fragment hanya punya satu sisi aktif untuk satu antigen. bind antigens but cannot cross-link them, because each fragment has only one binding site for an antigen. Fc fragment satu dari dua rantai polipeptida 50-kd yang diproduksi saat immunoglobulin G terlipat oleh protease papain; fragment Fc yang lengkap dengan IgG molekul tidak bisa berikatan dengan antigen tetapi bisa menjadi media untuk aktivitas penting biologi lainnya sepert fiksasi. facilitated diffusion Transport dari suatu ion atau molekul menurini gradien konsentrasi, diamana.G untuk species yang ditransprkan bernilai negatif. Disebut juga dengan pasif transport. F-actin filamen dari monomer G-actin yang bersifat polar, merangkai sendiri, dan polimer yang dinamik. facultative anaerobes organisme yang bisa bernafas secara aerob dan anaerob, menggunakan fermentasi sebagai sumber dari energi selular, pada saat oksige tidak ada. FAD and FADH2 (flavin adenine dinucleotide) sutu pembawa electron yang penting dalam oksidasi bahan bakar molekul. Mengoksidasi bentuk FAD dan mereduksi bentuk FADH2. dan mengandung flavin moiety dan unit AMP; electron dibawa pada isoalloxazine dari suatu melekul. familial hypercholesterolemia penyakit yang berasal dari tidak berfungsinya reseptor endositosisuntuk kolesterol. Penyakit ini menyebabkan kadar kolesterol dalam darah meninggi dan mengakibatkan penyempitan pembuluh darah dan serangan jantung. fatty acid synthase suatu sisem enzim yang mengkatalis sintesis dari suatu rantai panjang asam lemak dari asetil CoA, malonil CoA, dan NADPH; pada bakteri, unsur pokok dari kompleks pensintesisan bisa dipisahkan pada saat ekstrak sel siap; pada mamalia, semua unsure pokok aktivitas enzim pada sintesis asam lemak adalah bagian dari polipeptida yang sama.



fatty acids asam karboksilat yang mengandung rantai hidrokarbon yang panjang yang merupakan sumber bahan bakar penting seperti komponen penting pada membran lemak. feedback inhibition suatu metode regulasi enzim dimana produk akhir dari suatu biosintesis menghambat enzim yang pertama kali mengkatalis pada jalur metabolisme. feedforward stimulation pengaktivasian dari enzim allosteric dengan menggunakan produk hasil reaksi yang pertama kali terjadi dalam jalur metabolisme. fermentation proses menghasilkan ATP dimana komponen organic bertindak sebagai donor dan penerima electron; fermentasi bisa dilakukan pada lingkungan yang tidak ada oksigennya. Hal 24 (10605022, M. Fernando) ferrihemoglobin hemoglobin yang mana komponen besi dari gugus prostetik heme adalah dalam bentuk ferri (+3); ferrihemoglobin tidak bisa mengikat oksigen. ferrohemoglobin hemoglobin yang mana komponen besi dari gugus prosterik adalah dalam bentuk ferro (+2); ferrohemoglobin dapat mengikat oksigen. fertility factor, factor fertilitas sebuah plasmid bakteri yang mengandung gen-gen yang dibutuhkan untuk konjugasi. first messenger hormon; molekul-molekul yang mentranduksi sinyal dari satu jaringan ke jaringan yang lain (jaringan target) melalui darah Fischer projection, proyeksi fischer merupakan gambaran stereokimi dari molekul. Dalam proyeksi Fischer suatu molekul, atom-atom bergabung pada atom karbon asimetrik dengan mengikat secara horizontal dan vertical. flagella, eukaryotic struktur menyerupai rambut yang disusun oleh mikrotubul dan terletak di permukaan sel; pergerakannya mendorong sel. flagella, prokaryotic bagian ekstraseluler yang digunakan untuk pergerakkan bacteria; dibutuhkan energi yang diturunkan secara langsung dari pompa-proton melalui membrane sel Flagellin komponen protein dari flagella bakteri Flavin pembawa electron yang menggunakan riboflavin dalam reaksi electron-transer; FAD, FADH2, FMN, dan FMNH2 adalah contoh flavin Flavin mononukleotida (FMN) Ko-enzim untuk reaksi oksidasi-reduksi yang diturunkan dari vitamin riboflavin. Akseptor electron dari FMN, cincin isoalokazin, identik dengan FAD, tetapi FMN kehilangan komponen adenil nukleotida dari FAD. Flavoproteins protein yang berasosiasi dengan FAD atau FMN; flavoprotein berperan penting dalam banyak reaksi oksidasi reduksi Fli G sebuah protein bakteri flagelar yang merupakan bagian dari cincin MS (membrane dan supermembran) ; Fli G dalam kombinasi dengan protein flagelar MotA/MotB, membentuk sebuah saluran proton yang mengendarai rotasi dari flagela Model mozaik fluid gambaran dari membrane sebagai solusi dua dimensional dari lipid dan protein globular fluid mosaic model,



fluorescence photobleaching recovery technique (FRAP) merupakan teknik untuk mengukur fluiditas membrane yang mana komponen membrane dilabeli dengan molekul flouresen. flourouracil analog dari d UMP yang menghambat metilasi dari d UMP untuk membentuk timidilat; flouroasil digunakan dalam kemoterapi hal 25 (10605023, Sarah Saqina) Footprinting, penjejakan . adalah sebuah teknik untuk menentukan tempat pelekatan protein pada DNA. DNA akan di cerna dengan atau tanpa kehadiran protein. Urutan yang dilindungi dari proses mencerna oleh protein akan diidentifikasi. Urutan ini dimanakan footprint dari protein. Free energy, Energi bebas. Sebentuk energi mampu digunakan untuk bekerja dalam kondisi suhu dan tekanan yang konstan. Dan sejumlah energi dikeluarkan oleh sebuah reaksi kimia, dilambangkan dengan symbol G dalam Termodinamika. Perubahan energi bebas ( ∆ G ) dari system yang mengalami perubahan dalam tekanan tetap sama dengan perubahan Enthalpi ( ∆ H ) dikurangi dengan hasil suhu mutlak ( T ) dan perubahan entrophi ( ∆ S ) Free energy activation, Aktivasi Energi bebas. Energi yang dibutuhkan untuk membentuk fase transisi dari substrat reaksi Frictional coefficient, koefisien friksi / koefisian gesekan. Karakteristik dari molakul yang sesuai dengan bentuk molekulnya. Koefisien ini dikalikan dengan kecepatan saat molekul bergerak melewati medium berisi hambatan untuk pergerakan molekul. Functional Magnetic Resonance Imaging ( f MRI ), pencitraan resonansi magnetic fingsional .Sebuah teknik penggambaran yang didasarkan pada dari (1) fakta bahwa kemampuan magnetic dari Oxyhemoglobin dan deoxyhemoglobin berbeda dan dapat dibedakan dan (2) fakta bahwa, saat bagian spesifik dari otak aktif, pembuluh darah di otak relaksasi, yang menyebabkan lebih banyak darah dapat melewatinya. Sehingga bagian otak yang aktif tadi kaya akan Oxyhemoglobin. Furanose, furanosa cincin segi lima heterosiklik yang terbentuk saat monosakarida berputar untuk membentuk Hemiasetal atau Hemiketal. Cincin segi lima yang mengandung oksigen mirip dengan cincin dari furan G α sub-unit pengikat mukleotida Guanil dari heterometrik G protein Gβã komponan dimerik dari protein G yang membantu mempertahankan komponen Gα dari keadan inaktif. Dalam beberapa jalur transduksi sinyal,komponen Gβã dapat juga berfungsi sebagai messenger kedua G- protein (Protein G) , protein yang berikatan dengan nukleotida guanil yang merupakan komponen jalur sinyal intraselular. Dalam kondisi inaktif protein G ( yang biasa disebut dengan protein G heteomerik ) adalah protein trimerik yang mengandung sub unit αβã, dengan GDP yang berikatan dengan sub unit α. Di sisi aktif protein α, GDP berubah menjadi GTP dan berdisosiasi dari sununit βã. Ikatan GTP dengan subunit α mempropagasi sinyal. Propagasi sinyal dihilangkan saat subunit α menghidrolisis GTP menjadi GDP dan bergabung kembali dengan subunit βã.



G- actin . monomer aktin yang bergabung untuk membentuk filament yang disebut aktin -F G ( olf ) sebuah sub unit α , yang terekspresikan secara unik dalam cilia olfaktori dari protein G yng bergabung dengan receptor Odorant. Hal 26 (10605024, Jayanti Anggraeni) galactosemia Penyakit berupa muntah-muntah, diare, disfungsi hati, dan terkadang terhambatnya perkembangan mental, disebabkan oleh akumulasi galaktosa karena defisiensi transfer galaktosa 1-fosfat uridyl. β-galactosidase Enzim essensial yang menghidrolisis laktosa menjadi galaktosa dan glukosa dalam metabolisme laktosa. ganglioside Sebuah ceramide, biasa terdapat di sistem saraf, dimana oligosakarida dihubungkan dengan ceramide tersebut oleh residu glukosa. gap junctions Jalur antara bagian dalam dua sel yang berdekatan/berbatasan. Juga dikenal sebagai saluran sel ke sel. GC box Komponen dari beberapa promotor sel eukariot, terutama pada diekspresikannya gen. Urutan umum untuk GC box adalah 5'-GGGCGG-3'. gel-filtration chromatography Teknik pemisahan berdasarkan perbedaan ukuran. Sampel dimasukkan ke kolom berpori. Molekul besar berpindah melalui kolom lebih cepat dibanding molekul kecil karena molekut tersebut tidak dapat memasuki pori dan memiliki jalur yang lebih singkat. gene duplication Duplikasi gen pada proses replikasi. Salah satu produknya dapat mengakumulasikan mutasi dan secara berkala berevolusi menjadi gen berbeda tetapi terkait fungsinya. general acid-base catalysis Katalisis dimana molekul selain air melakukan pengaturan pada donor proton atau penerima proton. general acid catalysis Katalisis asam dimaa sumber protonnya adalah gugus donor yang memiliki atom H+ berlebih. genetic code Hubungan antara rangkaian informasi asam nukleat dan rangkaian informasi protein. genomic library Kumpulan fragmen DNA, yang disisipkan pada molekul vektor, yang menampilkan keseluruhan genom suatu organisme. gigaseal Ciri resitansi (perlawanan) tingakat tinggi yang dibentuk antara pipet dan potongan kecil membran plasma, dibutuhkan dalam teknik patch-clamp. globin fold Struktur lipatan rantai polipeptida, terbentuk dari myoglobin dan subunit hemoglobin, yang menciptakan lingkungan untuk mengikat oksigen pada gugus heme secara reversibel. Glucagons Hormon polipeptida yang diseksresikan oleh sel-sel α pankreas saat tingkat glukosa darah rendah dan memecah glikogen di hati dan melepas glukosa ke darah.



Hal 27 (10605025, Lise Yusanti) Glucocorticoids, glukokortikoid jenis hormon steroid, disintesis oleh korteks adrenal dan dibuat salinan oleh kortisol, yang mengembangkan glukoneogenesis, susunan dari glikogen, dan degradasi lemak dan protein. Glucogenic amino acid, asam amino glukogenik asam amino dengan rangka karbon, seluruhnya atau sebagian, dapat diganti menjadi substrat untuk glukoneogenesis. Gluconeogenesis, glukoneogenesis sintesis glukosa dari prekursor nonkarbohidrat, termasuk laktat, gliserol, dan asam amino. Glucose homeostasis, homeostasis glukosa pemertahanan nilai konstan glukosa di dalam darah. Glucose 6-phosphatase, glukosa 6-fosfatase protein membran dari bagian lumen retikulum endoplasma yang mengkatalisis susunan glukosa bebas dari glukosa-6-fosfat. Di hati, enzim memainkan peranan penting dalam mempertahankan nilai glukosa darah. Glucose 6-phosphate, glukosa 6-fosfat perantara penting dalam metabolisme yang dapat diproses menjadi glukosa bebas, disimpan sebagai glikogen, dioksidasi untuk menghasilkan NADPH dan ribose, atau dimetabolisasi untuk menghasilkan energi sel baik secara aerob maupun secara anaerob. Glucose 6-phosphate dehydrogenase, dehidrogenase glukosa 6-fosfat enzim yang menginisiasi fase oksidatif dari siklus fosfat pentosa dengan mengoksidasi glukosa 6fosfat menjadi 6-fosfoglukono-laktone untuk menghasilkan satu molekul NADPH. Glucose transporter, pengangkut glukosa protein membran integral terdiri atas rantai polipeptida tunggal yang mempunyai 12 segmen transmembran dan memfasilitasi pergerakan glukosa melalui membran plasma menuju sel. Glutamate dehydrogenase, dehidrogenase glutamat enzim yang mengkatalisasi deaminasi oksidatif glutamat, menghasilkan ion ammonium dan α-ketoglutarat. Glutamine phosphoryl amidotransferase, amidotransferase fosforil glutamine enzim yang mengkatalisasi langkah penyatuan pada sintesis purin, yang mana penggantian pirofosfat pada 5-fosforibosil-1-pirofosfat oleh ammonia untuk menghasilkan 5fosforibosil-1-amin dengan amin pada konfigurasi β. Glutathione (ã-glutamylcysteinylglycine or GSH) tripeptida yang berperan dalam menyerang tekanan oksidatif dengan mempertahankan reduksi bagian sel. Siklus glutathione antara reduksi (GSH) dan oksidasi (GSSG). Glycerol 3-phosphate shuttle - cara mentransfer elektron dari NADH sitoplasmik ke dalam mitokondria; dihidroksiaseton fosfat (DHAP) direduksi oleh NADH menjadi gliserol 3-fosfat, yang memasuki mitokondria dan dioksidasi untuk menghasilkan FADH2 dan DHAP, yang meninggalkan mitokondria. Glyceryl ether phospholipids, fosfolipid eter gliseril fosfolipid yang berisi lebih banyak eter daripada unit asil pada C-1 dan disintesis lebih banyak dimulai dengan dihidroksiaseton fosfat daripada gliserol fosfat. Glycoforms - bentuk protein khusus yang berbeda hanya dalam pola glikosilasi.



Hal 28 (10605026, Leonard R. Aditya S.) glikogen Sebuah bentuk penyimpanan dari glukosa yang telah siap disalurkan di mana monomer glukosa terhubungkan dengan ikatan α -1,4-glikosidik dengan cabang (ikatan α -1,6-glikosidik) pada setiap residu kesepuluh. glycogen,



degradasi glikogen Pembelahan glikogen dengan fosforolisis yang dikatalisasi oleh glikogen fosforilase untuk membentuk glukosa 1-fosfat yang dapat diubah menjadi glukosa 6-fosfat. glycogen degradation,



glikogen fosforilase Sebuah enzim yang mengkatalisasi fosforolisis dari glikogen untuk membentuk glukosa 1-fosfat; sebuah enzim alosterik yang aktivitasnya akan diregulasi lebih jauh dengan modifikasi kovalen reversibel. glycogen phosphorylase,



penyakit penyimpanan glikogen Penyakit inheritas apapun yang memiliki karakter ketidakmampuan untuk menyimpan ataupun menggunakan glikogen secara tepat glycogen storage diseases,



sintase glikogen Sebuah enzim alosterik yang dapat diregulasi secara kovalen dan reversibel dan bertanggung jawab terhadap sintesis dari glikogen; enzim ini mentransfer glukosa dari UDP-glukosa ke kelompok hidroksi pada terminus C4 dari glikogen glycogen synthase,



sintesis glikogen Sintesis glikogen dari UDP-glikogen yang dikatalisis oleh enzim sintase glikogen glycogen synthesis,



glycogenin Sebuah protein yang mengandung sebuah oligosakarida dari suatu ikatan α-1,4-glukosa dan merupakan primer dari sintase glikogen. Glikogenin



unit



menggunakan UDP-glukosa untuk mengkatalisis autoglikosilasinya sendiri Lipid yang mengandung gula yang diturunkan dari sfingosin (sphingosine); separuh dari gula tersebut menempel pada alkohol dari sfingosin glycolipids



glikolisis Sebuah sekuens reaksi yang mengubah glukosa menjadi piruvat dengan energi yang dihasilkan dari penggenerasian energi yg terjadi pada saat yang sama dengan sesuatu yg lain glycolysis,



glikoprotein Protein yang terhubung dengan paruhan dari suatu karbohidrat spesifik glycoproteins,



glikosaminoglikan Sebuah heteropolisakarida yang terbuat dari unit disakarida yang berulang dan mengandung gula amino glukosamin atau galaktosamin glycosaminoglycan,



glikosidase Sebuah golongan enzim yang memisahkan ikatan glikosidik; lisozim adalah glikosidase glycosidase,



ikatan glikosidik Sebuah ikatan kovalen antara gugus aldehid atau keton dari suatu monosakarida dengan suatu atom oksigen, nitrogen, atau sulfur dari molekul lain. Suatu hubungan glikosidik yang paling umum adalah hubungan atom O antara atom karbon anomerik dari suatu gula dengan kelompok hidroksil dari sakarida lain glycosidic bond,



glikosiltransferase Suatu enzim apapun yang mengkatalisis formasi dari ikatan glikosidik glycosyltransferase,



siklus glioksilat Sebuah jalur metabolisme yang mengubah unit duakarbon menjadi suksinat (succinate) untuk produksi energi dan biosintesis; pada umumnya ditemukan pada bakteri dan tumbuhan, siklus ini melalui dua langkah dekarboksilasi pada siklus asam sitrat dan memungkinkan formasi jala dari glukosa dan molekul lain untuk melewati oksaloasetat dari asetat atau asetil KoA. glyoxylate cycle,



