Parameter Genetik REPITABILITAS 10 [PDF]

Citation preview

Prof.Rr.SRI RACHMA A.B., M.Sc., Ph.D



Parameter genetik (Genetic parameter) Digunakan dalam : ❑ Seleksi ❑ Pendugaan nilai pemuliaan (“breeding value”)



❖KORELASI GENETIK genetic correlation (rg) ❖HERITABILITAS heritability (h2) ❖REPITABILITAS repitability (r)



REPEAT ( pengulangan)



ABILITY (kemampuan)



Korelasi dari sifat yang berulang Sifat yang memiliki nilai heritabilitas tinggi biasanya akan tinggi juga nilai repitabilitasnya



Pengukuran kesamaan antara suatu sifat yang diukur berkali-kali pada ternak yang sama selama ternak tersebut hidup Bagian dari ragam total suatu populasi yang disebabkan oleh perbedaan antar individu yang bersifat permanen Korelasi fenotip antara performans sekarang dengan performans di masa mendatang pada satu individu



Memperkirakan produktifitas pada masa mendatang dari ternak yang telah mempunyai satu / lebih catatan produksi Menduga kemampuan produksi dalam masa produktif MPPA Menduga nilai maksimum yang dapat dicapai heritabilitas (dihitung dari rata-rata beberapa kali pengukuran) r  h2 Peningkatan ketepatan seleksi



Milk production Fleece weight Litter size Egg production Wool production



Genetik



Lingkungan



Produksi



 ｇ2



ep 2



Tetap



Tetap



G



E1



E2



………….



En



P1



P2



………….



Pn



r



et 2



Berubah



r=



σ2



2 σ L G+ σ2PP



◼ Nilai repitabilitas selalu lebih besar atau sama dengan nilai heritabilitas



Nilai Repitabilitas Beberapa Sifat pada Beberapa Ternak Jenis Ternak Sapi Perah Sapi Daging



Domba



Sifat Produksi Susu Persentase lemak susu Berat lahir Berat sapih Berat panen Berat lahir Berat wol Ovulation Rate



Nilai Repitabilitas 0.40-0.60 0.40-0.70 0.20-0.30 0.30-0.55 0.25 0.30-0.40 0.30-0.40 0.60-0.80



r=



2 σ



r=



2 σ LP G+ σ2 P 2L = 2LP + 2LT



2a + 2d + 2i + 2LP 2a + 2d + 2i + 2LP + 2LT



Heritabilitas vs Repitabilitas Kemiripan catatan: Populasi



Catatan Anak



Heritabilitas



h2



Individu Sama, Catatan Berulang selama hidup



Repitabilitas (r)



Perbedaan h2



r



Penurunan



Pengulangan



2  g h2 = 2 p



Nilai: 0 - 1



 g2 +  ep2 r=  p2 Nilai: 0-1 : r ≥ h2



Nilai berkisar 0 - 1 Nilainya tidak tetap (variasi : waktu & populasi) Lingkungan Ternak



Unggul di awal produksi (sifat yang r-nya tinggi)



“Unggul “ pula pada produksi selanjutnya



Guna menghitung repitabilitas Untuk memprediksi kemampuan menghasilkan produksi Untuk memprediksi produksi individu pada masa selanjutnya berdasarkan data produksi sekarang dan data produksi lampau



rendah



r



Akurasi prediksi produksi selanjutnya : tinggi tinggi Akurasi prediksi produksi selanjutnya : rendah



Bila nilai repitabilitas TINGGI Tindakan meng “culling” ternak berdasarkan rekor pertama akan efektif untuk meningkatkan performans populasi kelompok



Turunan/anakan/offspring dari individu yang superior dalam populasi sebaiknya disiapkan untuk menjadi ternak pengganti/replacement



stock



Cara mengukur Repitabilitas 1. Mengukur kekuatan hubungan diantara sifat berulang Repitabilitas dapat diduga berdasarkan korelasi antara sifat yang berulang pada ternak yang sama 2. Kekuatan hubungan antara data penampilan dengan kemampuan memproduksi (sebagai efek permanen) Repitabilitas dapat diartikan sebagai regresi dari PA terhadap fenotip



Repitabilitas



Batas atas (=nilai maksimum) dari heritabilitas



Dipengaruhi oleh besarnya nilai h2 pada sifat yang sama



Nilai h2 tinggi



nilai r tinggi



Untuk sifat yang berulang, efek lingkungan dapat dibedakan menjadi :



