Latihan Soal Bioteknologi 2021 - 3 [PDF]

Citation preview

LATIHAN SOAL BIOTEKNOLOGI 2021 Hepatitis B merupakan penyakit infeksi hati serius yang disebabkan oleh virus hepatitis B. Pencegahannya dapat dilakukan melalui pemberian vaksin. Vaksin hepatitis B dapat dibuat secara rekombinan menggunakan antigen permukaan virus yang berukuran kecil (HBsAg). Urutan DNA dari antigen tersebut sebagai berikut : 5’-TCAACCACCAGCACGGGACCATGCCGAACCTGCACGACTACTGCTCAAGGAACCTCTATGTATCCCTCCTGTTGCTGTACAAAA CCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAATTCCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTT C-3’ 1. Jika gen tersebut akan diperbanyak secara in vitro, buatlah desain primer yang dapat mengamplifikasi seluruh urutan DNA gen tersebut! Forward : 5’-TCAACCACCAGCACGGGA-3’ Forward 5’-TCAACCACCAGCACGGGA-3’ 3’-AGTTGGTGGTCGTGCCCT-5’ Reverse : 5’-TGGGCCTCAGCCCGTTTC-3’ 3’-ACCCGGAGTCGGGCAAAG-5’ Reverse 5’-GAAACGGGCTGAGGCCCA-3’ Kalau dari 3’ ke 5’ 3’-TCAACCACCAGCACGGGACCATGCCGAACCTGCACGACTACTGCTCAAGGAACCTCTATGTATCCCTCCTGTTGCTGTACAAAA CCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAATTCCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTT C-5’ Forward 3’TCAACCACCAGCACGGGA-5’ 5’AGTTGGTGGTCGTGCCCT-3’ Reverse 3’-TGGGCCTCAGCCCGTTTC-5’ 5’-CTTTGCCCGACTCCGGGT-3’



2. Setelah dielektroforesis, gambarkan pita yang terbentuk yang menunjukkan proses PCR berhasil!



3. Bagaimana urutan mRNA dari gen HBsAg?  Kalau 5 ke 3 5’TCAACCACCAGCACGGGACCATGCCGAACCTGCACGACTACTGCTCAAGGAACCTCTATGTATCCCTCCTGTTGCTGT ACAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAATTCCTATGGGAGTGGG CCTCAGCCCGTTTC-3’ Jawaban: 5’UCAACCACCAGCACGGGACCAUGCCGAACCUGCACGACUACUGCUCAAGGAACCUCUAUGUAUCCCUCCUGUUG CUGUACAAAACCUUCGGACGGAAAUUGCACCUGUAUUCCCAUCCCAUCAUCCUGGGCUUUCGGAAAAUUCCUAU GGGAGUGGGCCUCAGCCCGUUUC-3’ 



Kalau 3 ke 5 3’TCAACCACCAGCACGGGACCATGCCGAACCTGCACGACTACTGCTCAAGGAACCTCTATGTATCCCTCCTGTTGCTGT ACAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCCTGGGCTTTCGGAAAATTCCTATGGGAGTGGG CCTCAGCCCGTTTC-5’ Cara 1 AT GC Langkah pertama transkripsi 5’-AGTTGGTGGTCGTGCCCTGGT………..-3’ Langkah kedua Ganti T jadi U 5’-AGUUGGUGGUCGUGCCCUGGU…………..-3’ Cara 2 AU TA GC 3’-TCAACCACCAGCACGGGACCA-5’ 5’-AGUUGGUGGUCGUCCCUGGU-3’



4. Jika semua urutan DNA tersebut adalah ekson, tuliskan urutan asam amino yang terbentuk!



CATATAN:  JIKA TIDAK DISURUH PROSES TRANSLASI MAKA SEMUA DICARI ASAM AMINONYA, KALAU KETEMU STOP KODON, DIBERI TANDA STOP AJA, TERUS TETEP LANJUT SAMPE SEMUA BERES  KALAU DISURUH YANG PROSES TRANSLASI AJA, DICARI TERLEBIH DAHULU START KODON (AUG), DIMULAI DARI START KODON SAMPAI KETEMU STOP KODON, UDAH SELESAI JANGAN DILANJUT. 