Hal 29 (10605028, Gita Ratna L) Proses pembentukan asetat dan acetyl CoA, menjadi glukosa dan molekul-molekul lainnya, menggunakan oxalo-acetate. glyoxysomes Organela tumbuhan (plantae) dimana terdapat jalur untuk enzim dari glyoxylate. Golgi complex Berada di dalam crytoplasm, tumpukan kantung/ruang membran, merupakan bagian dari pusat pengaturan protein yang berada dalam membran sel, dan lumen dari organel gout Sebuah penyakit yang memiliki ciri-ciri berupa persendian dan ginjal menjadi merah, bengkak, dan sakit, diakibatkan oleh dihasilkannya sodium urate(hasil penguraian dari purines) dalam jumlah di atas batas normal. G-protein-coupled receptor Lihat penjelasan tentang seven-transmembrane-helix receptors granum Sebuah atau setumpuk membran thylakoid yang berada di dalam chloroplast. granzymes Enzim proteolytic yang disekresikan oleh “sel T yang diaktifkan”(activated T cells), ke dalam sel target untuk memulai proses apoptosis. green fluorescent protein Suatu protein yang dapat memancarkan cahaya, diambil dari ubur-ubur Aequorea victoria. Karena protein tersebut dapat dihubungkan dengan protein lainnya menggunakan teknik rekayasa genetika, maka protein dapat digunakan untuk memetakan(menentukan lokasi) protein lain di dalam sel. group-transfer reaction Sebuah reaksi dimana sekelompok zat kimia dipindahkan dari satu molekul ke molekul lainnya. guanylate cyclase Sebuah enzim yang menjadi katalis dalam proses pembentukan cGMP, sebuah pengirim pesan kedua dari GTP. gustation Indra perasa(indra perasa dari lidah) gustducin Sebuah subunit- α dari protein-G yang utamanya dihasilkan dalam taste buds (tonjolan di lidah, berfungsi sebagai indra perasa), dan diasosiasikan dengan perasa pahit dan manis 7TM. H hair cells Neuron khusus yang berada di dalam cochlea dari bagian dalam telinga. Hair cell menggunakan sekumpulan stereocilia yang saling terhubung untuk mendeteksi adanya gerakan dan kemudian memulai jalur proses perubahan sinyal suara menjadi sinyal elektrik(transduction) pada sistem pendengaran. hairpin loop Sebuah lingkaran dari nucleic acid yang dibentuk melalui proses



pembentukan duplex dalam sebuah untaian(mis: untaian rantai dna). hapten Sebuah molekul asing berukuran kecil yang dapat membentuk antibodi tertentu sebagai respon jika dihubungkan dengan sebuah molekul ukuran besar. Golongan dinitrophenyl efektif dalam menghasilkan respon berupa antigenic dan telah banyak digunakan sebagai penentu adanya molekul hapten. Hal 30 (10605032, Rina Listyaningrum) proyeksi hawort penggambaran dari karbohidrat siklik dimana setiap pandangan cincin adalah tegak lurus ke pandangan dari halaman dimana cincin karbon tidak secara jelas diperlihatkan. Haworth projection,



HDL (high-density lipoprotein) lipoprotein yang mengumpulkan kolesterol untuk dikeluarkan ke dalam darah dari sel atau membrane yang hendak digantikan. heat-shock proteins kelompok protein yang terdapat dimana-mana yang disintesis dalam respon untuk stress seperti kejutan panas dimana terjepit di polipeptida yang tidak melipat dan membantu dalam pelipatan kembali. heavy (H) chain 50-kd polipeptida dimana 1 dari 2 tipe dari pasangan rantai yang ditemukan dalam molekul G immunoglobin, masing-masing rantai berat terdiri atas variable region dan 3 region konstan, masing-masing rantai berat dihubungkan dengan ikatan disulfide ke rantai cahaya. heavy meromyosin (HMM) disepanjang dengan meromyosin, salah satu dari tryptik produk pencernaan dri myosin, dikuasai oleh aktifitas ATPase dan kemampuan untuk mengikat aktin tapi bukan berasal dari filament. Helicases enzim yang mengkatalisa penggerak ATP untuk tidak memilin asam nukelat, DNA helikase penting dalam replikasi DNA. helix-turn-helix pengulangan pola yang ditemukan pada banyak DNA-pengikatan protein, dimana 2 a-helikal segment disambungkan dengan lengkungan pendek; dengan 2 segmen adalah bagian 34 Å, dimana memungkinkan untuk bergabung dalam kelompok besar dalam DNA. helper T cells sel-sel T yang mengstimulasi proliferasi dari spesifik B limfosit dan sitotoksik T sel. Heme kelompok prostetik dari myoglobin dan hemoglobin sebagai protein lain;terdiri dari konstitusi organic, protoporphyrin dan atom besi. Hemiacetal kompleks terbentuk dari reaksi fungsional kelompok aldehid kelompok hidroksil; contohnya C-1 kelompok atas rantai terbuka dari glukosa bereaksi dengan C-5 kelompok hidroksil untuk membentuk hemiasetal intermolecular Hemiketal kompleks terbentuk dari reaksi antara kelompok ketone dan kelompok hidroksil; contohnya, C-2 kelompok keton atas rantai terbuka dari fruktosa bereaksi dengan C-5 kelompok hidroksil untuk membentuk hemiketal. Hemoglobin protein alosterik yaitu oksigen primer-membawa protein di vertebrata; berperan dalam transportasi dari CO2 dan H+. Hemoglobinopathy kekacauan genetika dari hasil beberapa mutasi produk tidak



efisiennya jumlah hemoglobin normal atau ketidakaftifan jumlah normal dari rantai hemoglobin Hemophilia kekacauan dari penggumpalan darah, dimana satu atau protein lain pada jalur pembekuan darah tidak aktif atau hilang. Hal 31 (10605033, Rafi Herfini) heptoses Monosakarida yang mempunyai tujuh atom karbon. hereditary nonpolyposis colorectal cancer (HPCC) Suatu bentuk yang biasa diturunkan pada penyakit kanker usus besar disebabkan tidak sempurnanya perbaikan dari DNA yang tidak sebanding. Hers disease Penyakit yang diakibatkan karena kekurangan glycogen phosphorylase hati, glycogen menimbulkan naiknya jumlah dengan sedikit efek klinis. heterotrophs Organisme yang mendapat energi hanya dari bahan bakar kimia dan akhirnya bergantung kepada autotrof untuk bahan bakar. heterotropic effects Efek dari molekul nonsubstrat pada enzim. hexokinase Suatu kinase yang memfosforilase enam gula karbon, biasanya glukosa, di lakukan oleh ATP. hexoses monosakarida yang mempunyai enam karbon. high-density lipoprotein (HDL) Suatu lipoprotein yang mengambil kolesterol dari sel yang sekarat, dari membran dikeluarkan, di esterifikasi, lalu kolesterol ester di transfer ke hati dan jaringan lainnya. histone acetyltransferase (HAT) Enzim yang mengkatalis kumpulan asetil dari aselit KoA menjadi sisa spesifik residu di daerah terminal amino darihistone. enzim ini mempunyai peran penting di dalam modifikasi struktur kromatin yang mempertinggi transkripsi. histone deacetylase Enzim yang mengkontribusi penghambatan proses transkripsi dengan deasetilasi dari sisan asetilasi lisin di histones. histones tingginya konsentrasi sekumpulan kecil protein ditemukan di eukariot bergabung dengan DNA untuk membentuk nudeosomes. Holliday junction Struktur yang bersilang, dibentuk dari empat rantai polinukleotida yang merupakan kunci lanjutan di proses rekombinan. holoenzyme Enzim yang mengandung komponen protein membangun tubuh utama dari enzim (apoenzim) dan kofaktor yang penting, dan biasanya kecil. homologous recombination Rekombinasi diantara segmen yang homolog dari dua molekul DNA, dan biasa disebut rekombinasi umum. Homologs Molekul yang berkembang dari leluhur yang biasa, juga berfungsi sebagai molekul yang homolog. homotropic effects Efek dari molekul substrat di enzim allosteric. horizontal gene transfer perpindahan rangkaian dari DNA (plasmid) diantara spesies



yang menyediakan keuntungan di lingkungan yang khusus. Hal 32 (10605034, Dian Rachmi R) hormone response elements (HREs), elemen-elemen perespon hormone Urutan DNA spesifik yang dapat mengikat anggota famili reseptor inti sel dari factor trankripsinya; HREs pada reseptor steroid berupa urutan palindromik 6-bp yang terpisah oleh 3-bp. hormone-binding domain, domain pengikat hormone Sebuah domain penyimpan 240 residu di dalam anggota superfamili reseptor inti sel dari faktor transkripsi, yang dapat mengikat hormone atau molekul hormone, sehingga dapat mengaktivasi faktor tersebut. human immunodeficiency virus (HIV), virus pengganggu kekebalan manusia Penyebab dari sindrom penyerang kekebalan, acquired immune deficiency syndrome (AIDS). HIV akan menghancurkan sel T (helper T cells) melalui peningkatan permeabilitas membran sel T. Kekukarangan sel T, dapat melumpuhkan system kekebalan (imun), membawa korbannya mudah rentan terhadap banyak macam infeksi. human leukocyte antigen (HLA), antigen leukosit manusia Nama ini diberikan kepada anggota utama protein histokompabilitas kompleks dalam tubuh manusia. humoral immune response, respon kekebalan humoral sebuah sistem untuk pengenalan substansi asing yang menggunakan antibody terlarut, untuk mengikat pada sesuatu dan menginaktivkan substansi tertentu. hybridization, hibridisasi sebuah teknik yang digunakan untuk menentukan kekerabatan asam nukleat melalui pengujian kemampuan dari suatu sampel rantai tunggal menjadi bentuk dupleks oleh pemasangan basa komplemen dari sample rantai tunggal lain. hybridoma cell, sel hibridoma sebuah sel, dihasilkan dari proses fusi antara sel penghasil antibody dengan sel tumor, yang akan memproduksi antibody tunggal dan memiliki kapasitas proliferasi tidak terbatas. hydratase, hidratase Sebuah enzim yang dapat menambah elemen - elemen air menjadi ikatan dua karbon-karbon. hydrogen bond, ikatan hidrogen Sebuah ikatan yang terbentuk ketika dua atom elektronegatif, seperti oksigen atau nitrogen, membagi tidak sama besar kepada atom hydrogen yang kovalen dengan satu atom elektronegatif. hydrolytic reactions, reaksi hidrolisis Reaksi yang terjadi ketika ikatan kimia tertentu terlepas akibat adanya proses adisi air. hydropathy plot, plot hidropati Sebuah arti dari penentuan urutan transmembran di dalam protein melalui pengukuran perubahan energi bebas, untuk menggerakkan sebuah segmen yang terdiri dari 20 asam amino suatu protein, dari lingkungan hidrofob menuju air. hydrophobic interactions, interaksi hidrofob menunjukkan suatu tendensitas molekul nonpolar di dalam air untuk berinteraksi dengan satu yang lain; interaksi ini dikendalikan oleh peningkatan entropi air, di saat molekul air kontak dengan molekul nonpolar, air dilepaskan ke dalam kumpulan molekul besar. 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reductase (HMG-CoA reductase), 3-hidroksi-3-



metilglutaril CoA reduktase Sebuah enzim peregulasi tertinggi, yang dapat mengatalisis tahapan sistesis kolesterol; formasi mevalonat dari 3-hidroksi-3-metilglutaril CoA. Hal 33 (10605035, Wulan Sary) hyperammonemia Suatu kondisi tingginya kadar ammonia dalam darah akibat siklus urea yang menurun, yang dapat mengakibatkan kerusakan pada otak dan kematian. hyperchromism Kenaikan tingkat penyerapan cahaya disebabkan oleh pasangan basa yang tidak bertumpuk saat rantai ganda DNA melebur menjadi rantai tunggal. hypersensitive sites Daerah pada kromosom yang sensitive pada pencernaan oleh exogenous DNAses; daerah yang biasanya berlokasi pada ujung ‘5 gen yang aktif ditranskripsi. hyperuricemia Kadar blood urate yang berlebihan; hyperuricemia dapat menyebabkan penyakit encok. hypervariable loop Pada cahaya immunoglobulin dan rantai berat, segmen polipeptid yang memiliki variasi urutan yang bagus dan bertanggungjawab pada kekhususan antigenic. hypervariable segment Pada cahaya immunoglobulin dan rantai berat, segmen polipeptid yang memiliki variasi urutan yang bagus dan bertanggungjawab pada kekhususan antigenic. hypocromism Penurunan dalam koefisien penyerapan saat rantai tunggal DNA menjadi bentuk rantai ganda. hypoxanthine Basa purin yang bereaksi dengan 5-phosphoribosyl-1-pyrophosphate (PRPP) menjadi bentuk inosinate; reaksi merupakan bagian dari jalan penyelamatan purin. I I-cell disease Penyimpanan penyakit lisosomal yang lepas dari lisosom dalam proses hidrolase tertentu karena kerusakan pada sintesis sinyal target lisosomal. IDLs (intermediate-density lipoproteins) Partikel lipoprotein yang tersisa banyak dari triacylglycerides yang berasal dari proses hidrolisis dan penyerapan VLDL oleh jaringan lain; dapat diserap oleh hati atau diubah kedalam LDL immunoglobulin Lihat antibody immunoglobulin A (IgA) Kelas utama antibody dalam sekresi eksternal seperti saliva, air mata, lendir pada cabang tenggorokan dan lender pada usus. immunoglobulin D (IgD) Suatu antibody yang belum diketahui fungsinya. immunoglobulin E (IgE) Suatu antibody ssbagai proteksi untuk melawan parasit; IgE juga memulai proses reaksi suatu alergi.



immunoglobulin fold Struktur umum immunoglobulin dimana dua lembaran luas dari untaian ß antiparalel mengelilingi bagian rantai yang hidroponik dan secara komplementer mendeterminasi bagian pasangan domain variable untuk membentuk daerah yang berikatan pada anti gen. Hal 34 (10605036, Irma Hediyanti) immunoglobulin G ( IgG) Antibodi utama di (dalam) serum; IgG [memiliki/mempengaruhi] dua sisi pengikatan antigen. immunoglobulin M (IgM) Kelas antibodi utama yang muncul dalam serum setelah pembukaan suatu antigen; IgM [memiliki/mempengaruhi] sepuluh sisi pengikatan antigen. Daerah intraselular dari Ig-α dan Ig-β membran protein B sel yang belum dewasa; ketika antigen mengikat membrane loncatan dari sel B, wilayah ITAM Ig-α and Ig-β telah difosforilasi dimana inisiasi mendorong ke arah pertumbuhan sel dan diferensiasi sel B. immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM)



hibridisasi in situ suatu teknik di mana sel dihentikan dan DNA didenaturasikan kemudian dihibridisasi menjadi pemeriksa RNA radioaktif; selanjutnya hibrida ini dapat dideteksi oleh autoradiografi. in situ hybridization,



Induced fit Modifikasi bentuk dari suatu lokasi aktif di (dalam) suatu enzim setelah substrat terikat. Inducer Suatu molekul kecil yang mengikat pada suatu represor dan mengubah interaksinya dengan suatu operator. Inhibitor 1 Suatu protein yang, ketika di fosforilasi, menghalangi aktivitas protein phosphatase 1 dan dengan demikian mendukung penguraian glikogen dan menghalangi sintesis glikogen. inisiasi Hal pertama dari tiga langkah umum untuk semua polymerisasi reaksi biologi; langkah ini menetapkan kondisi-kondisi untuk permulaan proses polymerisasi. initiation,



kompleks inisiasi Suatu dari RNA polymerase, unsur-unsur penyelenggara, dan faktor transkripsi spesifik yang mengizinkan inisiasi RNA sintese. initiation complex,



faktor inisiasi Salah satu dari satu set protein yang membantu asosiasi ribosome, mRNA, dan inisiator tRNA untuk memulai proses sintesis protein. initiation factor,



Inosinate Suatu purine nucleotida yang dibentuk oleh reaksi hypoxanthine dengan 5phosphoribosyl-1- pyrophosphate ( PRPP); sebuah precursor untuk AMP dan GMP. Inositol 1,4,5-trisphosphate pembawa kedua dari aliran phosphoinositid yang menyebabkan peningkatan level Kalsium intraseluler. insersi suatu jenis mutasi di mana satu atau lebih pasangan basa yang tidak sesuai tersisip ke dalam DNA. insertion,



