Laporan Resmi Ncbi Kelompok 1a [PDF]

Citation preview

LAPORAN PRAKTIKUM BIOTEKNOLOGI FARMASI “IDENTIFIKASI GEN DALAM KROMOSOM GENOMIK & PROTEOMIK NCBI” Pertemuan Ke-5 Sabtu, 23 Oktober 2021



DOSEN PENGAMPU : 1. DESI PURWANINGSIH 2. DESTIK WULANDARI Kelompok :1 Penyusun : 1. AFRINA FAJAR EOWATI



(02216404A)



2. ALDI ASDIRA



(02216394A)



3. ANJELI AMALIA



(02216427A)



4. ASADDAH DWI MULYANI



(02216418A)



PROGRAM STUDIS1 FARMASI FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS SETIA BUDI SURAKARTA



2021



BAB I PENDAHULUAN NCBI merupakan server yang memuat data base tentang informasi kesehatan dan bioteknologi. Data base terus menerus di update sesuai dengan penemuan-penemuan terkini yang menyangkut DNA, Protein, Senyawa aktif dan taksonomi. Disamping data base, ncbi juga menyediakan berbagai macam software untuk analisis DNA, protein 3D, pencarian primer, pencarian conserve doamain dan lain sebagainya. NCBI merupakan salah satu bank data gen, protein dan literature khususnya dibidang kesehatan yang terlengkap dan dipacu oleh para peneliti didunia. National Center for Biotechnology Information (NCBI, Pusat Nasional Informasi Bioteknologi) adalah bagian dari United States National Library of Medicine (NLM), sebuah cabang dari National Institutes of Health (NIH). NCBI terletak di Bethesda, Maryland dan didirikan pada tahun 1988 melalui undang-undang yang disponsori oleh Senator Claude Pepper. NCBI menyimpan serangkaian basis data yang relevan untuk bioteknologi dan biomedis dan merupakan sumber penting bagi alat-alat dan layanan bioinformatika. Database utama seperti GenBank untuk urutan DNA dan PubMed, database bibliografi untuk literatur biomedis. Database lainnya termasuk database NCBI Epigenomics. Semua database tersebut tersedia secara online melalui mesin pencari Entrez. NCBI dipimpin oleh David Lipman, salah satu penulis asli dari program penyelarasan urutan BLAST dan banyak tokoh yang dihormati dalam bioinformatika. Ia juga memimpin sebuah program penelitian intramural, termasuk kelompokkelompok yang dipimpin oleh Stephen Altschul (pembuat dari BLAST yang lain), David Landsman, Eugene Koonin (penulis produktif di genomika perbandingan), John Wilbur, Teresa Przytycka, dan Zhiyong Lu. David Lipman mundur dari jabatannya pada Mei 2017. NCBI terdaftar di Registry of Research Data Repositories re3data.org. RUMUSAN MASALAH 1. Bagaimana cara mengakses NCBI? TUJUAN Tujuan praktikum ini adalah untuk mengetahui cara dalam mengakses NCBI.



BAB II DATA HASIL BAB III PEMBAHASAN Cara Mengakses NCBI 1) Langkah Pertama, Buka browser lalu cari NCBI cara kolom pencarian



2) Lalu klik website paling atas



3) Lalu klik kolom pencarian sesuai dengan gen yang ingin diketahui



4) Lalu klik “All Database” disamping kolom pencarian, lalu pilih “Nucleotide”



5) Jika sudah muncul pada layar, pilihkan gen yang terdapat tulisan “Complete” agar rantai gen yang diinginkan beserta datanya lengkap yang didapatkan



6) Lalu akan muncul seperti gambar dibawah, seperti yang dapat dilihat pada gambar bahwa data yang muncul lengkap, terdapat versi gennya, aksesnya danlain sebagainya.



7) Jika ingin melihat dan menyimpan data rantai gen, klik “FASTA” dipojok kiri dibawah judul atau nama gen, maka akan muncul sseperti ini



8) Lalu blok semua rantai gen dari awal hingga akhir, klik Kanan pada kursor atau mouse, pilih “Copy”



9) Lalu klik star windows pada pojok kiri layar PC, cari Notepad dan klik



10) Lalu akan muncul layar putih kecil sseperti digambar, lalu klik kanan pada kursor atau mouse pilih “Paste”



11) Lalu akan muncul seperti digambar



12) Jika ingin menyimpan data pada PC, klik “File” pada pojok kiri layar, lalu pilih “Save As”



13) Lalu beri nama file sesuai keinginan, lalu klik “Save”. File akan tersimpan di Pc.



BAB IV KESIMPULAN Dari praktikum diatas dapat disimpulkan bahwa: NCBI merupakan server yang memuat data base tentang informasi kesehatan dan bioteknologi. Data base terus menerus di update sesuai dengan penemuan-penemuan terkini yang menyangkut DNA, Protein, Senyawa aktif dan taksonomi. NCBI dapat diakses baik lewat PC atau Android dan IOS. Sehingga NCBI merupakan salah satu teknologi yang memudahkan dalam mengakses mengenai kesehetan dan bioteknologi.



DAFTAR PUSTAKA Arif.



2013.



SebuahKontemplasiDibalik



DNA



Mitokondria



(Online)



http://arif-



nma.com/2013/07/26/sebuah-kontemplasi-dibalik-dna-mitokondria. Arsal A F. 2018. Genetika I. ArifMemahamiKehidupan. Makassar: Badan PenerbitUniversitas Negeri Makassar. Cahyono F. 2011. KombinatorialdalamHukumPewarisan Mendel. JurnalSistem dan TeknologiInformasi 12(1):32-39. Campbell N. A, Reece J.B, Urry L.A, Cain M.L, Wasserman S.A, Minorsky P.V, Jackson R.B. 2010. BiologiEdisi 8 Jilid 1. Terjemahan: DamaringTyasWulandari. Jakarta: Erlangga. Corebima, AD. 2004. GenetikaKelamin. Surabaya: Airlangga University Press. Elrod S. Stansfield W.D. 2007. Schaum's Outlines GenetikaEdisiKeempat. Terjemahan: DamaringTyasWulandari. Jakarta: Erlangga. Santoso J.2018. Pengembangan Mock-Up Mitosis & Meiosis Menggunakan “Lego Miniset” sebagaiPendukungPembelajaranBiologiUmum di UIN Walisongo Semarang. [SKRIPSI] Semarang: FakultasSains dan Teknologi Prodi BiologiUniversitas Islam Negeri Walisongo. Reece, J. B. et al. 2017. Campbell Biology. 11th edn, Campbell Biology. 11th edn. New York: Pearson. doi: 10.1007/s13398-014-0173-7.2. Pierce, B. A. 2016. Genetiks Essentials Concepts and Connections. 3rd edn. New York: W.H Freeman & Company. Irnaningtyas, 2018. BiologiKromosom&Genetika. Jakarta: PenerbitErlangga. Saturti, T.I., 2018. Genetika. Fak. KedokteranUniversitasUdayana. Denpasar. "National Library of Medicine Announces Departure of NCBI Director Dr. David Lipman". www.nlm.nih.gov. Diakses tanggal 2017-05-06. "NCBI Entry in re3data.org". www.re3data.org. Diakses tanggal 21 August 2014.



LAMPIRAN Lampiran. Hasil basadari NCBI 1. SindromDown



2. Gen Ensefalitis



3. Protein Cytrohrome B, Partial Mitochondrion



4. Gen Insomnia