Kalau 5 ke 3 (PAKAI HASIL mRNA/ no 3) 5’UCA.ACC.ACC.AGC.ACG.GGA.CCA.UGC.CGA.ACC.UGC.ACG.ACU.ACU.GCU.CAA.GGA.ACCUCUAUGUAUCCCU CCUGUUGCUGUACAAAACCUUCGGACGGAAAUUGCACCUGUAUUCCCAUCCCAUCAUCCUGGGCUUUCGGAAAA UUCCUAUGGGAGUGGGCCUCAGCCCGUUUC-3’ Jawaban Serine – Threonine – Threonine – Serine – Threonine – Glycine – Proline – Cysteine – Arginine – Threonine – Cycteine -







Kalau 3 ke 5



Seorang mahasiswa melakukan penelitian mengenai pembuatan vaksin rekombinan untuk TBC. Ia mengisolasi potongan gen Rv2660c dari Mycobacterium tuberculosis. Urutan DNA yang diperoleh : CCCCCGTACGTTATGCACCACCACCATCATCATGCAGGTCAATCGTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTTTCACTAAGAAT TC 1. Buat desain primer untuk dapat mengamplifikasi semua urutan gen tersebut! 2. Bagaimana urutan mRNA dari gen Rv2660c? mRNA: 5’CCCCCGUACGUUAUGCACCACCACCAUCAUCAUGCAGGUCAAUCGUGGUGCGCGAUACUGGGAUUGAACCAGU UUCACUAAGAAUUC-3’ 3. Tuliskan urutan asam amino yang disintesis pada proses translasi! 5’CCC.CCG.UAC.GUU.AUG.CAC.CAC.CAC.CAU.CAU.CAU.GCA.GGU.CAA.UCG.UGG.UGC.GCG.AUA.CUG.GGA.U UG.AAC.CAG.UUU.CAC.UAA.GAA.UUC-3’



Jawaban: Methionine/START – Histidine – Histidine – Histidine – Histidine – Histidine – Histidine – Alanine – Glycine – Glutamine – Serine – Tryptophan – Cystein – Alanine – Isoluecine – Leucine – Glycine – Leusine – Asparagine – Glutamine – Phenylalanine – Histidine - STOP



Methionine (Start)-Threonine-Tyrosine-Tyrosine-Alanine-Aspartic Acid-Serine-Valine-Lysine-GlycineArginine-Phenylalanine-Threonine-Isoleucine-Serine-Glutamine-Aspartic Acid-Asparagine-Alanine-Lysine-



Lysine-Threonine-Leucine-Tyrosine-Leucine-Glutamine-Methionine-Asparagine-Serine-Leucine-LysineProline-Glutamic Acid-Aspartic Acid-Threonine-Glycine-Methionine-Tyrosine-Arginine-Cysteine-AlanineSerine-Threonine-Arginine-Phenylalanine-Alanine-Glycine-Arginine-Leucine-Valine-Serine-Stop



AUG-ACC-UAU-UAU-GCA-GAU-AGC-GUU-AAA-GGU-CGU-UUU-ACC-AUU-AGC-CAG-GAUAAU-GCA-AAA-AAA-ACC-CUG-UAU-CUG-CAG-AUG-AAU-AGC-CUG-AAA-CCG-GAA-GAUACC-GGU-AUG-UAU-CGU-UGU-GCA-AGC-ACC-CGU-UUU-GCA-GGU-CGG-UUG-GUA-UCGUGA-UAG-CGA-AUA-UCG-UGC-AUG-GGG-UCA-GGG-UAC-CCA-GGU-UAC-CGU-UAG-CAGC3’