Hal 35 (10605037, Melliza Wulansari)



insertion sequence, urutan insersi DNA transposon sederhana, disusun dari urutan kilobasa yang menspesifikasi transposase dan dibatasi ujung lain oleh pengulangan terminal yang berlawanan; urutan insersi dapat menyisipkan dirinya sendiri ke setiap sisi pada kromosom bakteri. insertional inactivation, inaktivasi insersi inaktivasi gen yang berlangsung ketika fragmen DNA yang tidak berkerabat disisipkan pada sisi restriksi; inaktivasi gen untuk resistensi antibiotik pada plasmid dapat digunakan untuk mendeteksi letak pada plasmid tersebut yang telah disisipkan oleh fragmen DNA. Insulin Hormon polipeptida yang disekresikan oleh sel-sel pancreas, yang menstimulasi penyimpanan gula darah dan sintesis protein. integral membrane proteins, protein integral membran Protein terdapat pada membran yang berinteraksi secara luas dengan rantai hidrokarbon pada lipid membran dan biasanya membentangkan membran. intercalating agents, agen interkalasi datar, bahan aromatik yang dapat disisipkan di antara pasangan basa yang berdekatan pada DNA rantai ganda; agen ini, seperti etidium bromide, dapat menyebabkan insersi dan delesi. intermediate filaments, filament intermediet Filamen-filamen yang disusun dari komponen sitoskeleton sel epitel yang kira-kira berdiameter 7-10 nm; keratin merupakan filament intermediet. intrinsic clotting pathway, jalur penggumpalan intrinsik Penggumpalan aliran darah pada aktivitas enzim diinisiasi oleh aktivasi faktor XII selama kontak dengan protein aktivasi (kininigen dan kalikrein) dengan permukaan sel yang abnormal disebabkan oleh luka; setidaknya enam protein telah teraktivasi pada jalur pembentukan thrombin dan melanjutkan urutan guna pembekuan darah. intrinsic factor, faktor intrinsik Glikoprotein disekresikan ke usus untuk mengikat vitamin B12 dan membantu absorpsi sampai ke epitel usus halus. Introns Bagian transkripsi utama yang dihapus pada mRNA yang matang. Disebut juga urutan intervening. Inversion, inverse Urutan nukleotida dimana keadaan normal dibalikkan di dalam gen atau kromosom. inverted region, bagian yang mengalami inversi Ditujukan untuk laju optimal pada transfer elektron sebagai fungsi dari energi bebas pada gaya yang diarahkan; laju transfer elektron meningkat terhadap bagian yang mengalami inversi seperti energy bebas pada gaya yang diarahkan meningkat, namun kemudian menurun dengan dilanjutkan oleh meningkatnya gaya tersebut. inverted terminal repeats, pengulangan terminal yang mengalami invers Urutan 2 atau lebih pasang basa di ujung yang berlawanan pada urutan insersi bakteri. ion channels, saluran ion Sistem transpor pasif untuk ion pada laju transport yang sangat tinggi; saluran ion sering menampilkan derajat yang tinggi pada spesifikasi untuk ion transport. Ion-exchange chromatography, kromatografi penukar-ion Teknik pemurnian protein berdasarkan muatan protein. Protein diterapkan sebagai matriks inert tempat



menempelnya kedua bagian yang bermuatan (misalnya gugus karboksil). Protein akan berikatan pada matriks yang daya tarik yang seimbang untuk isi dari konterion (misalnya muatan positif yang dimiliki matriks karboksil). Hal 36 (10605038, Putri Astriani) IRE (iron-response amount) Sebuah protein besi yang sensitif yang dapat meregulasi kemampuan menerjemahkan dari ferritin mRNA dan kestabilan transferrin penerima mRNA dengan berikatan kepada struktur putaran batang disebut juga elemen respon besi yang terdapat pada molekul mRNA. iron-response element (IRE), elemen respon besi Struktur putaran batang ditemukan di dalam mRNA untuk ferritin dan penerima transferrin yang berinteraksi dengan ikatan protein-IRE dan meregulasi penerjemahan dari mRNA. iron-sulfur proteins, protein besi-sulfur Protein yang terdiri dari sekelompok besi dan sulfur yang memegang peranan dalam reaksi transfer electron; siklus besi diantara Fe2+ and Fe3+. Disebut juga nonheme protein besi. irreversible inhibitor, inhibitor yang tak dapat balik Sebuah inhibitor yang mengikat dengan sangat kuat kepada enzim targetnya, baik kovalen maupun nonkovalen; seperti inhibitor yang berasosiasi dengan sangat lambat terhadap enzim. isocitrate dehydrogenase Enzim yang mengkatalisis isositrat oksidatif dekarboksilat menjadi bentuk α-ketoglutarate; berperan dalam mengontrol kecepatan dari siklus citric acid. isocitrate lyase Enzim dari siklus glyoxylate, isositrat lyase memecah isositrat ke dalam succinate and glyoxylate isoelectric focusing, pemusat isoelektrik Suatu teknik untuk memisahkan protein. Campuran protein menjalani elektroforesis di dalam gradient pH; setiap protein akan bermigrasi di dalam medium elektrik sampai mencapai nilai isoeletrik. isoelectric point (pI) pH protein yang mana harga netnya sama dengan nol. Isomerase Sebuah enzim yang mengkatalisis antarkonversi dari bentuk isomer dari suatu senyawa. isomerization reaction,



reaksi isomerasi Suatu reaksi yang atom-atom dalam



molekulnya disusun. Isopentenyl pyrophosphate Isoprena aktif: bangunan dasar dari kolesterol. 3-isopentyl pyrophosphate Pertanda dari kolesterol sebaik beberapa macam biomolekul lainnya seperti vitamin K, koenzim Q, dan karotenoid, Isopentyl pyrophosphate didapat dari mevalonate. isopropylthiogalactoside (IPTG) Penyebab dari lac operon; IPTG mengikat penahan lac dan mengurangi afinitas penahan untuk DNA operator, yang mempersilakan transkripsi untuk mengambil tempat. Hal 37 (10605039, Utami Kusuma D.) (10605093, Kusnata 37-55)



Isozim Enzim yang terdapat pada organisme yang mengkatalis reaksi yang sama tapi berbeda dalam struktur; perbedaan ini mungkin berasal dari satu atau beberapa residu asam amino. Juga disebut isoenzim J joule Sejumlah energi yang dibutuhkan untuk menggunakan kekuatan 1 newton untuk menenpuh 1 meter; satu kilojoule (Kj) sama dengan 1000 joule atau 0.239 kcal. K asam amino ketogenik Asam amino yang berasal dari tulang karbon, seluruhnya atau sebagian , mendegradasi asetil CoA atau asetoasetil CoA, hanya leusin dan lisin yang soleli ketogenik ketogenic amino acids,



α-ketoglutarate dehydrogenase merupakan enzim siklik asam sitrat yang mengkatalis dekarboksilasi oksodatif dari α -ketoglutarat menjadi sunsinil CoA; enzim ini membantu meregulasi siklus asam sitrat rata-rata, secar sturktural dan mekanisme hampir sama dengan kompleks dehidrogenase piruvat. badan keton kebalikan dari asetosetat, β-hidroxibutirat, dan aseton, diproduksi ketika asetil CoA dibedakan dari asam sitrat siklis menjadi formasi asetil CoA pada hati; reaksi subsekuen terdiri dari tiga molekul, yang diketahui sebagai badan keton. ketone body,



ketose monosakarida yang memiliki gugus keton biasanya sebagai mengoksidasi karbon. kilobase Unit dari panjang basa setara dengan 1000 pasang basa yang terdiri dari double-stranded molekul asam amino atau 1000 basa untuk molekul single-stranded. kilocalorie



(kcal), kilocalori Suatu unit energi yang setara dengan 1000 kalori, atau



4.184 joule. kinase Merupakan enzim yang mengkatalis grup posforil menjadi substrat yang digunakan sebagai donor posforil pada ATPkinesin A protein with ATPase activity that moves cellular organelles along microtubule tracks in anterograde transport. Klenow fragments Sebagai pencerna produk proteolitik dari DNA polimerase I yang menahan polimerase dan aktivitas 3' ke 5' eksonuklease. Krebs cycle, siklus Krebs lihat siklus asam sitrat. L lac operon Operon yang mengkode gen menjadi metabolisme laktosa. lac repressor protein regulator yang mengikat bagian dari lac operon yang dengan demikian menghambat ekspresi struktural gen dari operon; Inhibisi ini dibebaskan ketika protein represor mengikat allolaktosa, merupakan induser dari lac operon hal 38 (10605040, Agung Kusumanto) lactic acid fermentation, fermentasi asam laktat Metabolisme anaerobic dari glukosa untuk menghasilkan asam laktat yang bersamaan dengan produksi ATP. Lagging strand Sebuah helaian DNA yang baru tersintesis pada percabangan replikasi yang menandakan sintesis fragmen-fragmen Okazaki. Lihat juga leading strand.



lateral diffusion, difusi lateral Kemampuan molekul-molekul lipid dan protein untuk berpindah secara lateral pada membran secara spontan dan berkesinambungan. Leading strand Sebuah helaian DNA yag baru tersintesis pada percabangan replikasi yang tersintesis secara terusmenerus. Lihat juga lagging strand. Leber's hereditary optic neuropathy, kelainan hereditas optik Leber Sebuah bentuk warisan kebutaan maternal dalam rangka mutasi pada reduktase NADH-Q; salah satu dari penyakit mitokondria. Lectins protein nabati dengan affinitas tinggi untuk residu gula-gula spesifik; pada umumnya merupakan pengenal-pengenal penting pada molekul-molekul yang mengandung karbohidrat Leghemoglobin Sebuah hemoglobin homolog yang ditemukan pada tanaman polongpolongan yang juga merupakan tempat simbiosis bakteri nitrogen-fixing; leghemoglobin mengikat oksigen, yang kemudian melindungi enzim nitrogenase dari inaktivasi. Leptin Sebuah hormon polipeptida, dikeluarkan oleh sel-sel pengsintesis dan penghasil lemak dalam proporsinya secara langsung pada jumlah lemak yang menggenerasi sinyalsinyal satiasi. Lesch-Nyhan syndrome, sindrom Lesch-Nyhan Sebuah penyakit yang dihasilkan dari hilangnya sebuah enzim dalam alur pengaman untuk purin-purin; terdeteksi dengan keterbelakangan mental, rasa permusuhan ekstrim, mutilai diri. Lever arm, lengan pengungkit sebuah helix penjang yang mengungkit fragmen S1 myosin untuk mengikat rantai ringan; memperbesar perubahan-perubahan kecil structural pada situs ikatan nukleotida dari myosin untuk mencapai perpindahan 110-Å sepanjang filamen aktin. Ligand sebuah molekul kecil yang mengikat pada sebentuk protein, termasuk perubahan struktur spesial. Contohnya, steroid adalah ligand untuk reseptor hormon steroid. Ligand-gated channel sebuah saluran membran penghantar yang terbuka melalui pengikatan satu atau lebih molekul-molekul pada domain pengikat ligand dari protein saluran. reaksi ligasi Reaksi yang membentuk ikatan-ikatan dengan menggunakan energi dari hidrolisis ATP. ligation reactions,



Light (L) chain, rantai ringan L Sebuah polipeptida 25-kd yang merupakan salah satu dari dua tipe rantai yang ditemukan dalam immunoglobulin G. Setiap L chain mengandung sebuah region variable dan region konstan. Light-harvesting complex, kompleks pengumpul cahaya Sebuah kompleks pigmenpigmen penyerap cahaya yang secara utuh melingkupi pusat reaksi fotosintesis; mengumpulkan energi cahaya yang terserap menuju pusat reaksi Hal 39 (10605042, Mahendra Primajati) light meromyosin (LMM). Bersama dengan meromiosin besar, satu dari produk pencernaan triptik yang berasal dari myosin; membentuk filament tetapi tidak memiliki enzim ATPase atau aktifitas pelekatan aktin.



light reactions, reaksi terang Terjadi di kloroplas, merupakan reaksi yang memerlukan cahaya untuk menciptakan potensial reduksi dan memproduksi oksigen. linking number, angka penghubung Merupakan perangkat DNA sirkuler, yang sama dengan jumlah helai DNA yang mengelilingi helix axis. lipid bilayer. Suatu lapisan biomolekul yang terbentuk dari molekul amfipatik yang terdiri dari sisi hidrofobik yang terletak di bagian dalam lapisan dan sisi hidrofilik yang merupakan bagian yang suka air. lipoic acid (6, 8-dithiooctanoic acid). Merupakan kelompok asil yang berfungsi sebagai kofaktor enzim dihidrogenase; dihubungkan secara kovalen ke residu lisin yang spesifik dalam protein enzim, ia juga berfungsi sebagai pembuka dan penutup ikatan, melalui pengubahan siklus katalisis. Lipolysis, lipolisis merupakan enzim hidrolisis dari triasilgliserol menjadi asam lemak bebas dan gliserol. lipoprotein particles, partikel lipoprotein Partikel yang memiliki inti lipida hidrofob dan dikelilingi oleh lapisan asam lemak yang polar dan protein spesifik, yang memiliki peranan dalam transport kolesterol dan triacylglycerol. liposomes. Vesikula lemak yang memiliki daerah terlarut yang ditutupi oleh lapisan lemak ganda bilayer. long terminal repeat. Rangkaian yang diulang pada kedua sisi ujung dari DNA retroviral. Lovastatin. sebuah inhibitor kompetitif dari HMG-CoA reductase, kunci pengaturan enzim didalam biosintesis kolesterol; digunaka secara terapi untuk menurunkan tingkat kolesterol. Juga disebut mevinolin. low-density lipoprotein (LDL). Pembawa utama kolesterol dalam darah; terdiri dari sebuah inti dari molekul kolesterol yang diesterifikasi dikelilingi oleh sebuah lapisan dari fosfolipid, kolesterol yang tidak di esterifikasi, dan apoprotein B-100; sumber utama dari kolesterol untuk sel lainnya daripada hati atau usus. lysogenic bacteriophage. Virus pemakan bakteri yang memiliki DNA yang bersatu kedalam sel inang oleh rekombinasi tempat spesifik dan memiliki sifat ditunjukkan. lysogenic bacterium. Sel bakteri yang memiliki kromosom yang mengandung prophage. lytic bacteriophage. Phage yang bereplikasi ke dalam inangnya kemudian mengalami lisis atau inangnya hancur. Hal 40 (10605043, Nailulkamal Djamas) magnetosomes Rangkaian partikel intraseluler berukuran kecil yang mengandung medan magnet magnetite (Fe3O4) dan terdapat pada beberapa bakteria untuk mendeteksi medan magnet bumi. main chain Pengulangan bagian secara berurutan pada struktur primer polipeptida; setiap unit terdiri atas suatu rantai yang meliputi atom α-karbon seperti halnya kelompok CO dan NH pada residu asam amino.



main olfactory epithelium Daerah spesifik pada hidung yang mengandung hampir sejuta sensor saraf dan berfungsi untuk mendeteksi bau. major groove Suatu lekukan pada B-DNA yang memiliki lebar sebesar 12 Å dan memiliki kedalaman sebesar 8,5 Å yang dihasilkan dari kenyataan bahwa ikatan glikosida pada pasangan basa tidak terbagi secara diametris satu dengan yang lain. major histocompatibility complex (MHC) Membran protein integral yang berikatan dan terletak pada permukaan peptida suatu sel dan merupakan hasil turunan pencernaan protein dari sitosol (protein MHC kelas I) atau dari bagian endosomal (protein MHC kelas II). Peptida asing yang berikatan dengan protein MHC kelas I menandakan penghancuran pada protein oleh penghancur berupa T-sel sedangkan peptida asing yang berikatan dengan protein MHC kelas II akan menghasilkan sinyal bagi T-sel pembantu yang dapat menstimulasi produksi B-limfosit. malate-aspartate shuttle Rangkaian reversibel yang terdapat pada hati dan jantung dan digunakan untuk mengangkut elektron dari NADH pada sitoplasma ke NAD+ pada mitokondria. malate synthase suatu enzim pada siklus glikolisis yang mengkatalisasi terbentuknya oksaloasetat dari glikolisis dan Asetil KoA. manganese center Sisi pada generasi oksigen di dalam proses fotosintesis tumbuhan hijau. Pusat tersebut adalah suatu kompleks yang mengandung empat ion mangan, yang mendonorkan elektron pada P680 bermuatan positif. Setelah mendonorkan empat elektron, pusat mangan mengoksidasi dua molekul air untuk melepaskan elektronelektron dan membentuk suatu molekul tunggal yang terdiri dari oksigen molekular dan empat proton. maple syrup disease Suatu penyakit yang dihasilkan dari ketidakmampuan untuk mengoksidasi cabang rantai asam amino dan ditandai dengan penurunan kondisi mental dan fisik serta urin yang berbau seperti sirup maple. matrix-assisted laser desorption-ionization time of flight spectrometry (MALDITOF) Suatu teknik yang digunakan untuk mendeterminasi suatu massa protein. Sampel protein terdapat di dalam matrix dan terionisasi oleh aplikasi suatu sinar laser. Medan listrik memindahkan ion-ion melewati saluran yang mengambang menuju sebuah detektor. Ion terkecil akan tiba terlebih dahulu di detektor. maximal velocity Tingkat tertinggi pada reaksi katalisasi enzim di mana konsentrasi enzim dan substrat yang dicampurkan bersifat konstan. McArdle disease Suatu penyakit yang disebabkan oleh kekurangan fosforilasi oksigen pada otot; glikogen terdapat pada jumlah yang meningkat namun memiliki struktur yang sama; ciri-ciri klinis meliputi ketidakmampuan untuk melakukan olahraga yang bersifat berat. Hal 41 (10605044, Winda Agustiani) megasynthases Kelas besar, enzim multifungsi, termasuk asam lemak sintase, yang berperan dalam jalur sintetik ‘step-by-step’ melting temperature Suhu dimana struktur molekul biologi kedua atau yang lebih tinggi



hilang; untuk asam nukleat, suhu leleh didefinisikan sebagai suhu dimana setengah dari struktur helix hilang membrane asymmetry Ditujukan pada fakta bahwa dua fasa penting membran berpisah satu sama lain secara biologis. membranes Struktur seperti kain tersusun atas lipida dan protein, umumnya hanya sedikit molekul tebal, yang membentuk batasan tertutup diantara kompartemen yang berbeda; membran memisahkan lingkungan berair. messenger RNA (mRNA) Template untuk sintesis protein; urutan basa mRNA saling melengkapi gen yang terdapat di DNA. metabolism Penyatuan besar jaringan pada jalur kimiawi yang memungkinkan sebuah sel mengekstraksi ebergi dari lingkungan dan menggunakan energi tersebut untuk keperluan biosintesis. metabolon Nama untuk multienzim kompleks yang besar yang memfasilitasi saluran substrat diantara sisi aktif. metabotrophic glutamate receptor Sebuah reseptor 7TM yang mengikat neurotransmitter glutamat; sebuah versi kerucut yang bagian atasnya terpotong dari protein yang sama yang mendeteksi rasa, masa umami glutamat. metal ion catalysis Katalisis dimana logam berperan sebagai katalis elektrofilik dengan menstabilkan serangan negatif pada reaksi intermediet, menghasilkan sebuah nukleofili dengan meningkatkan keasaman molekul disekitarnya, atau meningkatkan pengikatan energi inetraksi enzim-substrat dengan cara berikatan dengan substrat. methotrexate Sebuah inhibitor kompetitif dari dihidrofolat reduktase, sebuah enzim yang dibutuhkan dalam regenerasi koenzim tetrahidrofolat, yang sangat penting dalam sintesis thymidylate; methotrexate digunakan sebagai agen pengobatan kemoterapi. Disebut juga amethopterin. mevalonate Sutu pelopor dalam sintesis kolesterol; formasinya dengan HMG-CoA reduktase membentuk langkah dalam biosintesis kolesterol. micelle Suatu struktur globular dibentuk oleh molekul amphipathic dimana bagian hidrofilik terdedah ke dalam air dan bagian hidrofobik terpisah di dalam, jauh dari air. β2-microglobulin (Suatu immunoglobulin yang tersusun atas subunit protein MHC manusi kelas I; 12-kd polipeptida ini berikatan nonkovalen terhadap rantai 44-kd.) Michaelis constant Konsentrasi substrat dimana setengah sisi aktif dari enzim terpenuhi; sebuah perbandingan tingkat konstan untuk reaksi model. E+S⇋ES→E+P k1k2 k-1 Konstanta didefinisikan sebagai KM = k-1+ k2/k1. Di bawah kondisi dimana k-1 is lebih besar daripada k2, KM sama dengan konstanta disosiasi kompleks enzim-substrat dan merupakan sebuah pengukuran afinitas enzim terhadap substrat. Hal 42 (10605045, Hanifah)