Efek lingkungan yang bersifat permanent/tetap (LP) Efek lingkungan yang bersifat temporary/ berubah (LP)



Efek lingkungan permanent Faktor/efek lingkungan yang secara tetap mempengaruhi performans ternak Faktor tersebut mempengaruhi penampilan/ performans ternak pada ternak yang sama dan dengan cara yang sama ❑ Nutrisi pada saat awal pertumbuhan akan mempengaruhi kemampuan induk sapi saat memperoduksi air susu ❑ Problem/kondisi kerusakan pada ambing induk (misal : karena penyakit mastitis) akan mempengaruhi produksi air susu seumur hidup induk tersebut



Efek lingkungan temporary Faktor/efek lingkungan yang tidak secara tetap mempengaruhi performans ternak Faktor tersebut mempengaruhi penampilan/ performans ternak secara berbeda setiap musim dan tahun sehingga tidak berpengaruhi penampilan ternak dengan cara yang sama ❑ ❑ ❑ ❑



Faktor pakan Kondisi cuaca Perbedaan sistem manajemen pemeliharaan dll



Cara menghitung repitabilitas •ANOVA (analisis variansi pola searah) • KORELASI antar kelas (data = 2) (Interclass correlation)



• KORELASI dalam kelas (data >2) (Intraclass correlation) * Regresi (Pengamatan terakhir dengan pengamatan sebelumnya)



Menduga nilai repitabilitas sifat dari sekelompok individu dimana setiap individu hanya memiliki 2 catatan penampilan Misal : data set untuk Laktasi 1 dan laktasi 2



ANALISIS KORELASI



r=



Σ (X – X) ( Y – Y) / (n-1) 2 Σ (X – X) /(n-1)



2



Σ (Y – Y) /(n-1)



atau r=



Σ XY – (Σ X . Σ Y) / n 2 2 2 2 ΣX - (ΣX) /n) ΣY - (ΣY) /n)



atau



r=



Σ xy (Σ



2 x )(Σ



2 y)



Domba Ke 1 2 3 4 5



Cukur I (X) 4,0 3,9 3,9 3,7 3,6



Cukur II (Y) 4,0 4,3 4,4 3,8 3,9



XY



Hitung nilai repitabilitas dari sifat berat bulu dari 5 ekor domba Merino menggunakan data pencukuran ke-1 dan ke-2



Dom ba ke-



Cukur I (= X)



Cukur II (=Y)



1



4,0



4,0



0,18 -0,08 0,0324



2



3,9



4,3



0,08 0,22



3



3,9



4,4



4



3,7



3,8



5



3,6



3,9



x



jumlah



X = 3,82



Y = 4,08



y



x2



y2



xy



Coba hitung ya…..



Data laktasi ke-1 dan ke-2 dari induk sapi perah (digunakan untuk latihan menduga nilai repitabilitas menggunakan metode korelasi antar kelas)



Coba hitung ya…..



Hasil analisis data diperoleh r = …………… Artinya : ……… % dari ragam produksi susu sapi betina disebabkan oleh perbedaan antar individu sapi-sapi betina tersebut



Sapi Laktasi 3 (liter)



Laktasi 4 (liter)



1



12



14



2



10



9



3



13



13



4



14



15



5



11



12



Hitung nilai repitabilitas dari sifat produksi air susu 5 ekor induk menggunakan data laktasi ke-3 dan laktasi ke-4



199.9 kg 185.0 kg



19.8 kg



46.1 kg



165.2 kg



153.7 kg



Produksi ke-1 dari induk



Produksi ke-2 dari induk



r = 19.8 / 46.1 = 0.43



Menduga nilai repitabilitas sifat dari sekelompok individu dimana setiap individu memiliki lebih dari 2 catatan pengukuran/penimbangan produksi



ANALISIS SIDIK RAGAM



Materi ini dan mata kuliah ini, adalah yang terakhir saya dampingi & temani anda belajar pada mata kuliah wajib Setelah itu, kita akan bisa bertemu pada mata kuliah pilihan (untuk yang memilih MK. Ilmu Tilik Ternak, Produksi ternak Domba Kambing, MK. Aneka watwa, MK. Manajemen pembibitan Non Ruminansia) Jadi, jangan sia-siakan usaha anda selama ini Semoga hal yang pernah saya tanamkan pada anda dapat bermanfaat kelak…….