Epidemiologi Molecular [PDF]

Citation preview

Epidemiologi Molekular Pendahuluan Epidemiologi molekuler adalah divisi kedokteran yang mengintegrasikan metode laboratorium inovatif ke dalam epidemiologi untuk mengenali etiologi penyakit dan memfasilitasi intervensi. Ini secara progresif digunakan untuk menjelaskan interaksi antara faktor genetik, lingkungan dan lainnya, dan untuk mengidentifikasi populasi dan individu yang rentan.1 Epidemiologi molekuler menekankan peran masing-masing faktor genetika dan lingkungan yang mempengaruhi proses penyakit pada tingkat molekuler. Bidang ini terdiri dari biologi molekuler dan epidemiologi dasar dan dengan deteksi dan pengenalan jalur molekuler dan gen spesifik yang berperan dalam risiko penyakit, membantu kita memahami patogenesis penyakit.1



Sejarah Epidemiologi Kata “Epidemiologi Molekuler” untuk pertama kali dikenalkan oleh Kilbeurne pada tahun 1973 dalam artikel “Epidemiologi Molekuler Influenza”. Kata tersebut menjadi lebih formal dengan persiapan buku pertama tentang Epidemiologi Molekuler: "prinsip dan praktik" oleh Schulte dan Perera. Buku ini membahas tentang dampak kemajuan dalam penelitian molekuler dan memungkinkan pengukuran dan penjelasan biomarker sebagai alat vital untuk menghubungkan strategi penelitian tradisional dan epidemiologi, dan juga untuk memahami mekanisme molekuler mendasar dari penyakit dalam populasi.1



Epidemiologi Molekular Epidemiologi



molekuler



termasuk



dalam



setiap



studi



epidemiologi



yang



menggunakan alat khusus untuk mempelajari beberapa faktor biologis seperti profil protein, metabolit atau, bahkan gen baru pada beberapa pasien. Ilmu ini memfasilitasi deteksi etiologi penyakit (khususnya penyakit kronis), pengenalan determinan penyakit, pencegahan timbulnya penyakit dan perbaikan kondisi kesehatan di tingkat masyarakat. Epidemiologi molekuler membantu perolehan informasi tentang penyakit dan dalam studi semacam itu,



dengan evaluasi biomarker dan alat genetik untuk faktor keturunan dan yang didapat, kasuskasus yang ambigu akan diklarifikasi.1 Epidemiologi molekuler terutama berfokus pada kontribusi faktor risiko genetik dan lingkungan serta interaksi antara faktor-faktor tersebut pada tahap molekuler atau seluler. Pengurutan DNA manusia yang lengkap sebagai produk utama Proyek Genom Manusia merupakan terobosan di bidang ini. Selain itu, kemajuan terbaru dalam genotipe dan pengembangan teknologi mutakhir yang mengevaluasi DNA, RNA, Protein atau komponen metabolisme seseorang, telah memberikan dasar untuk memeriksa secara lebih komprehensif sebagian besar variasi biologis yang mungkin terkait dengan faktor risiko dan perjalanan penyakit.1 Bagaimanapun, teknologi tinggi telah memperluas pemahaman kita tentang genotipe fenotipe penyakit dan membantu untuk mencari biomarker penyakit dan menggunakannya untuk mengenali mekanisme dasar penyakit dalam populasi. Pendekatan ini akan membantu praktisi klinis untuk menyesuaikan pengobatan secara individual.



Epidemiologi molekuler dan penyakit infeksi/menular Secara umum, epidemiologi penyakit menular berkaitan dengan secara deskriptif dan kuantitatif yang mencirikan masalah-masalah berikut: 1) kejadian dan penyebaran penyakit pada waktu dan tempat; 2) reservoir agen infeksi; 3) cara dan pola penularan penyakit; 4) pengaturan penularan penyakit; 5) faktor biologis terkait patogen yang mempengaruhi penularan; 6) faktor yang berhubungan dengan inang (demografi, perilaku, klinis, genetik, mikrobiota) yang mempengaruhi penularan; 7) faktor lingkungan (sosial ekonomi, antropologi, ekologi) yang mempengaruhi penularan, dan 8) menetapkan peran etiologi mikroba untuk penyakit yang baru dikenali atau penyakit yang sebelumnya tidak diketahui terkait dengan agen infeksi. Teknik mikrobiologi molekuler telah diterapkan untuk menangani masing-masing bidang investigasi ini untuk berbagai macam penyakit menular, dan investigasi semacam itu akan diklasifikasikan sebagai studi epidemiologi molekuler.2 Studi epidemiologi molekuler diperlukan untuk mengkonfirmasi peran penyebab dari kandidat patogen pada penyakit tertentu. Sehubungan dengan hal tersebut, biasanya dilakukan studi kasus kontrol terlebih dahulu, termasuk kasus-kasus yang ada dan kontrolnya



tidak memiliki gejala penyakit. Tujuannya adalah untuk melihat apakah patogen tertentu ada dalam kasus, dan tidak ada dalam kontrol atau tidak. Telah dicatat bahwa sebagian besar patogen tidak dapat dideteksi dengan teknik berbasis budaya tradisional, oleh karena itu, penelitian berbasis budaya di area ini mungkin tidak mendeteksi agen penyebab dalam kasus (pasien), dan mungkin memberikan informasi yang menyesatkan tentang penyebab pastinya penyakit menular. Namun, teknik molekuler tingkat lanjut telah memberikan kesempatan untuk mendeteksi jumlah jejak materi genetik dari suatu patogen dalam berbagai spesimen dengan sensitivitas yang jauh melampaui metode berbasis kultur.3 Di sini, patogen yang materi genetiknya terdeteksi dalam spesimen kasus tetapi tidak dalam spesimen kontrol menjadi calon agen penyebab penyakit yang diinginkan. Setelah langkah ini, perlu dipastikan apakah patogen memang menyebabkan penyakit atau tidak. Untuk mencapai tujuan ini, kita perlu melihat apakah infeksi patogen mendahului timbulnya penyakit. Hipotesis ini dapat diperiksa secara efisien dalam studi kohort atau studi kasus kontrol bersarang. Studi kasus dunia nyata mungkin dapat menggambarkan prosesnya dengan lebih baik.3



Daftar Pustaka 1. Honardoost M, Rajabpour A, Vakil L. Molecular epidemiology; New but impressive. Med J Islam Repub Iran. 2018; 32:53. 2. Riley LW, Blanton R. Advances in Molecular Epidemiology of Infectious Diseases: definitions, approaches, and scope of the field. Microbiol Spectr. 2018 November ; 6(6). 3. Eybpoosh S, Haghdoost AA, Mostafavi E, et al. Molecular epidemiology of infectious diseases. Electronic Physician. August 2017, Volume: 9, Issue: 8.