persamaan Michaelis-Menten Suatu persamaan yang menunjukkan kecepatan (V) dari reaksi yang menggunakan katalis-enzim dalam bentuk kecepatan maksimum (V, maks), konsentrasi substrat (s), dan ketetapan MichaelisMenten (KM). Persamaan tersebut digunakan terhadap kinetic hiperbolik dengan V sebagai fungsi dari s; persamaannya yaitu V = Vmaks [s]/ ([s] + KM). Michaelis-Menten equation,



mikrofilamen filamen-filamen aktin, berdiameter sekitar 7 nm, filamen tersebut (F-aktin) dibentuk oleh polimerisasi monomer-monomer G-aktin, komponen dari sitoskeleton. microfilaments,



mikrosom vesikula tertutup yang dibentuk dari penempelan fragmenfragmen oleh subsekuen RE. microsomes,



mikrotubula suatu elemen sitoskelet yang merupakan komponen utama dari silia, flagela eukariot, dan spindel mitosis; dibentuk dari α dan β-tubulin. microtubule,



pusat pengaturan-mikrotubula ,tempattempat pembentukan dari pertumbuhan mikrotubula. microtubule-organizing centers (MTOCs),



mineralkortikoid suatu kelas hormon steroid, disintesis oleh korteks adrenal dan dieksemplifikasi oleh aldosteron, yang bekerja di ginjal untuk meningkatkan absorpsi Na+ dan ekskresi K+ dan H+. mineralcorticoids,



lekukan minor lebar 6 Å, lekukan dalam 7.5 Å pada B-DNA yang muncul karena adanya ikatan glikosida dari pasangan basa yang tidak berlawanan diametrik. minor groove,



penyakit-penyakit mitokondria suatu set penyakit yang merupakan akibat adanya mutasi pada mitokondria DNA; seringkali muncul pada jaringan-jaringan yang bergantung pada fosforilasi oksidatif, seperti pada jantung dan sistem saraf. mitochondrial diseases,



mitokondria organel berbentuk oval, memiliki panjang sekitar 2 Mm, diameter 0.5 Mm, merupakan tempat berlangsungnya fosforilasi oksidatif, enzim-enzim pada siklus asam sitrat, dan merupakan enzim-enzim pada oksidasi asam lemak. mitochondrion,



mimikri molekular, berasal dari domain protein, seperti yang ditemukan di EF-G, dan faktor pelepas yang menyerupai struktur molekul tRNA. molecular mimicry,



antibodi monoklonal suatu antibodi yang diderivat dari klonsejumlah sel yang diturunkan dari sel yang sama dan identik. Normalnya antigen-antigen dengan spesifitas umum bersifat heterogen karena dihasilkan oleh beragam grup sel. Penggabungan dari satu sel penghasil antigen dengan sel myeloma immortal memfasilitasi produksi sejumlah besar dari antibodi protein yang homogen. Antibodiantibodi ini merupakan analisis berharga dan reagen-reagen yang dapat dipersiapkan dengan mudah. monoclonal antibody,



Hal 43 (10605049, Adeline Magdalena) monooxygenases, cytochrome P450 Enzime yang menggunakan O2 dan menggabungkan satu atom oksigen ke dalam substrat dan mereduksi satu atom yang lain kedalam air; penting dalam sintesis hormon steroid dan tyrosine, juga untuk detoksifikasi dari campuran xenobiotic.



monosaccharides Single aldehid atau ketone yang mempunyai 2 atau lebih gugus hidroksi; karbohidrat paling sederhana. mosaic protein protein yang diproduksi oleh gen dipertemukan dengan pengocokan exon; exon memproduksi unit struktur dari suatu protein. MotA and MotB sepasang protein bakteri yang membentuk cincin disekitar basa pada flagellum dan, berhubungan dengan FliG, membentuk channel proton yang menentukan rotasi dari flagellum tersebut. multidrug resistance suatu fenomena yang diamati pada sel kanker dimana ketika sel kanker tahan terhadap satu obat membuatnya tahan terhadap obat yang lain; dikarenakan aktivitas dari pompa ATP yang disebut dengan “the multidrug-resistance protein (MDR)”, yang mengandung daerah ABC. multienzyme complex suatu rantai polipeptida yang memiliki wilayah untuk dua atau lebih aktivitas enzim. multifunctional enzymes enzim yang secara fungsi berhubungan yang secara kovalen berhubungan dengan suatu cara. mutagen Suatu gangguan pada untai basa pada DNA dan menyebabkan mutasi; biasanya disebabkan oleh bahan kimia tapi jug bisa disebabkan karena sumber energi seperti sinar ultraviolet. mutarotation untuk karbohidrat, perubahan didalam dari anomer α dan β melalui terbukanya struktur cincin; biasanya diukur melalui perubahan pada optikal rotasi. mutase suatu enzim yang mengkatalis pergantian shift molekul didalam suatu grup kimia. mutations variasi yang merubah pengertian dari suatu materi genetic; dibutuhkan untuk evolusi. myofibrils Fibril di dalam sitosol dari otot tulang belakang yang memberikan sel bentuk; unit fungsional dari suatu miofibril adalah sarcomere. myoglobin protei tempat menyimpan oksigen di otot pada hewan vertebrateA; mempunyai stuktur yang sama dengan hemoglobin subunit. myosin protein yang membentuk filamen yang tebal dari suatu otot; memperlihatkan akifitas ATPase pada bagian kepala yang bulat, dengan, konjungsi dengan kemampuan reversibel untuk berikatan dengan aktin pada bagian fibernya, menyediakan tenaga untuk kntraksi otot. N N-acetylglutamate suatu carbamoyl phosphate synthetase allosteric activator dari mamalia, yang mengkatalis sintesis urea. Hal 44 (10605053, Raja Yulita I. S.) NAD-binding domain, domain Pengikat NAD Motif struktural dari NAD+ terhubung dengan dehidrogenase yang membentuk sisi pengikatan pada NAD+ dan mengandung 4 heliks dan 6 rantai pararel β



NAD+ and NADH (nicotinamide adenine dinucleotide) Suatu pembawa elektron yang penting dalam pembakaran molekul; elektron dibawa oleh bagian dari nicotinamide pada koenzim NADH-Q oxidoreductase Komponen besar dari rantai pernapasan yang mentransfer elektron dari NADH ke ubiquinone yang dalam proses pompa proton melewati membran dalam mitokondria menghasilkan tenaga bermotif proton. Juga disebut NADH dehidrogenase atau complex I. NADP+ and NADPH (nicotinamide adenine dinucleotide phosphate) merupakan elektron donor untuk biosintesis reduktif; berbeda dengan NAD+ dan NADH dalam hal fosfat yang menempel di posisi 3 pada ribosa adenin native form, bentuk dasar konformasi fungsional yang stabil dari makromolekul biologis. neck linker, penghubung leher Bagian pendek dari kinesin yang berikatan dengan kepala domain dari Kinesin ketika ATP berikatan dan dilepaskan ketika sisi pengikatan nukleotida kosong atau diisi ADP. negative selection, seleksi negatif Proses seleksi dari perkembangan sel T dimana sel T yang berikatan dengan kompleks MHC berafinitas tinggi pada sel pemunculan antigen mengalami apoptosis pada peptidanya. nerve impulse, Impuls saraf Peningkatan potensial membran dan perubahan konduktansi ion sodium dan potassium yang diakibatkan oleh perubahan permeabilitas membran axon terhadap ion-ion tersebut. Juga disebut potensial aksi. neurotransmitter Suatu molekul kecil yang mampu berdifusi, seperti asetilkolin, yang menjadi media bagi impuls saraf untuk melewati sinaps. nicotinate Vitamin yang merupakan komponen kunci dari koenzim NAD+, NADH, NADP+, dan NADPH untuk transfer elektron. Juga disebut niacine. nitrogen fixation, fiksasi nitrogen Konversi nitrogen diatomik menjadi amonia; langkah pertama dari aliran nitrogen menjadi asam amino, nukleotida, dan komponen-komponen lain yang mengandung nitrogen pada organisme. nitrogenase complex, kompleks nitrogenase Komplek enzim yang mengkatalis reduksi nitrogen diatomik menjadi amonia; ditemukan pada bekteri dan alga hijau-biru. nociceptor Suatu neuron terspesialisasi yang mentransmisi sinyal untuk pusat pemrosesan rasa sakit pada sumsum tulang belakang dan otak sebagai respon dari adanya awal /permulaan kerusakan jaringan. nonclaret disjunctional (ncd), pemisahan non claret Salah satu anggota dari famili protein kinesin yang, berbeda dengan kebanyakan anggota famili lainnya, bergerak menuju ujung mikrotubulus yang bermuatan negatif. Hal 45 (10605054, Tera Dria Kispa) inhibitor non kompetitif penurunan nilai aktivasi enzim ketika sebuah enzim berikatan dengan substrat dan inhibitor secara bersamaan.Inhibitor nonkompetitif menurunkan banyaknya enzim tetapi tidak menurunkan kemampuan noncompetitive inhibition,



molekul enzim untuk berikatan dengan substrat; akibatnya konsentrasi substrat meningkat. asam amino nonesensial asam amino yang dapat disintesis oleh organisme yang tidak memerlukan starat-syarat nonessential amino acids,



sebuah gula yang tidak mudah dirubah menjadi komposisi gugus aldehid bebas, seperti konversi pencegahan karena gula dibentuk dari gliserin yang berikatan dengan gugus lainnya. nonreducing sugar



peptida nonribosom sebuah kelas peptida, yang termasuk antibiotik penisilin, dibentuk oleh reaksi megasintesis khusus nonribosomal peptides,



Northern blotting analog dengan Southern blotting, sebuah teknik yang mencampur fragmen RNA yang dipisahkan dengan elektroforesis, memindahkan lembaran nitoselulosa, memindahkan DNA yang bersifat radioaktif untuk melengkapi urutan, dan divisualkan dengan autoradiografi; teknik yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi lokasi fragmen RNA yang diurutkan dengan urutan khusus aturan N-terminal tempat setengah hidup dari protein sitosol alami adalah N-terminal asam amino N-terminal rule,



membran inti sebuah membran ganda,terdiri dari membran dalam inti dan membran luar inti, menyelubungi inti dengan lubang yang disebut lubang inti nuclear envelope,



inti reseptor hormon sebuah anggota dari kelompok besar faktor trankripsi, ikatan sebuah molekul sinyal seperti hormon steroid, merubah ekspresi gen spesifik dengan ikatan untuk mengontrol element dalam DNA nuclear hormone receptor,



urutan daerah inti penambahan urutan amino secara langsung pada protein seperti sebuah urutan dalam inti. nuclear localization sequence,



resonansi magnetik inti sebuah cara menentukan struktur protein dalan solusi berbasis kemampuan atom dalam protein untuk menyerap radiasi elektromagnetik nuclear magnetic resonance,



nuclear Overhauser enhancement spectroscopy (NOESY) Sebuah teknik yang dibentuk berbasis analisis NMR pada struktur protein; NOESY gambaran pasangan proton dalam pendekatan tertutup didalam protein seri jika mereka tidak tertutup bersama dalam struktur primer; struktur tiga dimensi yang dapat ditentukan dati observasi. kumpulan protein kompleks yang memberikan jalan di membran nti dan membiarkan molekul besar singgah didalam dan diluar inti. nuclear pores



Hal 46 (10605055, Nisa’a Avionimia N. N.) nuclear receptor superfamily Kelas dari factor transkripsi yang mengikat DNA dan mengaktivasi transkripsi hanya jika terdapat molekul sinyal yang spesifik, misalnya hormone. nucleoside Satu basa purin atau pirimidin yang berikatan dengan satu gula. nucleosomes Unit kromatin yang berulang yang terdiri dari 200 pasang basa dari DNA dan dua dari masing-masing histon, H2A, H2B, H3, dan H4. nucleotide Satu basa purin atau pirimidin yang berikatan dengan satu gula, juga berikatan dengan satu atau lebih



grup fosfat.A nitrogenous purine or pyrimidine base linked to a sugar, which is in turn linked to one or more phosphate groups. nucleotide-excision repair Sebuah cara untuk memperbaiki DNA, dimana satu rangkaian DNA pada area yang rusak dipindahkan dan diganti. nucleotide kinases Enzim yang mentransfer grup fosforil dari satu nukleotida ke nukleotida yang lain, seperti pada reaksi dari ATP dengan UMP untuk membentuk UDP dan ADP. O obligate anaerobes Organisme yang tidak dapat bertahan jika terdapat oksigen dalam lingkungannya. Hidupnya biasanya tergantung pada proses fermentasi sebagai sumber dari energi selular. odorants Molekul kecil pada udara yang berikatan dengan reseptor pada epithelium olfaktori yang membangkitkan persepsi penciuman. Okazaki fragments Rantai pendek dari DNA (diperkirakan sekitar 1000 nukleotida) yang terbentuk dari lagging strand pada percabangan replikasi dari sintesis DNA yang kemudian akan tersambung;memungkinkan polimerasi dengan arah 5’ ke 3’ pada level nukleotida, sementara pertumbuhan secara keseluruhan dari arah 3’ ke 5’. olfaction Kemampuan penciuman. oligomycin Antibiotik yang menghambat sintesis ATP (dengan konsekuensi juga menghambat rantai respirasi) dengan cara menginterferensi dengan mengalirkan proton ke komplek ATP sintase. oligosaccharides Karbohidrat yang terbentuk dari 2 sampai 12 unit monosakarida. oncogene Gen yang ekspresinya berkontribusi pada perkembangan sel kanker. one-carbon metabolism Reaksi biokimia dimana senyawa utrunan tetrahidrofolat bertindak sebagi donor satu dari variasi unit satu karbon, mulai dari level oksidasi grup metil sampai grup formil;termasuk juga reaksi yang melibatkan unit karbon yang teroksidasi penuh, karbon dioksida, dan kariernya, biotin. operator Segmen DNA yang berdampingan dengan sebuah grup dari strukturak DNA dan merupakan urutan target dari protein represor; sebuah unit regulasi dan ekspresi gen yang terdiri dari strukturak gen dan elemen regulator yang dikenal oleh satu atau lebih produk gen terregulasi. Hal 47 (10605057, Novita Yustinadiar) operon model model gene regulasi dari prokariot yang mengandung untai opertor dan berhubungan dengan struktur genenya. opsin suatu reseptor 7TM dari sel kerucut, pada saat berikatan dengan 11-cis-retinal membentuk rhodopsin, menyerap cahaya yang terlihat untuk menginisiasi jalur proses pensinyalan. optical rotation pergantian arah polarisasi dari suatu cahaya linier dalam melewati larutan optis aktif; bisa digunkan sebagai indicator konformasi rantai utama dari protein.



optical trap suatu cara untuk mengukur gaya yang ditimbulkan oleh satu molekul myosin pada filamen aktin. Pada alat ini, laser difokuskan pada sebuah manik - manik, yang terikat pada aktin filamen. Bead terjebak ditengah - tengah. Kekuatan dari laser untuk memegang beam bisa dirubah - rubah dengan merubah intensitasnya. Tenaga yang dikeluarkan molekul myosin pada akti filamen kemudian diukur sebagai kekuatan yang dibutuhkan untuk menahan bead tetap pagda jebakan optik. organic fluorophosphates tersusun atas diisopropylfluorophosphate, dimana neghambat acetylcholinesterase untuk membentuk kompleks enzim phosphoryl yang stabil pada serine residu di sisi aktif nya. orotidylate bahan dasar nukleotida untuk uridylate dan cytidylate dibentuk oleh reaksi dari orotate dengan 5- phosphoribosyl-1-pyrophosphate (PRPP). orthologs molekul homolog, yang timbuk didalam spesies yang berbeda dan mempunyai kemiripan ataupun kesamaan fungsi. osmosis pergerakan dari pelarut melewati membran dalam arah untuk menyamakan konsentrasi dari dua larutan di sisi membran. osteomalacia keadaan diman tulang menjadi rapuh dan lemah akibat kekurangan viamin D, terjadi pad orang dewas. overlap peptides peptida yang dihasilkan dari degradsi protein dengan 2 cara untai subsequently ; untai dari hasil degradasi yang pertama diproses sering dan mnulsul proses dari untai dua atau lebih, hal ini akan membuat stabil unatai yang lain. β-oxidation oksidasi dari C-3 carbon atom adalah β sampai dengan gugus fungsi; ipada degradasi dari molekul fatty acyl CoA, untai yang dioksidasi dan dihidrsi, dan direaksi oksidasi yang merubah methylene pada C-3 menjadi β-keto group. oxidation-reduction reaction Raksi yang mengadakan transfer electron. oxidative phosphorylation proses dimana ATP dibentuk hasil dari transfer electron dari NADH atau FADH2 menjadi O2 oleh beberapa seri pembawa electron . oxyanion hole suatu wilayah dari enzim proteolytic khusus yang menstabilkan oxyanion dan secara bersamaan terbentuk reaksi tetrahedral intermediet. Hal 48 (10605058, Leo M. Taufik) oxygen-dissociation curve Kurva oksigen yang berikatan dengan protein terhadap tekanan parsial oksigen. P P680 Pasangan molekul spesial pada fotosistem II pada tumbuhan hijau; Penyerapan cahaya yang dilakukan oleh P680 akan menghasilkan transfer elektron dari air menuju plastoquinone,dimana plastoquinone menghasilkan perbedaan kosentrasi proton. P700 Pasangan molekul spesial pada fotosistem I pada tumbuhan hijau; Penyerapan cahaya yang dilakukan oleh P700 akan menghasilkan transfer elektron yang berguna untuk menghasilkan ferredoxin dan terutama NADPH. P960 Dimer molekul klorofil-b dari bakteri, disebut juga pasangan spesial, menyerap



cahaya maksimum pada 960 nm. Menginisiasi fotosintesis bakteri. packing ratio derajat kondensasi DNA di dalam kromatin; rasio atau perbandingan panjang dari DNA linier. Packing ratio dari metafase manusia kromosom adalah 104. Palindrome Kata,kalimat,atau pun frase yang dibaca dari kiri ke kanan ataupun dari kanan ke kiri. Sebagai contohnya adalah “radar”,dengan sambungan pada biokimia,bagian dari DNA rantai ganda dibaca sama ketika setiap rantai dibaca dalam arah yang sama; ini merupakan tampilan secara 2 arah rotasional seperti contohnya 3'CCTAGG-5'/5'-GGATCC-3'. Pantothenate Vitamin utama penyusun koenzim A. Paralogs molekul homolog yang ada pada suatu spesies; biasanya mempunyai detail yang berbeda dalam fungsi Biokimia. passive transport Transport ion atau molekul yang searah gradien konsentrasi; tidak memerlukan energi. Dimana G untuk melakukan transportasi antar spesies bernilai negative. Biasa disebut difusi terfasilitasi. Pasteur effect inhibisi dari glikolisis melalui respirasi,diteliti oleh Louis Pasteur; batas ambang dari glikolisis lebih rendah daripada jumlah oksigen dan saat pada keadaan anaerob,inhibisi ini terjadi bersamaan yaitu dengan inhibisi dari phosphofructokinase yang dilakukan oleh ATP dan Sitrat. patch-clamp technique metode yang digunakan dalam mempelajari chanel ion dimana mempunyai resistensi yang tinggi yang terbentuk antara pipet dan tanda kecil pada plasma membrane,mengikuti pengamatan pergerakan dari ion selama melewati chanel single dengan resolusi waktu yang tinggi. pellagra penyakit yang diakibatkan oleh kekurangan dietary dari tryptophan dan nicotinate cirri cirri penyakit imi; dermatitis, diarrhea, and dementia. pentoses monosakarida yang mempunyai 5 atom karbon. hal 49 (10605060, Eka Hilda Utami L.) jalur fosfat pentosa Jalur metabolic yang menghasilkan NADPH dan 5 karbon gula seperti ribose 5-fosfat dari glukosa 6-fosfat; meliputi reaksi oksidasi yang memproduksi NADPH dan ribose 5- fosfat sama seperti reaksi nonoksidasi yang bersama-sama mengubah 5-karbon gula fosfat menjadi precursor glukoneogenik dari glukosa 6-fosfat. Juga dikenal sebagai pelangsir monoposfat heksosat atau jalur fosfoglukonat pentose phosphate pathway,



peptide,



peptida. Dua atau lebih asam amino yang digabungkan oleh ikatan peptida



ikatan peptida. Suatu pertalian kovalen yang terjadi antara gugus akarboksil pada suatu kelompok asam amino dan gugus a-amino kelompok lainnya.juga diketahui suatu ikatan amida peptide bond,



peptidoglikan. Suatu makromolekul yang terdiri dari polisakarida lurus yang dihubungkan oleh peptide pendek; seringkali ditemukan pada dinding sel bakteri, peptidoglikan memberi dukungan mekanik danmelindungi dinding bakteri dari gangguan peptidoglycan,



dengan tekanan osmotik. Pusat peptidil transferase. Suatu daerah ribosomal subunit yang besar yang mengkatalisasi formasi ikatan peptida antara aminoasil (atau peptidil) tRNA pada lokasi P dan aminoasil tRNA pada lokasi A. Perforin. Protein yang disekresikan dengan diaktifkannya sel T yang menyebabkan sel target dapat meyerap dengan pembentukan 10 nm pori-pori pada membrane sel target; pori-pori ini membiarkan masuknya granzymes membran protein peripheral. Protein yang dihubungkan dengan permukaan membran oleh elektrostatis dan interkasi ikatan hydrogen peripheral membrane protein,



Suatu penyakit dimana penyerapan vitamin B12 terhalangi, yang disebabkan oleh suatu kekurangan factor intrinsik, yang menyebabkan ketidakmampuan untuk mensintesis timin dan purin pernicious anemia



peroksidase Enzim heme yang mengkatalisis reduksi dari suatu alkil peroksida untuk menghasilkan alcohol dan air peroxidases,



peroksisom Organel yang terikat pada membran sederhana yang banyak ditemukan pada kebanyakan eukariotik dan berperan dalam detoksifikasi, sintesis plamalogen dan garam empedu, dan β-oksidasi dari rantai asam lemak yang panjang. peroxisomes,



penilketonuria Penyakit yang disebabkan oleh ketidakmampuan untuk mengubah fenilalanin menjadi tirosin, dimana dihasilkan kelebihan fenilalanin dan metabolit sekundernya; penyakit ini ditunjukan oleh adanya ketelambatan mental phenylketonuria,



phorbol esters Polisiklik alcohol yang berasal dari minyak kroton yang menyerupai diasilgliserol dan secara tidak sesuai menstimulasi protein kinase C; phorbol ester adalah promotor tumor fosfatase Enzim yang mengkatalis pelepasan gugus fosforil dari subtrat dengan hidrolisis phosphatase,



Fosfatidat (diasilgliserol 3-fosfat) precursor awal ke triasilgliserol sama seperti kebanyakan fosfolipid phosphatidate (diacylglycerol 3-phosphate),



Hal 50 (10605061, Adrito Pranandria) fosfodiesterase Sebuah enzim yang mengubah nukleotida siklik (contoh: cAMP) menjadi bentuk nonsiklik (contoh: AMP). phosphodiesterase,



fosfofruktokinase Sebuah kinase yang memfosforilasi fruktosa 6-fosfat menjadi fruktosa 1,6-bifosfat ; fosfofruktokinase, sebuah enzim allosterik, adalah poin kontrol utama (major) untuk fluks melalui jalur glikoliktik. phosphofructokinase,



aliran Fosfoinositida Sebuah rangkaian reaksi yang mengubah sebuah sinyal ekstraselular menjadi sinyal intraselular ; perubahan yang melibatkan lipatan dari fosfolipid fosfatidil inositol 4,5-bifosfat menjadi pembawa 2/2, inositol 1,4,5-trifosfat dan diasilgliserol. phosphoinositide cascade,



fosfolipase Sebuah kelas enzim dengan spesifitas bervariasi yang mengkatalisis degradasi fosfolipid ; dapat berfungsi sebagai enzim pencernaan juga sebagai komponen dari jalur transduksi sinyal. phospholipases,



fosfolipid Merupakan bagian pembangun penting dari membran dan terdiri dari tiga komponen: sebuah tulang belakang / “backbone” (biasanya gliserol atau sfingosin), dua rantai asam lemak, dan sebuah alkohol terfosforilasi. phospholipids,



fosforolisis Pelipatan sebuah ikatan oleh ortofosfat, yang terjadi dalam degradasi glikogen menjadi glukosa 1-fosfat. phosphorolysis,



potensial transfer fosforil Sebuah ukuran kemungkinan dari sebuah senyawa terfosforilasi untuk mentransfer sebuah fosfat menjadi senyawa lain ; dilambangkan sebagai .G° dari hidrolisis senyawa fosfat ; semakin negatif nilai .G° dari hidrolisis, maka potensial transfer fosforil semakin besar. phosphoryl transfer potential,



potensial fosforilasi Sebuah cara mengukur status energi dari sebuah sel yang didapat dengan membagi konsentrasi ATP dengan konsentrasi ADP dan Pi produk. phosphorylation potential,



pemisahan muatan secara fotoinduksi Eksitasi sebuah elektron dari kondisi dasar menjadi tingkat energi yang lebih tinggi oleh absorpsi cahaya dan pergerakan susulan elektron tereksitasi dari molekul awal menjadi sebuah akseptor, dihasilkan sebuah arus positif pada molekul awal dan sebuah arus negatif pada molekul akseptor. photoinduced charge separation,



fotoreseptor Protein membran yang dapat mengubah cahaya menjadi gerakan atomik dan kemudian menjadi sebuah sinyal kimia. photoreceptors,



fotorespirasi Pengubahan karbon organik menjadi karbon dioksida tanpa produksi dari metabolit kaya energi ; hasil dari reaksi oksigenasi dikatalisis oleh rubisko dan regenerasi susulan glukosa dari dua molekul glikolat, dengan membebaskan karbon dioksida dan amonia, serta konsumsi ATP. photorespiration,



Unit Fotosintetik Sebuah kompleks pemanen cahaya, termasuk sekitar 2500 molekul klorofil antena dan sebuah pasangan pusat reaksi klorofil, semuanya terdapat pada membran tilakoid. photosynthetic unit,



Hal 51 (106050062, Primanto Ali Murtadji) photosystem I Di dalam kloroplas, unit fotosintesis yang didalamnya termasuk kompleks menyerap cahaya, pusat reaksi dan rantai transport elektron. sistem mengkatalisis transfer elektron yang menggunakan energi cahaya dari reduksi plastoquinone menjadi ferredoxin, yang mengakibatkan pembentukan NADPH; memerlukan cahaya dengan panjang gelombang kurang dari 700 nm. photosystem II Di dalam kloroplas, unit fotosintesis yang didalamnya termasuk kompleks menyerap cahaya, pusat reaksi dan rantai transport elektron. sistem mengkatalisis transfer elektron yang menggunakan energi cahaya dari air menjadi plastoquinone, secara bersamaan dengan pembentukan oksigen; memerlukan cahaya dengan panjang gelombang kurang dari 680 nm.



phototrophs organisme yang dapat memenuhi kebutuhan energinya dengan cara mengubah energi cahaya menjadi energi kimia. phycobilisome suatu susunan besar dari phycobiliproteins, yang mengandung senyawa bilin yang dapat menyerap energi cahaya, yang mengambil cahaya untuk organisme, seperti ganggang merah, dan cyanobacteria, hidup di kedalaman satu meter atau lebih di dalam air laut. plasmalogens fosfolipid yang mengandung α,β-unsaturated ether di posisi C-1 dari gliserol; banyak terdapat di fosfolipid dari sistem saraf. plasmids molekul DNA berbentuk sirkular dupleks yang mereplikasi dirinya secara autonom dan berfungsi sebagai kromosom aksesori di bakteri; mereka membawa gengen penting tapi tapi dalam keadaan tertentu tidak terpakai. P-loop suatu komponen, karakteristik dari protein pengikat nukleotida, dari domain pengikat NTP yang berinteraksi dengan gugus fosforil di nukleotida yang terikat. poly(A) tail suatu segmen panjang poliadenilat (kurang lebih sebanyak 250 nucleotida) yang ditambahkan setelah transkripsi pada ujung 3' pada hampir semua mRNA eukaryotic. polycistronic message merujuk pada molekul mRNA yang mengkode lebih dari satu protein. polyclonal antibodies antibodi yang merupakan produk dari banyak populasi yang berbeda dari sel penghasil antibodi. polyketides kelas dari suatu senyawa, yang termasuk didalamnya antibiotik erythromycin, dibentuk oleh mekanisme tertentu dari megasynthases yang spesifik. polymerase enzim yang mengkatalisasi langkah demi langkah penambahan dari unit ribo- atau deoksiribonukleotida kepada rantai polinukleotida. polymerase chain reaction metode untuk memperbanyak urutan DNA dengan menggunakan enzim DNA polimerase; seri dari tiga tahap, dimana strand DNA parental dipisahkan melalui pemanasan, primer dipasangkan kepada urutan DNA target dan lalu primer dipanjangkan dengan sintesis DNA. Hal 52 (10605063, Aulia S. Wiryoatmojo) polypeptide Rangkaian dari asam amino, masing-masing terhubung dengan rangkaian selanjutnya oleh ikatan peptide. polysaccharides Karbohidrat tersusun dari banyak unit monosakarida; homopolisakarida tersusun dari satu jenis gula dalam jumlah yang banyak, sedangkan heteropolisakarida terdiri dari lebih dari satu jenis gula. polysome Kelompok dari ribosom yang berikatan dengan molekul mRNA dan secara simultan membawa translasi. Disebut juga poliribosom. Pompe disease Penyakit yang merusak semua jaringan dan menyebabkan kekurangan lisosom-glikogen-enzim pendegradasi; struktur glikogen normal namun ada dalam jumlah yang sangat banyak dan tidak normal; kematian terjadi dengan jangka waktu yang pendek dikarenakan kegagalan jantung.



porin Transmembran protein yang membentukchannel pada bagian luar membrane mitokondria, memungkinkan perjalanan molekul-molekul kecil dan ion-ion menuju ke dalam membrane. porphyrias Keadaan yang tidak teratur dari metabolisme yang disebabkan kekurangan enzim pada jalur biosintesis untuk heme; sering dikarakterisasi dengan akumulasi satu atau lebih jalur tengah dalam darah atau jaringan lainnya, begitu pula dengan ekskresi pada urin. positive selection Proses penyeleksi di dalam perkembangan sel T dimana sel T yang dapat berikatan dengan molekul-molekul MHC bertahan,sedangkan yang tidak bias bertahan mengalami apoptosis. power stroke Perubahan konformasi pada kepala myosin yang disebabkan oleh pelepasan fosfat dan myosin berikatan dengan aktin sehingga menarik aktin filament, selanjtnya terjadi perubahan penempatan dari kepala myosin. pregnenolone Steroid yang dibentuk oleh penghilangan 6 rantai karbon dari kolesterol; hormone steroid disintesis dari pregnenolone. pre-mRNA pemutusan, produk dari RNA polymerase II pada eukariot. Pribnow box komponen promoter dari gen prokariot yang telah menyetujui sequence 5’TATAAA-3’ terletak 10 pasang basa pada awal transkripsi. primary messenger Informasi yang mewujudkan interaksi antara ligan dengan reseptor molekulnya. primary structure Biasanya mengarahkan sequence linear asam amino di protein; lebih umunya, sequence linear yang membentuk polimer. primase RNA polymerase terspesialisasi yang mensintesis RNA primer untuk sintesis DNA. primer Pada pemanjangan polimer, segmen awal dari polimer diperpanjang; pemanjangan bergantung pada primer. Hal 53 (10605064, Carolyn Endiana) primosome, primosom suatu kompleks protein yang memfasilitasi pemutusan rantai DNA dan mensintesis RNA primer yang akan memulai sintesis DNA. processivity, prosesivitas merupakan bagian dari enzim yang memiliki kemampuan untuk mengkatalisasi suatu proses pemanjangan atau pemutusan polimer secara berulang kali meskipun polimer tersebut tetap berikatan dengan enzim. proenzyme, proenzim merupakan suatu zimogen, atau prekursor katalitis inaktif dari suatu enzim; proenzim dapat dikonversi menjadi bentuk yang aktif dengan cara menghidrolisis satu atau lebih ikatan peptida. progestagen sejenis hormon steroid, misalnya progesteron, yang mempersiapkan uterus untuk implantasi ovum, disintesis oleh korpus luteum (atau badan kuning) pada ovarium. programmed cell death, kematian sel terprogram diatur oleh enzim proteolitik yang dapat mengakibatkan kematian sel terprogram sebagai respons dari kerusakan sel yang



serius atau suatu perkembangan spesifik lainnya. Disebut pula dengan apoptosis. promoter sites, daerah promotor urutan DNA spesifik, biasanya pada urutan awal DNA yang menspesifikasi daerah tersebut dan sebagian dari transkripsi DNA yang bersangkutan propeller twisting pilinan pasangan basa pada kristal DNA berbentuk ko planar; memperbanyak penumpukan basa dalam suatu untaian DNA. Hal 54 (10605065, Monita Krisna P.) protein kinase A suatu protein kinase yang terdiri dari 2 katalis subunit dan dua subunit regulasi yang menghambat subunit katalis; dalam pengikatan dari cAMP, regulatory subunit berpisah dari katalis subunit, yang kemudian menjadi aktif. protein kinase C protein kinase yang menjadi aktif ketika terikat pada diacylglycerol. protein kinases suatu kelas enzyme yang mentransfer gugus phosphoryl dari ATP ke proteins; protein kinases sering ditemukan di jalur regulatory. protein phosphatase 1 suatu protein fosfat yang distimulus oleh insulin yang menghambat degradasi glikogen dan menstimulus sintesis glikogen. protein phosphatase 2A suatu fosfatase yang responsif terhadap insulin yang mengaktifkan acetyl CoA carboxylase untuk menstimulus sintesis asam lemak. protein phosphatases Enzime yang menghidrolisis phosphorylated serine dan threonine residu pada protein lain; protein phosphatase 1 membalikan efek regulatory dari kinases pada metabolisme glikogen. proteoglycans Protein yang mengandung satu atu lebih ikatan kovalen dengan rantai glycosaminoglycan; cartilage proteoglycan mengndung keratan sulfate dan chondroitin yang berhubungan dengan tulang punggung polypeptide. proteome representasi fungsional dari genom yang didalamnya termasuk tipe, fungsi dan interaksi dari protein yang ada di dalam sel; proteome bukan karakteristik yang tepat bagi sel tapi akan bervariasi, Tergantung faktor seperti tingkatan pertumbuhan atau status hormonal. proton gradient distribusi yang tidak merata dari proton sepanjang lapisan membran impermeable terhadap proton; gradien tersebut bisa digunakan untuk memberikan bahan bakar pada proses biokimia, seperti sintesis ATP. proton-motive force energi yang diwariskan dalam bentuk gradien proton menstabilkan selama rantai respiratory digunakan; terdiri dari membran potensial dan juga gradien kimia. proto-oncogene sinyal transduksi protein yang biasanya meregulasi sel untuk tumbuh dalam berbagai cara; ketika proto-oncogenes bermutasi, mereka menjadi oncogenes dan berkontribusi untuk pertumbuhan sel kanker. protoporphyrin suatu susunan organic dari gugus prosthetik dari heme; terdiri dari 4 cincin pirol digabungkan dengan jembatan methylene dan mengandung banyak variasi rantai samping.



pseudogenes urutan DNA yang merepresentasikan gene asli tapi tidak mengkode produk yang fungsional. pseudosubstrate urutan asam amino yang merepresentasikan substrat sebenarnya untuk suatu enzim kecuali pada bagian asam amino yang penting telah diubah, mengubahnya menjadi inhibitor; pengikatan dari pseudosubstrates yang teregulasi seringkali digunakan untuk mengontrol aktivitas enzim. Hal 55 (10605066, Qoriatur R.) P-type ATPases. Jenis kelompok enzim yang menggunakan energi dalam proses hidrolisis untuk memindahkan ion-ion melintasi membran: disebut "P-type ATPases" karena mekanisme reaksinya termasuk kedalam jenis phosphoaspartate intermediate. pulsed-field electrophoresis. Merupakan teknik elektroforesis untuk memisahkan molekul-molekul DNA. Medan elektrik/listriknya, sekitar 200 degree antara satu molekul dengan molekul lainnya, digunakan pada sebuah mode pengganti. Molekul yang panjang diorientasikan kembali secara lebih lambat daripada molekul yang pendek dan oleh karena itu tidak dapat mengikuti medan listrik dengan cepat. Pump Sebuah jalur protein pada sebuah membran yang dapat menghantarkan molekul dari kompartemen(bagian) yang satu ke kompartemen yang lain dengan arah yang berlawanan dengan gradien konsentrasi; pompa melalui siklus penyesuian bentuk yang mengubah afinitas (daya tarik) pada tempat pengikatan untuk mentransportasikan molekul, dan “eversion” molekul selama dalam siklus, dikemudikan/ditentukan oleh pengeluaran energi bebas. Disebut juga transport aktif. pur repressor. Sebuah protein regulator pada pur operon, yang mengkode gen yang berperan dalam biosintesis purin; pur operon berikatan dengan operator DNA hanya ketika berikatan dengan molekul kecil (guanin atau hiposantin) yang disebut dengan corepressor. Purine. Sebuah basa nitrogen yang mengandung sebuah cincin pirimidin yang berfusi dengan lima cincin imidazole; turunan purin, adenin dan guanin nukletida dan asam nukleat. Puromycin . Merupakan antibiotik, sebuah analog pada terminal aminoacyl-adenosine bagian dari aminoacyltRNA; pada proses translasi, hal ini menyebabkan rantai akhir menjadi prematur ketika kelompok amino berikatan dengan kelompok karboksil pada pembentukan rantai polipeptida dan mengakibatkan pemisahan dari kompleks ribosom. Pyranose. Cincin yang terdiri dari enam nomor heterosiklik yang dibentuk ketika prose perubahan monosakarida menjadi hemiasetal atau hemiketal; keenam nomor tersebut, kandungan oksigennya menyerupai pyran. pyridine nucleotides. Nukleotida, sama seperti NAD+, NADH, NADP+, and NADPH, yang bekerja pada reaksi reduksi; fungsional groupnya adalah nikotinamida, turunan dari piridin. pyridoxal phosphate. Kelompok prosthetic, turunan dari vitamin B6 (pyridoxine) yang memegan peranan utama pada reaksi transmisi. Pyrimidine. Basa nitrogen yaitu enam nomor cincin heterosiklik yang mengandung dua



atom nitrogen dan empat karbon atom; turunan pirimidin terdiri dari sitosin, urasil, dan timin yang terdapat pada nukleotida dan asam nukleat. pyrimidine dimers. Merujuk pada mutasi yang memiliki cahaya ultraviolet yang menyebabkan hubungan kovalen pada dua residu pirimidin. Pyrrole. Lima nomor cincin heterosiklik diene yang terdiri dari heteroatom yaitu nitrogen. Pyruvate. Komponen penting dalam metabolisme; sebuah prekursor untuk alanin dan glukosa dan dapat diubah menjadi laktat pada glikolisis an aerobik; dapat juga dioksidasi menjadi acetyl CoA, yang dapat dioksidasi lebih besar menjadi sejumlah energi aerobic, diubah menjadi lemak, atau digunakan untuk mensintesis kolesterol dan steroid lainnya. Hal 56 (10605067, Vicka Kharisma) (10605052, Adrial R. 55-74) Piruvat karboksilase sebuah biotin - enzim bebas yang dapat mengkatalisis formasi oksaloasetat dari piruvat dan CO2 yang membutuhkan ATP; berperan penting dalam proses glukoneogenesis dan penambahan dalam siklus asam sitrat Kompleks piruvat karboksilase sebuah kompleks enzim mitokondria yang besar, yang dapat mengkatalisis dekarboksilase oksidasi dari piruvat menjadi asetil CoA ; reaksi ini termasuk reaksi irreversible yang menghubungkan antara reaksi glikolisis dan siklus asam sitrat Q



siklus Q sebuah rangkaian reaksi yang melibatkan koenzim siklus Q dalam tahap mereduksi penuh dan tahap oksidasi penuh melalui reaksi 1 elektron transfer yang disimpan sementara di sitokrom b ; menghasilkan pesan untuk menyampaikan 2 elektron dari koenzim Q menjadi electron tunggal yang membawa sitokrom c, yang mengandung 1 elektron Q cycle,



Q-sitokrom c oksidoreduktase Sebuah komponen dari rantai respirasi, oksidoreduktase ini membawa electron dari koenzim Q menuju sitokrom c, dalam prosesnya proton dipompakan keluar dari matriks mitokondria untuk meningkatkan daya bentuk proton, sering disebut juga sitokrom reduktase atau kompleks III struktur kuartener Di dalam protein terdiri lebih dari satu rantai polipeptida, susunan tempat untuk rantai tersebut (subunit) dan kontak lebih lanjut diantaranya quaternary structure,



plot ramachandran Sebuah bentuk diagram sterik yang menggambarkan jarak yang memungkinkan dari sudut Ö dan Ø untuk sisa asam amino dalam rantai polipeptida; untuk setiap residu atau sisa tersebut merupakan sebuah konformasi dari rantai utamadari rantai polipeptida yang dapat dijelaskan secara rinci oleh Ö ( derajat rotasi dari ikatan antara atom nitrogen dengan atom α-karbon) dan Ø (derajat rotasi dari ikatan antara atom α-karbon dengan atom karbon karbonil). Ramachandran plot,



konformasi coil acak Struktur yang tidak melipat dari mokromolekul yang terdenaturasi; banyak protein yang tidak terhubungkan secara menyilang kehilangan struktur 3 dimensinya, dalam fungsi biologisnya kehadiran agen random-coil conformation,



yang tidak melipat ini contohnya seperti urea pusat reaksi Dalam unit fotosintesis, molekul klorofil terspesialisasi yang mengumpulkan energi eksitasi dari molekul klorofil lainnya dan menjadi perantara transformasi energi cahaya menjadi energi kimia. reaction center,



pembacaan susunan Kumpulan dari nukleotida yang tidak tumpangtindih yang dibaca sebagai kodon selama proses sintesis protein; pembacaan susunan dimulai dari inisiasi kodon AUG reading frame,



Hal 57 (10605069, Anne Sofia Meirina) Receptor-mediated endocytosis Artinya protein spesifik yang penting pada sel karena ikatannya pada receptor membran plasma dan subseguent dan kehadiran gelembung. Receptor tyrosine kinases Receptor protein transmembrane yang tepat berbatasan dengan molekul sinyal, berperan dengn aktivitas kinase protein intracellular, Protein Fosforilasi pada sisa-sisa tirosine Recombinant DNA technology teknik yang digunakan untuk menganalisis dan memanipulasi DNA, Metode ini termasuk modifikasi spesifik pada gen yang menghasilkan gen yang baru, klonign gen dan ekspresi gen yang baru yang telah dimodifikasi untuk menghasilkan protein. Recombinase Enzim yang mengkatalisis pertukaran material genetik pada saat dua DNA melakukan rekombinasi Recombination Formasi dari perubahan gen atau sequence gen oleh pergerakan dari DNA Recombination synapse langkah pertama pada proses recombinasi dimana 4 molekul dari rekombinasi dan DNA molekul yang bersama-sama. Reducing sugars Gula yang berikatan dengan grup bebas aldehide yang beroksidasi dan bisa mengecilkan material lain Reductase enzim yang mengkatalisis dari grup fingsional reduksi. Seringkali menggunakan NADPH sebagai donor , tipe oxidoreduktase. Reduktif biosinthesis merujuk kepada jalur anabolic, yang membutuhkan donor ion hidrida ntuk mereduksi atom karbon di dalam metabolk intermediet; NADPH berfungsisebagai donor electron di dalam banyak jalur, termasuk di dalam biosintesis palmitoyl KoA regulatory proteins Protein regulatori protein yang terikat pada enzim dan mengatur aktivitas katalitiknya. relaxed DNA DNA rileks molekul DNA sirkular yang tidak memiliki bentuk putaran superhelikal. relay helix A Heliks relay Heliks panjang yang menghubungkan area pengaktif dari fragmen S1 menjadi lever arm; bentuk alami dari nukleotida di Fragmen (ATP atau ADP) sehingga heliks relay tersebut bisa berpindah posisi, yang menghasilkan reorientasi dari lever arm.



release factor Factor pembebas satu dari set dari protein yang mengenali stop kodon di dalam mRNA di daerah A dari ribossom, yang menyebabkan pelepasan dari protein yang telah lengkap dari tRNA di daerah P dari ribosom. repair Perbaikan rrestorasi dari struktur dan urutan normal dari gen setelah terjadi kerusakan oleh sinar ultrabviolet atau bahan kimia. replication fork Tempat dari sintesis DNA dimana strand parental dipisahkan dan strand anak yang komplementer terhadap tiap orangtua disintesis hal 58 (10605070, Ardha Apriyanto) (106050 replicon Suatu segmen DNA yang membawa replikasi asal-usul dan dapat meniru secara “autonomous”; plasmid bakteri merupakan replicon. repressor Sebuah protein yang mengikat urutan operator dan menghalangi transkripsi gen-gen structural di operon. resistance transfer factor Sebuah urutan DNA yang memperkenankan sebuah plasmid membawa gen-gen untuk perlawanan obat untuk ditransfer ke bakteri lain dengan konjugasi. resonance structures Pola ikatan kovalen alternatif untuk sebuah molekul yang mungkin sama atau hamper sama. respiration Suatu proses menghasilkan ATP dimana suatu campuran anorganik, seperti O2, berperan sebagai penerima electron terakhir; donor electron dapat berupa campuran organik maupun anorganik. respiratory chain Jalur perjalanan electron-elektron dari NADH atau FADH2 menjadi O2; terdiri atas tiga komplek yang memompa proton sebagai sebuah hasil transpor electron dua electron pembawa yang bergerak. Disebut juga rantai transpor elektron. respiratory control Rangkaian atau koordinasi erat dari oksidasi kofaktor tereduksi (NADH dan FADH2 pada rantai transpor electron dan fosforilasi ADP menjadi ATP di mitokondria; seperti kontrol yang memastikan bahwa nilai siklus asam sitrat, dimana kofaktor tereduksi dihasilkan, cocok dengan permintaan ATP. restriction enzymes Enzim endonuklease yang mengenali urutan basa spesifik pada DNA untai ganda dan memotong kedua untai rangkap pada tempat yang spesifik. restriction-fragment-length polymorphism (RFLP) Keanekaragaman genetik dalam suatu populasi diindikasikan dengan mutasi pada tempat yang spesifik dalam DNA; seperti mutasi mengubah posisi perbatasan fragmen-fragmen pada analisi elektroforesis gel. restriction-modification system Sebuah sistem yang pada setiap enzim restriksi yang dibuat oleh suatu sel prokariot, juga dibuat metilase yang menandai DNA inang dan mencegah degradasinya. retinal Group prostetik dari rhodopsin yang menyerap cahaya dan mengalami isomerisasi dari 11-cis-retinal menjadi all-trans-retinal, memulai jalur transduksi sinyal visual. retrograde transport Transpor di dalam sitoplasma yang digerakkan oleh dynein yang menggerakkan organel dari perifer ke tengah sel.



retrovirus Suatu virus yang mengandung sebuah genom RNA tetapi yang bereplikasi melalui pertengahan untai ganda DNA yang disatukan dengan genom sel inang. reverse transcriptase Sebuah enzim yang mensintesis DNA dengan menggunakan template RNA. Hal 59 (10605071, Shinta Asarina) rho protein ATP-tergantung pada enzim helicase bakteri yang merusak hibrida/ campuran dari RNA-DNA pada gelembung transkripsi, dan karena itu mengakhiri transkripsi. rhodopsin Photoreceptor pada sel batang. Terbuat dari protein opsin dan gugus prosthetic 11-cis-retinal. rhodopsin kinase Enzim yang memphosphorilasi rhodopsin yang diaktivasi pada bermacam-macam residu serine dan threonine untuk menyediakan tempat berikatan untuk protein inhibitor arrestin. riboflavin Komponen vitamin dari coenzyme electron-transfer FAD, FADH2, FMN, dan FMNH2. Disebut juga vitamin B2. ribonucleoproteins Kompleks makromolekul yang aktivitas optimalnya tergantung pada ada tidaknya RNAs spesifik dan protein; ribosom adalah ribonucleoprotein. ribonucleotide Nukleotida yang mengandung basa purin atau pirimidin yang secara kovalen berikatan dengan ribose, yang kemudian berikatan pada satu atau lebih gugus phosphate. ribonucleotide reductase Enzyme yang mengkatalisis proses reduksi dari keempat ribonucleotida menjadi deoxyribonucleotida. ribose Monosakarida yang memiliki 5 karbon (C5H10O5) yang menyusun moiety karbohidrat dari ATP, ribonucleosida dan ribonucleotida yang lain, dan cofactor seperti NAD dan coenzim A. ribosomal RNA Komponen RNA pada ribosom, tempat sintesis protein. ribosome Kumpulan banyak ribonucleoprotein yang mengkatalisis pembentukan ikatan peptide: mesin molecular yang mengkoordinasi sintesis protein. ribozymes Molekul RNA yang menunjukan aktivitas enzimatik. rickets Penyakit yang disebabkan oleh kurangnya pembentukan vitamin D, yang menyebabkan kurangnya pembentukan kalsium pada kartilago dan tulang. Rieske center Pusat 2Fe-2S yang tidak biasa karena salah satu ion Fe nya tersusun dari dua residu histidin, bukan dari dua residu sisteina. rifamycin Antibiotic yang diisolasi dari streptomyces yang menghalangi inisiasi sintesis RNA dengan cara memblok pembentukan ikatan pertama phosphodiester. RNA editing Perubahan dalam informasi yang terdiri dari RNA oleh proses selain pembelahan/ penguraian RNA yanr terjadi setelah transkripsi. RNA enzymes Molekul RNA yang berperan sebagai enzim. Disebut juga ribozymes.



RNA polymerases Salah satu enzim yang mensintesis molekul RNA yang melengkapi DNA template. Hal 60 (10605072, Inggita Utami) RNA primers, RNA primer Bagian kecil dari RNAyang didasari oleh sepasang rantai template DNA dan bekerja seperti primer dari sintesis DNA primer tunggal; RNA yang digeser sebelumnya dan menggantinya dengan DNA. RNA processing, RNA pengolah Beberapa perubahan dari RNA molekul terdahulu; seperti penyambungan atau poliadenilasi, dan hasilnya adalah molekul RNA dewasa. RNA world, RNA dunia Teori evolusi dimasa kini dimana molekul RNA menjalankan kedua hal yaitu sebagai materi genetik dan sebagai katalis untuk reaksi biokimia. rod Fotoreseptor sel tipis dimana berfungsi pada pencahayaan yang redup tetapi tidak berwarna. rotenone, rotenone Racun pada tumbuhan yang menghambat transfer elektron pada NADH-Q enzim pereduksi yang kompleks, digunakan pada ikan dan racun serangga. rubisco (ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase), ribulosa 1,5-bisfosfat karboksilase/oksigenase Enzim yang mengkatalis reaksi karbon dioksida dengan ribulosa 1,5-bisfosfat terhadap dua molekul 3-Fosfogliserat. S S1 fragments, S1 fragmen Proteolitik hasil pencernaan dari miosin sebagai pembangkit tenaga unit dari molekul miosin utuh; S1 fragmen mengandung ATPase dan bagian aktin yang mengikat. SI heads Proteolitik hasil pencernaan dari miosin sebagai pembangkit tenaga unit dari molekul miosin utuh; mengandung ATPase dan bagian aktin yang mengikat; SI kepala lebih kecil dari pada meromiosin berat S-adenosylmethionine Pengaktif donor metil yang tersusun dari kelompok adenosil yang menghubungkan atom sulfur dengan methionin salting out, Penggaraman Teknik pemurnian protein berdasarkan daya larut oleh berbagai protein yang rendah pada konsentrasi garam tertinggi; akibatnya protein berbeda akan mengendap pada bermacam-macam konsentrasi garam. salvage pathway, Jalur singkat penyelamatan Secara umum, jalur singkat mensintesis hasil akhir komponen yang terkandung; nukleotida dapat tersintesis pada Jalur singkat Sanger dideoxy method, metoda Sanger Dideoxy Teknik mengurutkan DNA yang bekerja mengontrol terhentinya replikasi enzim pada molekul untuk diuraikan. DNA polymerase I digunakan dengan primer, empat deoksinukleosid trifosfat dan 2’,3’dideoksi analog yang satu dengan yang lainnya. Fragmen dari jarak yang bervariasi menghasilkan produk dideoksi yang analog pada 3’end. Empat bagian dari rantai fragmen berakhir (satu untuk setiap analog) kemudian ditampilkan dengan elektroforesis dan autoradiografi, dan rantai dasar dapat dibaca dari empat baris gel.



Hal 61 (10605073, Aditya Edinia N) sarcomere, sarkomer Unit fungsional dari miofibril, bentuk berulangnya yang khusus adalah karena saling bertumpuknya filamen protein yang tebal, dibentuk oleh miosin, dan filamen tipis, yang terbentuk dari aktin dan protein lain, yang berkontraksi melalui sistem geser filamen. sarcoplasmic reticulum, retikulum sarkoplasmik Bagian intraselular sel otot yang mengeluarkan CA2+ dan melepaskannya sebagai respons dari impulls saraf, yang kemudian memulai kontraksi otot. Schiff base, basa Schiff Bentuk antara di dalam reaksi ketika amina bereaksi dengan aldehid atau keton dari gugus nitrogen yang analog terhadap gugus karbonil: Basa Schiff adalah senyawa antara di dalam beberapa reaksi yang dikatalisis enzim. scissile bond, ikatan scissile Ikatan di dalam molekul substrat yang diputuskan oleh enzim. scurvy, sariawan Penyakit yang diakibatkan defisiensi dari Askorbat (Vitamin C), yang menyebabkan pembentukan dari kolagen yang tidak stabil. SDS-polyacrylamide gel electrophores, elektroforesis Gel poliakrimida SDS Elektroforesis dari protein di dalam medium poliakrimida; deterjen SDS membuat pergerakan dari protein secara invers bergerak menurut berat molekularnya. second messenger, messenger sekunder molekul sinyal kecil yang konsentrasinya berubah di dalam respons terhadap messenger primer. secondary structure, struktur sekunder Di dalam protein, penyusunan ruang dari residu asam amino yang secara relatif dekat satu sama lain di dalam urutan linear; heliks A dan Strand B adalah keduanya bagian dari struktur primer. secondary transporter transporter sekunder transporter yang menggunakan energi. sedimentation coefficient, koefisien sedimentasi koefisien dimana kecepatan makromolekul bergerak di dalam area sentrifugal dibagi dengan kekuatan area sentrifugal; biasanya diekspresikan di dalam unit Svedberg. sedimentation-equilibrium centrifugation, sentrifugasi keseimbangan sedimentasi. Teknik ultrasentrifugasi yang bisa digunakan dalam menentukan massa dari suatu protein; sentrifugasi biasanya dilakukan dengan kecepatan yang lambat sehingga pengendapan bisa diimbangi oleh difusi. segmental flexibility, fleksibilitas segmental Mobilitas yang dimiliki antibodi IgG karena polipeptida fleksibel yang menggabungkan Fc dan dua unit Fab. Mobilitas seperti itu meningkatkan formasi dari kompleks antibodi-antigen. selectins, selektin Protein pengikat karbohidrat yang melepaskan sel kekebalan tubuh ke daerah yang terluka dalam proses peradangan. selectivity filter, filter selektif Daerah dari protein channel ion yang menetukan spesifikasi dari channel partikular.



Hal 62 (10605074, Fitana Setioso) self-diagonal plot, perpotongan diagonal Potongan yang digunakan untuk mencari rangkaian asam amino dalam suatu protein. Rangkaian protein tersebut memperlihatkan sumbu vertical dan sumbu horizontal, berjalan dari amino ke gugus karboksil. Sebuah titik diletakkan pada ujung masing - masing asam amino sepanjang sumbu horizontal dan sejajar dengan sumbu vertical. Pengulangan internal diperlihatkan sebagai garis pararel ke garis diagonal tengah yang menggambarkan suatu rangkaian lurus dengan sendirinya. self-splicing RNA, penyambungan RNA. Menunjukkan perpaduan yang mungkin terjadi untuk memindahkan sendiri dari perkusor RNA dan lainnya di dalam rangkaian akson ke bentuk RNA. replikasi semikonservatif. Dalam duplikasi DNA, salah satu strand dari masing - masing pasangan molekul baru disintesis, sedangkan yang lain tidak diubah dari DNA parental double helix. semiconservative replication,



Sequence Templates. residu konservasi, yaitu struktur dan fungsi serta karakteristik khusus protein. sequential displacement reaction, reaksi pemindahan rangkaian. Suatu reaksi mempunyai reaktan multiple yang semua substratnya berikatan dengan enzim sebelum beberapa hasil reaksi dibebaskan. Demikian halnya dengan reaksi dua substrat, gambaran kompleks pada enzim dan bentuk kedua substrat. Sequential Model. Sebuah model yang menggambarkan enzim allostrik pada pengikat dari satu substrat yang mempengaruhi afinitas substrat dari bagian aktif tetangganya tanpa menyebabkan transisi arah segala enzim. Serine Proteases. Suatu ruang dari enzim protein degradasi yang aktifitasnya bergantung pada kehadiran serine di bagian yang aktif, simotripsin dan tripsin contohnya. reseptor tujuh transmembran helix Suatu ruang dari tipe protein integral membrane oleh transduksi di bagian intramembran yang terdiri dari tujuh daerah, reseptor ini selalu berpasangan dengan protein G. seven-transmembrane-helix (7TM) receptors,



SH2 Domain (Src Homology Domain). Daerah yang terdapt kurang lebih 100 asam amino yang berikatan dengan phospotirosin. SH3 Domain (Src Homology Domain). Daerah yang mengikat bidang proline-rich pada polipeptida. Sheet, β. Kondisi motif struktur di dalam protein yang dua atau lebih β strand dihubungkan sebagai tumpukan rantai, distabilitasi oleh antar rantai ikatan hidrogen, strand β yang arahnya sama dengan bentuk penutup lipatan β, sedangkan seperti strandrunning berlawanan arah dari antiparalel penutup lipatan. rangkaian Shine-Dalgarno. Pada RNAm daerah prolinerich sekitar 10 nukleotida pada sisi 5’ dari kodon inisiator yang berpasangan dengan 3’ berakhir 16S RNA di 30S subunit ribosomal, membantu menentukan translasi awal pada molekul RNAm. Shine-Dalgarno sequence,



side chain, bagian rantai sisi Khusus ikatan grup R sebuah atom carbon asam amino.



Siemen. Timbal balik ohm, yang ukuran daya tahannya mengalir dari tempat elektrik.



Hal 63 (10605075, Eka Widayanti) sigma subunit, subunit sigma Komponen dari RNA polimerase bakteri yang membuat RNA polimerase untuk mengenali tempat dari promotor. signal sequences, urutan sinyal Urutan dari residu asam amino yang mempunyai panjang dari 13 sampai 36 residu, biasanya di terminus dari amino dari rantai polipeptida, yang menandakan protein untuk translokasi sepanjang retikulum endoplasma kasar. site-specific mutagenesis, mutagenesis letak-spesifik penggunaan dari teknologi rekombinan DNA untuk menciptakan delesi, insersi, atau substitusi yang spesifik secara in vitro dalam gen yang partikular; teknik ini membuat dapat dilakukannya produksi dari protein dari asam amino yang diinginkan di posisi manapun. site-specific recombination, rekombinasi spesifik Pertukaran dari dua urutan DNA yang spesifik tapi tidak selalu homolog. small G protein, protein G kecil Sebuah protein pengikat nukleotida guanil monomerik yang aktif ketika terikat pada GTP dan inaktif ketika terikat pada GDP; mempunyai aktivitas GTPase inheren. small nuclear RNAs (snRNAs), RNAs inti kecil (snRNAs) Kelas dari RNAs kecil yang terdapat di nukleus; beberapa terlibat dalam pemotongan atau splicing. sodium-potassium pump, pompa sodium-potasium Enzim yang menggunakan energi dari ATP hidrolisis untuk memompa sodium keluar dari sel dan potasium masuk ke dalam sel. Disebut juga soium-potasium ATPase. solid-phase method Suatu cara untuk mensintesis peptida diskrit dimana asam amino ditambahkan langkah demi langkah ke rantai peptida yang dalam proses pemanjangan yang terikat pada matriks. somatic mutation, mutasi somatis merujuk pada introduksi terhadap mutasi setelah rekombinasi V-D-J untuk meningkatkan keragaman dari antibodi. Southern blotting Teknik yang digunakan untuk menemukan dan mengidentifikasi fragmen DNA yang mengandung urutan tertentu; campuran dari fragmen dipisahkan dengan elektroforesis, ditransfer ke lembaran nitroselulosa, dihibridisasi kepada label DNA probe yang radioaktif yang komplementer terhadap urtan DNA yang dicari dan divisualisasikan oleh autoradiografi. special pair, pasangan khusus Di dalam pusat reaksi fotosintetik, pasangan dari molekul klorofil yang mengumpulkan energi eksitasi dari molekul antena klorofil dan mentransfer elektron ke akseptor elektron yang lain. specific activity, aktivitas spesifik Pengukuran dari aktivitas dari protein sampel relatif terhadap jumlah protein yang terdapat pada sampel, biasanya dipresentasikan sebagai aktivitas unit per miligram protein; dilakukan dalam setiap tahap dari proses purifikasi sebagai pengukuran dari efektivitas dari purifikasi. sphingomyelin, spingomielin Umum dalam jaringan otak, spingolipid dimana terminal



grup hidroksil dari ceramide mempunyai substituen fosforilkolin. Hal 64 (10605076, Suharto) Sphingosine Alkohol amino yang mengandung rantai hidrokarobon tidak jenuh yang panjang, yang merupakan komponen fosfolipid spingomielin seperti halnya glikolipid, fungsinya analog dengan gliserol dari gliseroldehid. spliceosome Kumpulan protein dan inti RNA kecil yang membelah transkrip primer untuk membentuk mRNA. splicing Pelepasan intron dan penyambungan ekson dari prekursor RNA untuk membentuk RNA. spontaneous Proses yang terjadi secara irreversible terhadap ekuilibrium dan diikuti oleh meningkatnya kekacauan, atau entropi. stage 1 metabolism Fase dimana molekul-molekul besar dipecah menjadi unit-unit yang lebih kecil, contohnya glikogen dikonversi menjadi glukosa. stage 2 metabolism Fase dimana molekul-molekul kecil didegradasi menjadi beberapa kunci intermediet seperti asetil CoA dalam metabolisme. stage 3 metabolism Fase yang mengandung siklus asam sitrat dan fosforilase oksidatif, yaitu jalur akhir dari oksidasi molekul bahan bakar. standard free-energy change Reaksi perubahan enregi bebas, ketika kondisi di bawah standar, dimana konsentrasi masing-masing reaktan 1,0 M. starch Sebuah homopolisakarida yang tersimpan dalam bentuk glukosa pada kloroplas tumbuhan, amilopektin, pati tersusun dari canag-cabang yang panjangnya sekitar satu α1,6 linkage per 30 α-1,4 linkage, sementara amilosa tidak memiliki cabang, tersusun atas residu glukosa dengan α-1,4 linkage. start codon Kodon pertama yang ditranslasi, biasanya AUG. starved-fed Pada hewan, perubahan biokimia yang terdapat pada tahap postabsortif, tahap pemanjangan yang cepat dan REFED, seperti tahapan yang terjadi antara waktu makan malam hingga sarapan pagi. statins Inhibitor HMG-CoA reduktase yang digunakan untuk menurunkan kadar kolesterol pada pengidap penyakit atherosklerosis. stem-loop structure Motif struktural yang paling umum dan sederhana yang ditemukan dalam asam nukleat rantai tunggal, dibentuk ketika dua barisan komplementer pada rantai tunggal bersatu untuk membentuk struktur helix ganda dengan lekukan yang tidak berpasangan pada bagian ujung daerah helik. stereocilium Satu dari 20 sampai 300 projeksi seperti rambut yang menonjol dari sel rambut, pergerakan stereosilia menginisiasi penerimaan jalur transduksi sinyal dengan mengubah polarisasi sel-sel rambut. steroid hormones Hormon, seperti androgen dan estrogen, diturunkan dari kolesterol. Hal 65 (10605077, Prima Besty)



sterol regulatory element binding protein (SREBP) Elemen transkriptirol regulator dari gen reduktase HMG-CoA dan gen lainnya dalam metabolisme kolesterol untuk menstimulasi factor transkripsi yang mengikat sten. stop codons sebuah kodon yang dapat dikenal oleh factor pembebasan dan menandai akhir dari translasi. strand, β sebuah perpanjangan rantai polipeptida, dengan sebuah jarak aksial dari 3,5 amstrong antara asam amino yg berdekatan, sering ditemukan di sebuah lipatan dari lembaran beta. streptomycin dasar dari antibiotic trisaccharide yang menyebabkan keduanya inhibisi dari translasional initasi dan kesalahan membaca dari mRNA dalam prokariot. stringent response dalam bakteri, sebuah pengurangan didalam dasar ribosomal dan transfer RNA sintesis dalam respon terhadap kelangkaan dari asam amino. stroma matriks dari kloroplast, berisi tilakoid juga enzim pelarut dan menyertakan oleh sebelah dalam membran dari kloroplas. substitution matrix sebuah peralatan untuk menentukan hubungan evolusioner diantara rangkaian asam amino. Dimana dua rangkaian dibandingkan, substrate Reaktan dalam reaksi kimia. Suatu enzim yang mengkatalis reaksi kimia tunggal atau reaksi sejenisnya, dan komponen dari reaksi itu disebut substrat. substrate channeling properti komplek multienzim dimana produk dari satu reaksi diarahkan langsung pada sisi aktif dari enzim berikutnya dalam komplek, dalam hal ini adalah substrat. Substrate channeling menukar nilai katalitik dengan mencegah kehilangan intermediet dalam reaksi keseluruhan. substrate cycle Sepasang reaksi termodinamika biokimia yang irrevesibel yang secara simultan memproduksi dan menhkonsumsi sepasang intermediet metabolic; pasangan jalur ini dapat menjelaskan sinyal metabolic dan dalam beberapa kasus dapat pula menghasilkan panas untuk kestabilan suhu dalam jaringan, disebut pula “futile cycle”. substrate-level phosphorylation Formasi ATP dari ADP dimana donor fosfat adalah substrat dengan potensial transfer fosforil yang tinggi. Hal 66 (10605078, Indri Hikmah Amalia) susinasi-Q reduktase Protein integral kompleks dari membran dalam mitokondria yang mentransfer elektron dari FADH2, yang terbentuk saat siklus asam sitrat menjadi koenzim Q. Juga disebut Kompleks II. succinate-Q reductase,



sukrosa Disakarida dari glukosa dan fruktosa ( biasanya dikenal sebagai gula ) yang dengan mudah diangkut dan disimpan oleh sel tumbuhan. sucrose,



Suicide (mechanism-based) inhibition Penghambat yang dihasilkan ketika sebuah enzim merubah substrat menjadi inhibitor reaktif aktivitas katalitik. Supercoil Sebuah struktur dibentuk oleh DNA sirkular tertutup, dimana DNAnya lebih padat daripada DNa sirkular yang rileks; DNA sirkular heliks melekukan dirinya untuk membentuk sebuah superheliks.



supercoiling Berarti kemampuan dari DNA sirkular tertutup untuk menggulung dirinya. Superhelix Gulungan dari sebuah DNA rangkap dua yang terbentuk ketika terlekuk saling silang pada aksisnya. superoksida dismutase Sebuah enzim yang meng”scavenges” radikal superoksida dengan mengkatalisis perubahan dari dua senyawa radikal tersebut menjadi hidrogen peroksida dan oksigen molekuler; menjaga melawan serangan oleh spesies yang reaktif terhadap oksigen. superoxide dismutase,



Svedberg Unit Unit pengukur sedimentasi dari suatu makromolekul; unit Svedberg setara dengan 10-13 sekon. simporter Sistem transpor dimana sebuah molekul dibawa melalui membran dengan arah yang sama seperti ion, yang akan kembali dikeluarkan melewati membran selama transpor aktif yang memerlukan ATP. symporter,



sintase Enzim pengkatalisis reaksi sintesis dimana dua unit bergabung tanpa menggunakan langsung nukleotida trifosfat. synthase,



sintetase Enzim pengkatalisis reaksi sintesis dimana bergabungnya dua unit diperlukan ATP atau nukleotia trifosfat. synthetase,



Tata box Dapat ditemukan didekat semua gen-gen eukariotik, sebuah elemen promotor membangun mRNA. Tata box dipusatkan antara 30 dan 90 aliran residu dari tempat transkripsi dimulai dan memiliki sekuens consensus 5’-TATAAAA-3’. Tata-box binding protein associated factor ( TAF ) Satu kelompok protein, sebagian besar terdiri dari Bromodomain, yang mengikat Tata-box-binding protein untuk membentuk kompleks yang dibutuhkan untuk transkripi RNA. Taxol Senyawa kimia yang diisolasi dari pohon cemara pasifik yang menstabilkan tubulin didalam mikrotubulus dan meningkatkan polimerasi; digunakan dalam kemoterapi untuk turut serta dalam proluferasi pemisahan sel dengan cepat. Hal 67 (10605079, Salli Marindha) Tay-Sachs disease Penyakit keturunan yang disebabkan kekurangan enzim (α-Nacetylhexosaminidase) yang bertanggung jawab untuk mendegradasi zat tertentu sehingga terjadi penimbunan zat tersebut pada otak (ganglion) dan otak menjadi rusak. Karakteristik klinisnya yaitu penuruna kondisi tubuh, penurunan mental, ‘dementia’, dan meninggal pada masa balita (kurang lebih 3 tahun). T cell Limfosit yang memiliki reseptor (sel T reseptor) yang mengenali antigen hanya jika terikat pada protein MHC (major histocompability complex). Terdapat dua tipe utama pada T sel yaitu sel T sitotoksik (killer T cells) dan sel T helper. T-cell-mediated immunity Salah satu pengenalan respon sistem imun, dimana T sel akan memeriksa permukaan seluruh sel dan T sel membunuh atau memusnahkan protein asing yang disintesis oleh pathogen intercellular. T-cell receptor Suatu reseptor yang mengenali peptide yang ditunjukkan oleh MHC protein pada sel target. Reseptor terdiri dari 43-kd ikatan rantai yang dibedakan menjadi dua yaitu ikatan sulfide dan spanning membrane plasma. Kombinasi yang konstan dan



wilayah yang berubah-ubah di antara variasi reseptor sel T diikuti sel T untuk mengenali epitopes yang berbeda dalam jumlah yang banyak. telomerase Suatu kebalikan dari enzim transcriptase yang terdapat pada template, yaitu enzim yang mengkatalisis pemanjangan telomere. telomere Akhir atau ujung dari kromosom, DNA pada telomere terdiri atas pengulangan rangkaian atau ururtan hexanukleotida yang merupakan karakteristik dari organism. template Pada DNA atau RNA, suatu sequence langsung diproduksi (transkripsi) untuk melengkapi suatu sequence. template strand Untai dari DNA atau utas DNA yang melengkapi transkripsi dari RNA. terminal Glycosylation Penambahan karbohidrat kepada protein dan pengolahan atau pemprosesan dari karbohidrat yang ada pada golgi kompleks. termination Akhir dari tahap seluruh reaksi polimerisasi biologi. Proses polimerasi diberhentikan dalam respon pada spesifik signal termiinasi untuk molekul biologi saat disintesis tertiary structure Pada protein, susunan ruang dari sisa asam aminomemiliki jarak yang cukup jauh pun jauh satu sama lainpada sequence linear, dan juga memiliki ikatan sulfida. tetracycline Suatu antibiotic yang mengikat subunit 30S ribosom pada prokariotik dan menghalangi pengikatan acyl-tRNA-molecul tampak pada kompleks ribosom. tetrahydrofolate (tetrahydropteroyglutamate) pembawa aktivitasi satu unit karbon. tetrodotoxin Racun berbahaya yang ada pada ikan kembung (puffer fish) yang menghalangi atau menutup perantaraan (konduksi) impuls saraf sepanjanf akson dan merangsang membrane pada serabut saraf sepanjang akson dan merangsang membran pada serabut saraf, kelumpuhan alat penapasan. Hal 68 (10605082, Novita Fajriah) Tetroses monosakarida yang memiliki 4 atom karbon Thalassemias penyakit genetic yang ditandai oleh sistesis yang kurang sempurna dari satu atau lebih rantai hemoglobin. Thermogenesis regulasi tidak berpasangan dari fosforilasi oksidatif sebagai cara penurunan panas untuk menjaga suhu tubuh. Thermogenin protein pada membrane mitokondria (protein tidak berpasangan) yang berperan dalam termogenesis dengan membentuk jalur untuk aliran proton kedalam mitokondria, dengan demikian penurunan panas dilakukan tanpa sintesis ATP. Thiamine komponen vitamin dari koemzim pirofosfat tiamin. Disebut juga vitamin B1. Thiamine Pyrofosfat koenzim yang tersusun atas tiamin (vitamin B1), The coenzyme form of thiamine (vitamin B1), menyusun pembentukan cincin tiazol yang dihubungkan dengan jembatan metilen untuk menggantikan pirimidin; kofaktor dalam reaksi enzimatik yang berikatan dengan atom karbon karbonil yang membelah atau disintesis.. Thioester intermediate suatu ester yang atom nonkarbonil oksigennya digantikan oleh



atom ; tioester kaya energi dalam reaksi biokimia. Thiol protease suatu kelas turunan protein enzim yang aktivitasnya bergantung pada keberadaan dari residu sistein pada bagian aktif; papain adalah protease tiol. Thioredoxin protein dengan sistein yang terbuka dapat dioksidasi secara reversible dan direduksi; pembawa electron yang penting dalam reduksi dari ribonukleotida dan fotosintesis. 3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reductase (HMG-CoA reductase) enzim regulasi yang mengkatalisis tahap pertemuan pada sintesis kolesterol- formasi dari mevalonat dari 3-hidroksi-3- metilglutaril CoA. 3-isopentyl pyrophosphate suatu precursor untuk kolesterol sebaik variasi besar dalam biomolekul lainnya seperti vitamin K, koenzim Q, dan karotenoid; turunan dari mevalonat. Thylakoid pada kloroplas, kantung membrane, atau vesikula, yang mengandung energi transduksi dari fotosintesis, termasuk cahaya- mengumpulkan protein, pusat reaksi, rantai transport electron, dan sintesis ATP. Thymidylate sintesis suatu enzim yang mengkatalis metilasi dari deoksiuridilat (dUMP) untuk membentuk timidilat (TMP). Tip link suatu filament yang berhubungan dekat dengan stereocilia; dalam membrane stereosilia, tip link adalah stereosilia; untuk ion chanel yang diblok oleh tekanan; pergerakan mekanik aliran arus melewati rambut membran sel, yang mungkin menginisiasi atau mengterminasikan sinyal pendengaran-jalur transduksi. Hal 69 (10605083, Andri Irawan S. M.) topoisomerase Enzim yang mengkatalis perubahan topoisomer dari DNA; dapat mengendurkan gulungan DNA yang sangat kuat. topoisomerases,



topoisomerase II (DNA Girase) Enzim topoisomerase yang mengkatalisis reaksi yang membutuhkan ATP dalam mengintroduksi supercoil negatif menjadi DNA. topoisomerase II (DNA gyrase),



Molekul dari DNA yang berbeda antara satu dengan yang lainnya hanya dalam jumlah ikatannya. topoisomers



suatu enzim yang merubah unit dihidroksi aseton tiga-karbon dari suatu ketose menjadi akseptor aldose; salahsatu bagian enzim nonoksidatif dalam suatu jalur pentosa phospat. transaldolase



transaminasi Transfer suatu kelompok α-amino dari suatu asam amino menjadi asam keto-α. transamination,



transkripsi Proses sintesis RNA secara langsung oleh DNA yang dikatalis oleh RNA Polimerase. transcription,



gelembung transkripsi tempat sintesis RNA atau transkripsi; mengandung RNA polimerase, “gelembung” DNA yang meleleh (melted) secara lokal, dan heliks yang terdiri dari strand template dan RNA yang baru disintesis. transcription bubble,



faktor transkripsi Suatu protein yang membantu RNA polimerase dalam inisiasi sintesis / pembentukan RNA, terikat pada promotor elemen yang spesifik. transcription factor,



transducin protein G merupakan protein sinyal yang sepasang dari eksitasi visual; diaktivasi oleh rhodopsin, memicu aktivasi dari cGMP fosfodiestrase, yang selanjutnya memicu ke sebuah impuls saraf. transfer RNA, RNA transfer Molekul adaptor dalam proses sintesis protein; mengandung suatu tempat pengenalan terhadap asam amino dan tempat pengenal cetakan, atau antikodon. Transferase Suatu enzim yang mengkatalis suatu kelompok transfer, sering membutuhkan adanya kofaktor. transformation,



transformasi Pemasukkan suatu DNA asing ke dalam sel secara utuh.



hewan transgenik Suatu hewan yang mengekspresikan suatu gen asing yang sebelumnya telah dimasukkan dalam garis…; Suatu percobaan dengan menggunakan suatu hewan dan keturunannya menunjukkan bahwa gen asing dapat diatur sebagai sesuatu promotor yang baru secara efisien, terintegrasi, di ekspresikan dan di transmisikan. transgenic animal,



transisi Suatu mutasi yang dihasilkan dari substitusi satu basa pirimidin dengan yang lainnya atau satu basa purin dengan basa yang lainnya. transition,



keadaan transisi Suatu jenis bahan kimia yang memiliki energi bebas yang sangat tinggi dan konsentrasi yang sangat rendah dalam suatu jalur dari substrat menjadi produk. transition state,



analog keadaan transisi Suatu senyawa yang mencerminkan keadaan transisi suatu reaksi yang terkatalisis; senyawa ini biasanya berpotensi sebagai inhibitor dalam suatu reaksi yang dikatalis oleh enzim. transition-state analog,



Hal 70 (10605084, Ima Purnamasari) Transkelotase enzim yang mentransfer unit aldehid yang diaktifkan dari ketosa ke aldosa sebagai penerima; salah satu enzim dalam bagian nonoksidatif dari jalur pentosa fosfat translasi sintesis protein didalam sel, dinamai demikian karena 4 huruf alfabet yang mewakili asam nukleat diterjemahkan menjadi asam amino berbeda yang menyusun protein translation,



penahan translasi suatu mekanisme untuk pengaturan transkripsi dimana protein dikode oleh operon ke mRNA dekat sisi inisiasi untuk disintesis dan menghentikan sintesis beberapa protein yang dikode oleh pesan polygonik tersebut; sintesins 50 atau lebih protein dari ribosom merupakan subjek kendali dari penahanan translasi translational repressor,



treanslokase enzim yang membawa molekul dari satu bagian sel ke bagian sel lainnya ; translokase ATP-ADP memfasilitasi pergantian ATP dan ADP antara mitokondria dan sitosol translocase,



antibiotik transpor antibiotik yang menggunakan pengaruhnya dengan membuat membran menjadi permeabel transport antibiotics,



vesikel transpor bagian ikatan antar membran yang menengahi transfer protein antara RE dan badan Golgi dan antara badan Golgi dengan tujuan berikutnya transport vesicles,



Transposase Enzim di inti yang dikode oleh serangkaian insersi ( IS) atau transposan ; membuat potongan yang membingungkan dalam sisi pendonor dan penerima, memudahkan insersi ( IS) kedalam gen bakteri transposisi pergerakan dari satu kromosom ke kromosom lain atau dari satu lokasi ke lokasi lain dalam satu kromosom transposition,



Transposon elemen genetik aktif dari bakteri yang memudahkan gen untuk ditransfer selama dalam rentetan non homolog transversion,



transversi mutasi dimana keberadaan purin digantikan oleh pirimidin



atau sebaliknya triacylgliserol gliserol yang mempunyai rantai asam lemak hasil esterifikasi dari masing-masing ikatan hidroksilnya ; tersimpan dalam bentuk lemak ; dikenal pula sebagai lemak murni atau trigliserida triacylglycerols,



Trimethoprim penghambat yang baik untuk menurunkan dihidrofolat, seperti methotreksat tapi khusus untuk enzim bakteri dan protozoa pengulangan trinukleotida potongan DNA dimana serangkaian trinukleotida diulang berkali-kali ; potongan DNA ini dapat meluas selama replikasi DNA, menyebabkan beberapa penyakit genetik seperti hunington trinucleotide repeats,



Triose monosakarida yang mempunyai tiga atom karbon tropomiosin terdapat dalam benang-benang tipis sakromer, protein yang berperan dalam mengatur kontrksi otot dengan memblokir interaksi antara miosin dengan aktin dalam konsentrasi Ca2+ yang rendah ; diatur oleh troponin tropomyosin,



Hal 71 (10605085, Ajeng Kurnia) troponin complex terdapat di filamen tipis dari sarkomer yang meregulasi kontraksi otot melalui interaksi allosterik dengan tropomiosin sebagai respon dari perubahan konsentrasi Ca2+. TRP (transient receptor potential) channels keluarga dari channel ion yang berubah ubah sebagai respon terhadap pergerakan. tubulin komponen protein utama dari mikrotubul yang terdapat dalam 2 bentuk, tubulin α dan β; tubulin memperlihatkan aktivitas GTPase yang penting dalam perakitan dan perombakan microtubul. tumor promoters senyawa kimia yang menginduksi proliferasi sel karsinogenik; contohnya phorbol esters. tunicamycin inhibitor antibiotik dari N-glycosylation yang bersifat analog hidropobik terhadap UDP-Nacetylglucosamine; menghambat tahap pertama sintesis oligosakarida.



turn, β dalam protein, elemen struktural yang terbentuk dari 4 asam amino, dimana gugus CO dan NH dari residu 1 terikat oleh ikatan hidrogen ke gugus NH dan CO dari residu 4, membuat rantai polipeptida untuk mengubah arahnya. turnover number jumlah dari molekul substrat yang diubah menjadi produk oleh molekul enzim dalam satu unuit waktu ketika enzim terlarut dalam substrat; setara dengan konstanta kinetik k2. two-dimensional gel electrophoresis suatu cara untuk menganalisis protein sampel dimana awalnya sampel dipecah dalam satu dimensi dengan pengfokusan isoelektrik dan selanjutnya diikuti dengan pemecahan dalam dimensi dua yang sejajar dengan yang awal, oleh eletroforesis gel SDS-polyacrylamide electrophoresis. U ubiquinone and ubiquinol lihat coenzyme Q. ubiquitin terdapat pada semua eukariot, protein yang berukuran kecil dan terdapat dalam jumlah banyak, ketika menempel pada protein lain, protein lain itu akan ditandai untuk penghancuran proteolitik. ultracentrifugation sentrifugasi kecepatan tinggi yang digunakan untuk memisahkan biomolekul dan menentukan massanya. uncoupling protein protein membran mitokondria yang berperan dalam termogenesis dengan membuat jalur bagi aliran proton ke mitokondria yang akan menyebabkan panas tanpa sintesis ATP. Juga disebut termogenin. urea cycle jalur siklus yang merubah asam amonia berlebih menjadi urea untuk disekresikan; jalur metabolisme pertama yang ditemukan. Hal 72 (10605087, Gilang Ramadhan) uricotelic, urikotelik Merunut kepada organisme yang menghasilkan amonia yang telah diubah menjadi asam urat purin untuk disekresikan; burung dan reptil terestrial termasuk urikotelik. uridine diphosphate glucose (UDP-glucose), glukosa uridin difosfat Bentuk glukosa yang sudah teraktivasi di dalam sintesis glikogen; dibentuk dari Glukosa 1-fosfat dan UTP. V van der Waals interaction, interaksi van der Waals Tarikan antara 2 molekul yang berdasarkan elektron asimetris transien di sekeliling sebuah atom yang menginduksi asimetri yang komplemen di molekul di dekatnya. variable region, area variabel Rangkaian asam amino residu-108 yang ditemukan di ujung terminal-N dari immunoglobin tipe rantai ringan dan berat dari immunoglobin G; Urutan dari area ini bervariasi untuk tiap tipe antibodi yang diketahui; bagian dari segmen ini (region hipervariabel) membentuk tempat penempelan (binding site) antigen dari immunoglobin.



V-D-J recombination, rekombinasi V-D-J Suatu cara untuk meningkatkan keragaman antibodi dengan cara merekombinasi gen (V) variabel, gen (J) penggabung, gen (D) keragaman ( diversitas) untuk mengaktifkan seluruh region variabel dari rantai antibodi; Gen D mengalami rekombinasi hanya di dalam rantai berat dari antibodi. virilization, virilisasi Kelainan dari sintesis hormon steroid yang diturunkan dikarenakan level androgen secara abnormal sangat tinggi; karakteristik klinis termasuk perkembangan seksual yang lebih awal pada laki-laki; maskulinisasi dari organ genital eksternal perempuan; dan kehilangan Na+ yang persisten, yang menyebabkan dehidrasi dan hipotensi (darah rendah). Virion Bentuk ekstraselular yang lengkap dari virus yang mengandung RNA atau DNA yang dikelilingi pelindung. Virus Kompleks dari protein dan asam nukleat yang dapat menembus sel dan dan mereplikasi dirinya sendiri dengan menumpang pada metabolisme sel inang dan menghasilkan kopi dari dirinya sendiri sama dengan hasil gen dari inang; organisme terkecil yang pernah diketahui. Vitamin A Vitamin yang larut dalam lemak yang merupakan prekursor dari pigmen sensitif-cahaya yang terdapat di retina dan molekul sinyal asam retinoik, aktivator dari beberapa faktor transkripsi. Juga disebut retinol. Vitamin B12 Grup protestik, yang mengandung atom kobalt, cincin Korin, dan deoksiadenosin, yang berperan dalam pengaturan intramolekular, Metilasi, dan reduksi dari ribonukleotida menjadi deoksiribonukleotida. Disebut juga kobalamin. Vitamin D Vitamin yang larut dalam lemak yang berperan dalam regulasi metabolisme kalsium dan fosfor; kekurangan vitamin D menyebabkan pembentukan tulang yang tidak sempurna. Vitamin E Melindungi membran lipid dari oksidasi. Juga disebut α -tokoferol. Vitamin K Vitamin larut dalam lemak yang diperlukan dalam penggumpalan darah.



Hal 73 Vitamins: Substansi organik yang dibutuhkan dalam jumlah kecil yang digunakan dalam beberapa reaksi penting biokimia VLDLs (very low density lipoproteins): partikel lipoprotein ,yang diseimbangkan oleh apolipoprotein B-100 dan E, yang menyalurkan kelebihan triacylglycerides dan kolestrol dari hati ke jaringan lain Voltage-gated channel: pompa antar membran yang terbuka akibat depolarisasi membran; misal: pompa natrium-kalium Von-Gierke disease: infeksi pada hati dan ginjal yang diakibatkan oleh penyebaran glukosa 6-fosfat yang tidak sempurna, misal: glikogen yang dihasilkan dalam jumlah yang tidak normal (sangat besar) akan mengakibatkan pembesaran pada hati dan mengakibatkan kerusakan pada fungsi hati



W Watson-Crisk helix: lihat B-DNA helix Western blotting: salah satu teknik immunoassay yang digunakan untuk mendeteksi protein spesifik dalam cairan tubuh, misal: elektroforesis suatu sample menggunakan SDS-poliakrilamid akan menyebabkan protein sample bergerak di sepanjang lembaran polimer (plat elektroforesis), kemudian antibodi spesifik dalam protein tersebut akan muncul sebagai noda titik (menunjukkan jenis protein spesifik), sedangkan antibodiantibodi lain akan berguna dalam memvisualisasikan kompleks antigen-antibodi. Wobble hypothesis: dugaan bahwa kebebasan sterik pada pasangan basa ke-3 dari kodon mRNA dengan antikodon dari molekul RNA transfer membiarkan lebih dari 1 kodon diterjemahkan oleh 1 molekul tRNA khusus. X Xeroderma pigmentosa: kelainan pada kulit yang jarang terjadi, ditandai oleh kepekaan/kesensitifan terhadap sinar ultraviolet dan cenderung menjadi kanker; disebabkan oleh kerusakan pada enzim exinuclease yang memegang kontrol dalam penghilangan sebagian kecil pirimidin X-Ray crystallography: suatu teknik untuk menentukan struktur 3 dimensi dari kristal atom protein dengan cara menguji pola difraksi penyinaran x-ray pada kristal tersebut Y Yeast artifical chromosome (YAC): molekul DNA yang dapat digunakan untuk menggandakan bagian rantai DNA dengan panjang antara 100-1000 kilo basa; mengandung sentromer, rangkaian DNA yang dapat bereplikasi secara otomatis, sepasang telomer, penanda gen tertentu, dan bagian dari rangkaian rantai yang akan digandakan. Hal 74 skema Z dari fotosintesis Jalur aliran elektron antara fotosintesis I dan II; disebut begitu karena diagram redox dari P680 sampai dengan P700+ terlihat seperti huruf Z. Z scheme of photosynthesis,



Z-DNA Sebuah lengan kiri dari dobel helix yang di dalamnya tulang punggung fosfat berzigzag; dapat terbentuk oleh oligonukleotida dengan mengganti urutan dari purin dan pirimidin. kluster seng Ditemukan di dalam pasangan dalam keluarga besar reseptor nuklir dari protein, sebuah motif tempelan DNA yang di dalamnya sebuah ion seng dikoordinasi menjadi rantai empat sisi sistein. zinc clusters,



zinc finger,



jari seng Sebuah urutan spesifik domain tempelan DNA terkonservasi,



ditemukan sebagai anggota dari keluarga hormone reseptor nuklir, yang terdiri dari delapan residu sistein: empat yang pertama menempel sebuah seng dan empat berikutnya menempel yang lainnya. protease seng Sebuah kelas dari enzim pengurai protein yang mengkatalis aktivitas yang bergantung pada sebuah ion seng; karboksipeptidase A adalah sebuah protease seng. zinc proteases,



sentrifugasi zonal Sebuah teknik sentrifugasi tingkat tinggi yang didalamnya sampel disentrifugasi melalui gradient peningkatan rapat dan komponen-komponennya tercerai berai diatas koefisien sedimentasi pembeda. zonal centrifugation,



ion zwitter Sebuah ion dipolar (dari bahasa jerman zwitter, “diantara”); pada pH netral, asam amina memiliki sebuah grup amino terprotonasi dan sebuah grup karboksil terdisosiasi dan adalah demikian ion zwitter. zwitterions,



Zymogen Sebuah target awal yang secara katalis tidak aktif dari sebuah enzim ----